RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.8■■■■□ 3.96
ODC1-201ENST00000234111 HRCP23327 699 aa36.11■■■■□ 3.37
ODC1-201ENST00000234111 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.44■■■■□ 3.26
ODC1-201ENST00000234111 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
ODC1-201ENST00000234111 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
ODC1-201ENST00000234111 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.31■■■■□ 3.24
ODC1-201ENST00000234111 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.16■■■■□ 3.22
ODC1-201ENST00000234111 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
ODC1-201ENST00000234111 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.84■■■■□ 3.17
ODC1-201ENST00000234111 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.4■■■■□ 3.1
ODC1-201ENST00000234111 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
ODC1-201ENST00000234111 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
ODC1-201ENST00000234111 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.07■■■■□ 3.04
ODC1-201ENST00000234111 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.04■■■■□ 3.04
ODC1-201ENST00000234111 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
ODC1-201ENST00000234111 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
ODC1-201ENST00000234111 MYT1Q01538 1121 aa33.6■■■□□ 2.97
ODC1-201ENST00000234111 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.43■■■□□ 2.94
ODC1-201ENST00000234111 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
ODC1-201ENST00000234111 NEUROD1Q13562 356 aa33.27■■■□□ 2.92
ODC1-201ENST00000234111 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa33.1■■■□□ 2.89
ODC1-201ENST00000234111 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
ODC1-201ENST00000234111 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
ODC1-201ENST00000234111 ABCC9O60706 1549 aa32.7■■■□□ 2.83
ODC1-201ENST00000234111 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
ODC1-201ENST00000234111 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
ODC1-201ENST00000234111 TRIM41Q8WV44 630 aa32.64■■■□□ 2.82
ODC1-201ENST00000234111 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
ODC1-201ENST00000234111 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.59■■■□□ 2.81
ODC1-201ENST00000234111 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
ODC1-201ENST00000234111 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
ODC1-201ENST00000234111 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.08■■■□□ 2.73
ODC1-201ENST00000234111 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
ODC1-201ENST00000234111 SCRIBQ14160 1630 aa31.93■■■□□ 2.7
ODC1-201ENST00000234111 MIER1Q8N108 512 aa31.87■■■□□ 2.69
ODC1-201ENST00000234111 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
ODC1-201ENST00000234111 NACADO15069 1562 aa31.77■■■□□ 2.68
ODC1-201ENST00000234111 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.56■■■□□ 2.64
ODC1-201ENST00000234111 BCL11AQ9H165 835 aa31.54■■■□□ 2.64
ODC1-201ENST00000234111 ANP32EQ9BTT0 268 aa31.49■■■□□ 2.63
ODC1-201ENST00000234111 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
ODC1-201ENST00000234111 CEP162Q5TB80 1403 aa31.38■■■□□ 2.61
ODC1-201ENST00000234111 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa31.38■■■□□ 2.61
ODC1-201ENST00000234111 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.33■■■□□ 2.61
ODC1-201ENST00000234111 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.19■■■□□ 2.58
ODC1-201ENST00000234111 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
ODC1-201ENST00000234111 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.18■■■□□ 2.58
ODC1-201ENST00000234111 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.15■■■□□ 2.58
ODC1-201ENST00000234111 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.14■■■□□ 2.58
ODC1-201ENST00000234111 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.11■■■□□ 2.57
ODC1-201ENST00000234111 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
ODC1-201ENST00000234111 WIZO95785 1651 aa31.07■■■□□ 2.56
ODC1-201ENST00000234111 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.04■■■□□ 2.56
ODC1-201ENST00000234111 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.03■■■□□ 2.56
ODC1-201ENST00000234111 ABCC8Q09428 1581 aa30.98■■■□□ 2.55
ODC1-201ENST00000234111 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
ODC1-201ENST00000234111 SOGA1O94964 1423 aa30.95■■■□□ 2.55
ODC1-201ENST00000234111 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
ODC1-201ENST00000234111 BCANQ96GW7 911 aa30.81■■■□□ 2.52
ODC1-201ENST00000234111 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.76■■■□□ 2.51
ODC1-201ENST00000234111 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.74■■■□□ 2.51
ODC1-201ENST00000234111 GOLGA3Q08378 1498 aa30.7■■■□□ 2.51
ODC1-201ENST00000234111 EEA1Q15075 1411 aa30.68■■■□□ 2.5
ODC1-201ENST00000234111 KCNH8Q96L42 1107 aa30.62■■■□□ 2.49
ODC1-201ENST00000234111 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
ODC1-201ENST00000234111 FKBP8Q14318 412 aa30.6■■■□□ 2.49
ODC1-201ENST00000234111 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
ODC1-201ENST00000234111 CLIP1P30622 1438 aa30.49■■■□□ 2.47
ODC1-201ENST00000234111 APLP2Q06481 763 aa30.48■■■□□ 2.47
ODC1-201ENST00000234111 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.48■■■□□ 2.47
ODC1-201ENST00000234111 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
ODC1-201ENST00000234111 MSH5O43196 834 aa30.39■■■□□ 2.45
ODC1-201ENST00000234111 SMARCA4P51532 1647 aa30.38■■■□□ 2.45
ODC1-201ENST00000234111 SMARCA2P51531 1590 aa30.37■■■□□ 2.45
ODC1-201ENST00000234111 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.36■■■□□ 2.45
ODC1-201ENST00000234111 ITGAEP38570 1179 aa30.34■■■□□ 2.45
ODC1-201ENST00000234111 NEFLP07196 543 aa30.3■■■□□ 2.44
ODC1-201ENST00000234111 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
ODC1-201ENST00000234111 KIF21BO75037 1637 aa30.25■■■□□ 2.43
ODC1-201ENST00000234111 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
ODC1-201ENST00000234111 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
ODC1-201ENST00000234111 TRIM52Q96A61 297 aa30.09■■■□□ 2.41
ODC1-201ENST00000234111 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.08■■■□□ 2.41
ODC1-201ENST00000234111 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
ODC1-201ENST00000234111 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.07■■■□□ 2.4
ODC1-201ENST00000234111 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.06■■■□□ 2.4
ODC1-201ENST00000234111 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
ODC1-201ENST00000234111 SYNJ1O43426 1573 aa29.97■■■□□ 2.39
ODC1-201ENST00000234111 CUX2O14529 1486 aa29.95■■■□□ 2.39
ODC1-201ENST00000234111 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
ODC1-201ENST00000234111 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
ODC1-201ENST00000234111 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.9■■■□□ 2.38
ODC1-201ENST00000234111 MAPKBP1O60336 1514 aa29.87■■■□□ 2.37
ODC1-201ENST00000234111 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
ODC1-201ENST00000234111 DEKP35659 375 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
ODC1-201ENST00000234111 CCER2I3L3R5 266 aa29.85■■■□□ 2.37
ODC1-201ENST00000234111 WDR97A6NE52 1622 aa29.82■■■□□ 2.36
ODC1-201ENST00000234111 ARAP1Q96P48 1450 aa29.82■■■□□ 2.36
ODC1-201ENST00000234111 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.81■■■□□ 2.36
ODC1-201ENST00000234111 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms