RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552180.5

GPN3-210, Transcript of GPN-loop GTPase 3, humanhuman

TSL 3

Gene GPN3, Length 640 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3-210ENST00000552180 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.45■■■■■ 5.19
GPN3-210ENST00000552180 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.17■■■■■ 4.34
GPN3-210ENST00000552180 ABCC9O60706 1549 aa41.41■■■■■ 4.22
GPN3-210ENST00000552180 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.76■■■■□ 3.95
GPN3-210ENST00000552180 NACADO15069 1562 aa39.7■■■■□ 3.95
GPN3-210ENST00000552180 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.65■■■■□ 3.94
GPN3-210ENST00000552180 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
GPN3-210ENST00000552180 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.47■■■■□ 3.91
GPN3-210ENST00000552180 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.25■■■■□ 3.87
GPN3-210ENST00000552180 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.87■■■■□ 3.81
GPN3-210ENST00000552180 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.71■■■■□ 3.79
GPN3-210ENST00000552180 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.63■■■■□ 3.77
GPN3-210ENST00000552180 SCRIBQ14160 1630 aa38.46■■■■□ 3.75
GPN3-210ENST00000552180 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.24■■■■□ 3.71
GPN3-210ENST00000552180 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.15■■■■□ 3.7
GPN3-210ENST00000552180 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
GPN3-210ENST00000552180 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.45■■■■□ 3.59
GPN3-210ENST00000552180 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.22■■■■□ 3.55
GPN3-210ENST00000552180 SMARCA4P51532 1647 aa36.81■■■■□ 3.48
GPN3-210ENST00000552180 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
GPN3-210ENST00000552180 NCAPD3P42695 1498 aa36.69■■■■□ 3.46
GPN3-210ENST00000552180 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.68■■■■□ 3.46
GPN3-210ENST00000552180 SMARCA2P51531 1590 aa36.57■■■■□ 3.45
GPN3-210ENST00000552180 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.57■■■■□ 3.45
GPN3-210ENST00000552180 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.49■■■■□ 3.43
GPN3-210ENST00000552180 HMGXB3Q12766 1538 aa36.44■■■■□ 3.42
GPN3-210ENST00000552180 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
GPN3-210ENST00000552180 WIZO95785 1651 aa36.14■■■■□ 3.38
GPN3-210ENST00000552180 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
GPN3-210ENST00000552180 NESP48681 1621 aa35.83■■■■□ 3.33
GPN3-210ENST00000552180 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
GPN3-210ENST00000552180 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.68■■■■□ 3.3
GPN3-210ENST00000552180 ERCC6Q03468 1493 aa35.64■■■■□ 3.3
GPN3-210ENST00000552180 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.6■■■■□ 3.29
GPN3-210ENST00000552180 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.46■■■■□ 3.27
GPN3-210ENST00000552180 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.37■■■■□ 3.25
GPN3-210ENST00000552180 CFTRP13569 1480 aa35.36■■■■□ 3.25
GPN3-210ENST00000552180 CUX2O14529 1486 aa35.35■■■■□ 3.25
GPN3-210ENST00000552180 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.34■■■■□ 3.25
GPN3-210ENST00000552180 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
GPN3-210ENST00000552180 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.16■■■■□ 3.22
GPN3-210ENST00000552180 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.1■■■■□ 3.21
GPN3-210ENST00000552180 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.09■■■■□ 3.21
GPN3-210ENST00000552180 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
GPN3-210ENST00000552180 PRDM2Q13029 1718 aa34.99■■■■□ 3.19
GPN3-210ENST00000552180 WDR62O43379 1518 aa34.98■■■■□ 3.19
GPN3-210ENST00000552180 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
GPN3-210ENST00000552180 TOPBP1Q92547 1522 aa34.6■■■■□ 3.13
GPN3-210ENST00000552180 ABCC8Q09428 1581 aa34.57■■■■□ 3.12
GPN3-210ENST00000552180 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.52■■■■□ 3.12
GPN3-210ENST00000552180 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.49■■■■□ 3.11
GPN3-210ENST00000552180 IFT140Q96RY7 1462 aa34.39■■■■□ 3.1
GPN3-210ENST00000552180 CUX1P39880 1505 aa34.3■■■■□ 3.08
GPN3-210ENST00000552180 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
GPN3-210ENST00000552180 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
GPN3-210ENST00000552180 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
GPN3-210ENST00000552180 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.19■■■■□ 3.06
GPN3-210ENST00000552180 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.16■■■■□ 3.06
GPN3-210ENST00000552180 SOGA1O94964 1423 aa34.16■■■■□ 3.06
GPN3-210ENST00000552180 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
GPN3-210ENST00000552180 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.07■■■■□ 3.05
GPN3-210ENST00000552180 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.02■■■■□ 3.04
GPN3-210ENST00000552180 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
GPN3-210ENST00000552180 TOP2BQ02880 1626 aa33.96■■■■□ 3.03
GPN3-210ENST00000552180 SYNJ1O43426 1573 aa33.95■■■■□ 3.03
GPN3-210ENST00000552180 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.94■■■■□ 3.02
GPN3-210ENST00000552180 WDR97A6NE52 1622 aa33.91■■■■□ 3.02
GPN3-210ENST00000552180 OSCARQ8IYS5 282 aa33.91■■■■□ 3.02
GPN3-210ENST00000552180 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.86■■■■□ 3.01
GPN3-210ENST00000552180 GRIN2BQ13224 1484 aa33.76■■■□□ 2.99
GPN3-210ENST00000552180 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.75■■■□□ 2.99
GPN3-210ENST00000552180 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.72■■■□□ 2.99
GPN3-210ENST00000552180 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.72■■■□□ 2.99
GPN3-210ENST00000552180 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
GPN3-210ENST00000552180 CHD1O14646 1710 aa33.67■■■□□ 2.98
GPN3-210ENST00000552180 FBLN2P98095 1184 aa33.64■■■□□ 2.98
GPN3-210ENST00000552180 PBRM1Q86U86 1689 aa33.63■■■□□ 2.97
GPN3-210ENST00000552180 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
GPN3-210ENST00000552180 SYNJ2O15056 1496 aa33.55■■■□□ 2.96
GPN3-210ENST00000552180 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.44■■■□□ 2.94
GPN3-210ENST00000552180 ADAMTS12P58397 1594 aa33.38■■■□□ 2.93
GPN3-210ENST00000552180 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.36■■■□□ 2.93
GPN3-210ENST00000552180 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.35■■■□□ 2.93
GPN3-210ENST00000552180 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.34■■■□□ 2.93
GPN3-210ENST00000552180 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.34■■■□□ 2.93
GPN3-210ENST00000552180 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.34■■■□□ 2.93
GPN3-210ENST00000552180 ARHGEF11O15085 1522 aa33.33■■■□□ 2.93
GPN3-210ENST00000552180 GRIN2AQ12879 1464 aa33.32■■■□□ 2.92
GPN3-210ENST00000552180 KIF27Q86VH2 1401 aa33.3■■■□□ 2.92
GPN3-210ENST00000552180 IGF1RP08069 1367 aa33.27■■■□□ 2.92
GPN3-210ENST00000552180 TRIM41Q8WV44 630 aa33.22■■■□□ 2.91
GPN3-210ENST00000552180 NUP160Q12769 1436 aa33.2■■■□□ 2.91
GPN3-210ENST00000552180 CEP170Q5SW79 1584 aa33.17■■■□□ 2.9
GPN3-210ENST00000552180 CUL7Q14999 1698 aa33.07■■■□□ 2.89
GPN3-210ENST00000552180 ARAP1Q96P48 1450 aa33.07■■■□□ 2.88
GPN3-210ENST00000552180 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.05■■■□□ 2.88
GPN3-210ENST00000552180 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.04■■■□□ 2.88
GPN3-210ENST00000552180 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.02■■■□□ 2.88
GPN3-210ENST00000552180 SHROOM2Q13796 1616 aa32.95■■■□□ 2.87
GPN3-210ENST00000552180 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.91■■■□□ 2.86
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