Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 MRPL3-208ENST00000510923 813 ntTSL 214.04□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 56.5
DDX3XO00571 MRPL3-205ENST00000507669 848 ntTSL 314.04□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 56.5
DDX3XO00571 MRPL3-207ENST00000510154 532 ntTSL 49.68□□□□□ -0.863e-8■■■■■ 56.5
DDX3XO00571 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.372e-11■■■■■ 56.4
DDX3XO00571 STAT1-207ENST00000424722 736 ntTSL 317.1■□□□□ 0.332e-11■■■■■ 56.4
DDX3XO00571 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.232e-11■■■■■ 56.4
DDX3XO00571 STAT1-209ENST00000452281 2594 ntTSL 1 (best)16.13■□□□□ 0.172e-11■■■■■ 56.4
DDX3XO00571 STAT1-210ENST00000454414 572 ntTSL 414.85□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 56.4
DDX3XO00571 STAT1-201ENST00000361099 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 56.4
DDX3XO00571 STAT1-212ENST00000540176 4216 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.482e-11■■■■■ 56.4
DDX3XO00571 STAT1-208ENST00000432058 567 ntTSL 411.01□□□□□ -0.652e-11■■■■■ 56.4
DDX3XO00571 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.372e-9■■■■■ 56.2
DDX3XO00571 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 56.2
DDX3XO00571 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 56.2
DDX3XO00571 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-9■■■■■ 56.2
DDX3XO00571 DHX40-210ENST00000584385 580 ntTSL 321.47■■□□□ 1.033e-11■■■■■ 56.2
DDX3XO00571 DHX40-207ENST00000580030 855 ntTSL 518.47■□□□□ 0.553e-11■■■■■ 56.2
DDX3XO00571 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.353e-11■■■■■ 56.2
DDX3XO00571 DHX40-208ENST00000580218 814 ntTSL 513.98□□□□□ -0.173e-11■■■■■ 56.2
DDX3XO00571 DHX40-205ENST00000577596 539 ntTSL 512.76□□□□□ -0.373e-11■■■■■ 56.2
DDX3XO00571 DHX40-201ENST00000251241 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.813e-11■■■■■ 56.2
DDX3XO00571 MAP3K2-202ENST00000409179 689 ntTSL 524.74■■□□□ 1.553e-10■■■■■ 56.1
DDX3XO00571 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.963e-10■■■■■ 56.1
DDX3XO00571 SLC43A1-202ENST00000524995 953 ntTSL 320.25■□□□□ 0.831e-9■■■■■ 56.1
DDX3XO00571 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.711e-9■■■■■ 56.1
DDX3XO00571 SLC43A1-208ENST00000533263 690 ntTSL 516.96■□□□□ 0.311e-9■■■■■ 56.1
DDX3XO00571 ODC1-204ENST00000446285 665 ntTSL 527.07■■□□□ 1.922e-20■■■■■ 56
DDX3XO00571 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.262e-20■■■■■ 56
DDX3XO00571 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.642e-10■■■■■ 55.9
DDX3XO00571 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.42e-10■■■■■ 55.9
DDX3XO00571 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.192e-10■■■■■ 55.9
DDX3XO00571 SYNGR3-203ENST00000563869 860 ntTSL 219.73■□□□□ 0.752e-10■■■■■ 55.9
DDX3XO00571 SYNGR3-205ENST00000568896 533 ntTSL 518.96■□□□□ 0.632e-10■■■■■ 55.9
DDX3XO00571 SYNGR3-204ENST00000564642 752 ntTSL 218.81■□□□□ 0.62e-10■■■■■ 55.9
DDX3XO00571 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.58e-9■■■■■ 55.9
DDX3XO00571 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.028e-9■■■■■ 55.9
DDX3XO00571 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.818e-9■■■■■ 55.9
DDX3XO00571 LEPROT-202ENST00000475108 492 ntTSL 321.92■■□□□ 1.15e-14■■■■■ 55.8
DDX3XO00571 LEPROT-205ENST00000497874 377 ntTSL 1 (best)16.95■□□□□ 0.35e-14■■■■■ 55.8
DDX3XO00571 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.25e-14■■■■■ 55.8
DDX3XO00571 LEPR-204ENST00000371059 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.43e-11■■■■■ 55.8
DDX3XO00571 LEPROT-204ENST00000488747 345 ntTSL 511.25□□□□□ -0.615e-14■■■■■ 55.8
DDX3XO00571 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.313e-11■■■■■ 55.8
DDX3XO00571 LEPROT-203ENST00000484243 549 ntTSL 36.28□□□□□ -1.45e-14■■■■■ 55.8
DDX3XO00571 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.883e-11■■■■■ 55.8
DDX3XO00571 C12orf57-203ENST00000538392 979 ntTSL 219.21■□□□□ 0.673e-22■■■■■ 55.8
DDX3XO00571 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-22■■■■■ 55.8
DDX3XO00571 C12orf57-202ENST00000537087 662 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.573e-22■■■■■ 55.8
DDX3XO00571 C12orf57-207ENST00000545581 556 ntTSL 39.54□□□□□ -0.883e-22■■■■■ 55.8
DDX3XO00571 C12orf57-205ENST00000542222 640 ntTSL 29.39□□□□□ -0.913e-22■■■■■ 55.8
DDX3XO00571 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.942e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 COG6-203ENST00000422759 658 ntTSL 423.93■■□□□ 1.422e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.11e-21■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 GPN3-205ENST00000547323 541 ntTSL 321.88■■□□□ 1.093e-22■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 GPN3-210ENST00000552180 640 ntTSL 320.02■□□□□ 0.83e-22■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 TMEM184A-208ENST00000441933 640 ntTSL 518.29■□□□□ 0.522e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.453e-22■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 COG6-210ENST00000543790 546 ntTSL 417.06■□□□□ 0.322e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 COG6-209ENST00000542266 528 ntTSL 415.88■□□□□ 0.132e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 GPN3-206ENST00000549963 497 ntTSL 315.53■□□□□ 0.083e-22■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 COG6-211ENST00000543804 553 ntTSL 415.21■□□□□ 0.032e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.093e-22■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.281e-21■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 PRELID3B-204ENST00000466051 612 ntTSL 213.15□□□□□ -0.31e-21■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 COG6-204ENST00000455146 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.372e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.373e-22■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 COG6-201ENST00000356576 3449 ntTSL 1 (best)11.9□□□□□ -0.52e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 GPN3-208ENST00000550974 564 ntTSL 510.62□□□□□ -0.713e-22■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 SRP9-205ENST00000626563 329 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.872e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 PRELID3B-203ENST00000463057 704 ntTSL 37.58□□□□□ -1.21e-21■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.251e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 TGFBR1-206ENST00000549021 680 ntTSL 27.02□□□□□ -1.291e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 TGFBR1-203ENST00000546584 565 ntTSL 46.6□□□□□ -1.351e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 TGFBR1-205ENST00000548365 582 ntTSL 35.34□□□□□ -1.551e-11■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.223e-24■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.193e-24■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 ERLEC1-204ENST00000494373 485 ntTSL 319.23■□□□□ 0.673e-24■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.643e-24■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.099e-7■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.059e-7■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.166e-7■■■■■ 55.7
DDX3XO00571 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.971e-13■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.891e-13■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.761e-13■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 MAD2L2-209ENST00000456915 1032 ntTSL 222.26■■□□□ 1.151e-13■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.121e-13■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 MAD2L2-208ENST00000445656 678 ntTSL 321.5■■□□□ 1.031e-13■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 MAD2L2-203ENST00000376664 858 ntTSL 221.5■■□□□ 1.031e-13■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 MAD2L2-202ENST00000376655 1095 ntTSL 219.55■□□□□ 0.721e-13■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -01e-13■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.813e-19■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.112e-11■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 YIPF2-203ENST00000586575 932 ntTSL 520.37■□□□□ 0.852e-11■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.612e-11■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.582e-11■■■■■ 55.6
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