Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 226.16■■□□□ 1.789e-9■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.619e-9■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 KRI1-214ENST00000612875 2608 ntTSL 221.06■□□□□ 0.963e-13■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 KRI1-203ENST00000478863 2545 ntTSL 218.8■□□□□ 0.63e-13■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 KRI1-202ENST00000432197 885 ntTSL 518.64■□□□□ 0.573e-13■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 KRI1-210ENST00000543682 571 ntTSL 316.93■□□□□ 0.33e-13■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 KRI1-208ENST00000537964 565 ntTSL 416.43■□□□□ 0.223e-13■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 KRI1-213ENST00000546063 740 ntTSL 416.31■□□□□ 0.23e-13■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 KRI1-212ENST00000544397 514 ntTSL 412.85□□□□□ -0.353e-13■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.443e-13■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 KRI1-204ENST00000536689 3744 ntTSL 211.71□□□□□ -0.543e-13■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 KRI1-209ENST00000539027 582 ntTSL 510.39□□□□□ -0.753e-13■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 SPIDR-220ENST00000522900 692 ntTSL 317.43■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 SPIDR-221ENST00000523814 802 ntTSL 515.53■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 SPIDR-204ENST00000517824 849 ntTSL 510.59□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 VRK1-203ENST00000555067 604 ntTSL 36.5□□□□□ -1.372e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 SPIDR-218ENST00000522222 585 ntTSL 46.44□□□□□ -1.382e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.292e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 UBAC2-207ENST00000473091 610 ntTSL 49.67□□□□□ -0.862e-7■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.097e-7■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.037e-7■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 SIK3-204ENST00000445177 6331 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.04□□□□□ -0.327e-7■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 SIK3-203ENST00000415541 3816 ntTSL 1 (best)7.29□□□□□ -1.247e-7■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 CDC25B-206ENST00000467519 1960 ntTSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.434e-10■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 PBX2-202ENST00000478678 1320 ntTSL 1 (best)20.69■□□□□ 0.94e-8■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 33.94□□□□□ -1.782e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 TRAPPC9-213ENST00000522504 665 ntTSL 313.92□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 USP3-212ENST00000559276 554 ntTSL 45.47□□□□□ -1.531e-6■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.788e-8■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 COPG2-202ENST00000425248 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 COPG2-203ENST00000617523 2142 ntTSL 57.66□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 RCOR3-205ENST00000472734 452 ntTSL 220.6■□□□□ 0.893e-8■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 ENO2-210ENST00000539713 543 ntTSL 415.23■□□□□ 0.038e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.058e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 ENO2-207ENST00000537688 547 ntTSL 514.52□□□□□ -0.098e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.198e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 ENO2-212ENST00000542509 825 ntTSL 513.28□□□□□ -0.288e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.368e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 ENO2-206ENST00000536199 823 ntTSL 512.59□□□□□ -0.398e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 ENO2-208ENST00000537838 541 ntTSL 412.12□□□□□ -0.478e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.538e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 DDA1-201ENST00000359866 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.643e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 AAK1-210ENST00000495836 965 ntTSL 1 (best)18.4■□□□□ 0.544e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 PPP1R3E-209ENST00000561437 690 ntTSL 216.68■□□□□ 0.261e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 PPP1R3E-206ENST00000560913 932 ntTSL 215.89■□□□□ 0.131e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.174e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 PPP1R3E-203ENST00000559314 2351 ntTSL 212.71□□□□□ -0.381e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.514e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 PPP1R3E-202ENST00000558058 3222 ntTSL 310.14□□□□□ -0.791e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 ELOVL2-201ENST00000354666 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.931e-8■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 PPP1R3E-204ENST00000559942 1187 ntTSL 1 (best)9.13□□□□□ -0.951e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.384e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 TRIP12-207ENST00000428959 584 ntTSL 38.17□□□□□ -1.13e-6■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 GNAS-232ENST00000476196 1839 ntTSL 211.15□□□□□ -0.622e-77■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 GPHN-211ENST00000556020 562 ntTSL 415.95■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 GPHN-215ENST00000557654 503 ntTSL 46.73□□□□□ -1.331e-6■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 GPHN-206ENST00000553936 574 ntTSL 36.19□□□□□ -1.421e-6■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 GPHN-214ENST00000556633 512 ntTSL 35.02□□□□□ -1.611e-6■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 GPHN-210ENST00000555668 550 ntTSL 43.57□□□□□ -1.841e-6■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.462e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 RNF123-210ENST00000487805 5882 ntTSL 213.06□□□□□ -0.321e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 RNF123-209ENST00000486102 4564 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.531e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 RNF123-207ENST00000457726 4506 ntTSL 1 (best)10.41□□□□□ -0.741e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 RNF123-201ENST00000327697 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.81e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 INO80E-211ENST00000567987 1926 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.543e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.493e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 INO80E-205ENST00000562441 1412 ntTSL 217.3■□□□□ 0.363e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.33e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.113e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 INO80E-208ENST00000567065 883 ntTSL 314.15□□□□□ -0.143e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 INO80E-203ENST00000540562 3064 ntTSL 213.75□□□□□ -0.213e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 INO80E-213ENST00000569957 4469 ntTSL 212.37□□□□□ -0.433e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 INO80E-204ENST00000562291 255 ntTSL 39.02□□□□□ -0.973e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-7■■■■□ 25.3
PCBP2Q15366 SEPT9-243ENST00000592407 509 ntTSL 216.98■□□□□ 0.315e-7■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.733e-7■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.693e-7■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.742e-7■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 PATZ1-205ENST00000465287 1702 ntTSL 218.18■□□□□ 0.52e-7■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 PATZ1-206ENST00000494109 835 ntTSL 211.23□□□□□ -0.612e-7■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.422e-7■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 ATXN7-207ENST00000477516 723 ntTSL 25.42□□□□□ -1.541e-6■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.033e-10■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 XPO1-206ENST00000428210 6776 ntTSL 213.01□□□□□ -0.333e-10■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.063e-10■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.683e-8■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 NR5A1-201ENST00000373587 768 ntTSL 319.37■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.718e-10■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.588e-10■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.148e-10■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.38e-10■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.392e-11■■■■□ 25.2
PCBP2Q15366 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-11■■■■□ 25.2
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 195.3 ms