Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SLC22A31-203ENST00000563595 780 ntTSL 326.31■■□□□ 1.81e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 NUDC-202ENST00000435827 821 ntTSL 524.91■■□□□ 1.581e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 NUDC-203ENST00000452707 816 ntTSL 324.91■■□□□ 1.581e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.242e-11■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.131e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 UGDH-208ENST00000510490 534 ntTSL 421.48■■□□□ 1.031e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 UGDH-211ENST00000515021 861 ntTSL 520.68■□□□□ 0.91e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.691e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 UGDH-203ENST00000503779 575 ntTSL 418.1■□□□□ 0.491e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 UGDH-207ENST00000509391 577 ntTSL 318.1■□□□□ 0.491e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 UGDH-210ENST00000514106 568 ntTSL 417.81■□□□□ 0.441e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 UGDH-212ENST00000515398 584 ntTSL 517.81■□□□□ 0.441e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.231e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.651e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.921e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 UGDH-209ENST00000510881 549 ntTSL 37.27□□□□□ -1.251e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 UGDH-204ENST00000505698 433 ntTSL 46.27□□□□□ -1.411e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 MDH2-207ENST00000490105 569 ntTSL 324.94■■□□□ 1.582e-10■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.532e-8■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.492e-8■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.482e-8■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.412e-8■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.052e-8■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-8■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 PTGES3-206ENST00000537473 2939 ntTSL 213.99□□□□□ -0.172e-8■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 SLC16A3-220ENST00000584781 562 ntTSL 425.25■■□□□ 1.633e-15■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 SLC16A3-208ENST00000579572 863 ntTSL 322.4■■□□□ 1.183e-15■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 SLC16A3-215ENST00000582946 586 ntTSL 418.86■□□□□ 0.613e-15■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 SLC16A3-203ENST00000577650 545 ntTSL 318.84■□□□□ 0.613e-15■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 SLC16A3-204ENST00000578522 535 ntTSL 418.43■□□□□ 0.543e-15■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 SLC6A8-210ENST00000485324 2401 ntTSL 220.84■□□□□ 0.937e-8■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 PKM-209ENST00000563986 825 ntTSL 213.33□□□□□ -0.282e-10■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 PKM-225ENST00000570166 626 ntTSL 27.43□□□□□ -1.222e-10■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.674e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 MVD-205ENST00000562981 537 ntTSL 219■□□□□ 0.631e-10■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 RPS5-206ENST00000598807 970 ntTSL 218.95■□□□□ 0.623e-7■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 AC011530.1-203ENST00000597712 432 ntTSL 216.73■□□□□ 0.274e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 AC011530.1-204ENST00000595946 321 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.36■□□□□ 0.054e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 AC011530.1-202ENST00000596586 397 ntAPPRIS P5 TSL 215.36■□□□□ 0.054e-6■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.051e-10■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.021e-10■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EIF3F-202ENST00000528653 739 ntTSL 215.02■□□□□ -01e-10■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EIF3F-205ENST00000531329 1072 ntTSL 214.53□□□□□ -0.081e-10■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -11e-10■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 FKBP1A-206ENST00000460490 694 ntTSL 28.71□□□□□ -1.021e-10■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 RPL18-211ENST00000550973 1111 ntTSL 522.77■■□□□ 1.246e-12■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL18-213ENST00000552347 1645 ntTSL 519.65■□□□□ 0.746e-12■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL18-201ENST00000084795 612 ntTSL 1 (best)19.16■□□□□ 0.666e-12■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.666e-12■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.666e-12■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.666e-12■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL18-212ENST00000551749 2091 ntTSL 218.14■□□□□ 0.496e-12■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL18-206ENST00000549370 628 ntTSL 517.95■□□□□ 0.466e-12■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL18-202ENST00000546623 541 ntTSL 517.65■□□□□ 0.426e-12■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL18-204ENST00000547897 440 ntTSL 515.4■□□□□ 0.066e-12■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.086e-12■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL18-203ENST00000547892 3844 nt12.11□□□□□ -0.476e-12■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.262e-7■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.322e-7■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 EPN1-204ENST00000586194 583 ntTSL 213.32□□□□□ -0.283e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPS3-213ENST00000529285 550 ntTSL 522.64■■□□□ 1.219e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CHRD-215ENST00000485883 568 ntTSL 422.58■■□□□ 1.219e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CHRD-207ENST00000459711 503 ntTSL 222.2■■□□□ 1.149e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CHRD-216ENST00000486066 546 ntTSL 421.52■■□□□ 1.049e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.029e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 AUP1-204ENST00000463900 1645 ntTSL 1 (best)19.3■□□□□ 0.689e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 AUP1-202ENST00000425118 1581 ntTSL 1 (best)18.72■□□□□ 0.599e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CHRD-214ENST00000482805 608 ntTSL 418.33■□□□□ 0.529e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.519e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 AUP1-206ENST00000466894 1658 ntTSL 517.99■□□□□ 0.479e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CHRD-210ENST00000461684 677 ntTSL 417.71■□□□□ 0.439e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RACK1-203ENST00000502844 1460 ntTSL 316.62■□□□□ 0.255e-9■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.099e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CD164-209ENST00000512212 590 ntTSL 215.54■□□□□ 0.089e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.089e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 LMAN1-202ENST00000587561 1181 ntTSL 215.54■□□□□ 0.089e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CHRD-212ENST00000470150 4234 ntTSL 214.87□□□□□ -0.039e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 AUP1-208ENST00000486234 984 ntTSL 514.54□□□□□ -0.089e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RACK1-202ENST00000502548 1090 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.15e-9■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPS3-212ENST00000529173 1373 ntTSL 514.22□□□□□ -0.139e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RACK1-223ENST00000510199 1100 ntTSL 313.14□□□□□ -0.315e-9■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPS3-208ENST00000527273 390 ntTSL 312.85□□□□□ -0.359e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CD164-204ENST00000413644 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.399e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPS3-211ENST00000528847 639 ntTSL 511.21□□□□□ -0.619e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RACK1-212ENST00000505461 1005 ntTSL 511.04□□□□□ -0.649e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 AUP1-203ENST00000462297 457 ntTSL 310.92□□□□□ -0.669e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPS3-203ENST00000524851 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.679e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CD164-202ENST00000310786 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.769e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RACK1-208ENST00000503494 843 ntTSL 310.07□□□□□ -0.85e-9■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPS3-207ENST00000526608 710 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.819e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RACK1-215ENST00000507261 590 ntTSL 39.33□□□□□ -0.929e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.969e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CD164-201ENST00000275080 2954 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.979e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RACK1-206ENST00000503081 587 ntTSL 38.7□□□□□ -1.027e-9■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RACK1-213ENST00000506312 559 ntTSL 58.66□□□□□ -1.027e-9■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RACK1-214ENST00000507000 685 ntTSL 57.74□□□□□ -1.175e-9■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RACK1-231ENST00000514183 1439 ntTSL 27.2□□□□□ -1.265e-9■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.269e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RACK1-220ENST00000508963 581 ntTSL 26.89□□□□□ -1.319e-6■□□□□ 9.5
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