RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448157.6

PTGES3-204, Transcript of prostaglandin E synthase 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTGES3, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGES3-204ENST00000448157 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.12■■■■■ 4.17
PTGES3-204ENST00000448157 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.6■■■■□ 3.45
PTGES3-204ENST00000448157 ABCC9O60706 1549 aa36.39■■■■□ 3.42
PTGES3-204ENST00000448157 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.65■■■■□ 3.14
PTGES3-204ENST00000448157 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.65■■■■□ 3.14
PTGES3-204ENST00000448157 NACADO15069 1562 aa34.49■■■■□ 3.11
PTGES3-204ENST00000448157 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
PTGES3-204ENST00000448157 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.09■■■■□ 3.05
PTGES3-204ENST00000448157 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.03■■■■□ 3.04
PTGES3-204ENST00000448157 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.01■■■■□ 3.03
PTGES3-204ENST00000448157 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.86■■■■□ 3.01
PTGES3-204ENST00000448157 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.85■■■■□ 3.01
PTGES3-204ENST00000448157 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.78■■■■□ 3
PTGES3-204ENST00000448157 SCRIBQ14160 1630 aa33.57■■■□□ 2.97
PTGES3-204ENST00000448157 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.06■■■□□ 2.88
PTGES3-204ENST00000448157 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
PTGES3-204ENST00000448157 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.84■■■□□ 2.85
PTGES3-204ENST00000448157 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.66■■■□□ 2.82
PTGES3-204ENST00000448157 SMARCA4P51532 1647 aa32■■■□□ 2.71
PTGES3-204ENST00000448157 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.91■■■□□ 2.7
PTGES3-204ENST00000448157 NCAPD3P42695 1498 aa31.89■■■□□ 2.7
PTGES3-204ENST00000448157 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
PTGES3-204ENST00000448157 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.78■■■□□ 2.68
PTGES3-204ENST00000448157 SMARCA2P51531 1590 aa31.75■■■□□ 2.67
PTGES3-204ENST00000448157 HMGXB3Q12766 1538 aa31.66■■■□□ 2.66
PTGES3-204ENST00000448157 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
PTGES3-204ENST00000448157 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.6■■■□□ 2.65
PTGES3-204ENST00000448157 NESP48681 1621 aa31.44■■■□□ 2.62
PTGES3-204ENST00000448157 WIZO95785 1651 aa31.44■■■□□ 2.62
PTGES3-204ENST00000448157 ERCC6Q03468 1493 aa31.27■■■□□ 2.6
PTGES3-204ENST00000448157 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
PTGES3-204ENST00000448157 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.07■■■□□ 2.56
PTGES3-204ENST00000448157 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.99■■■□□ 2.55
PTGES3-204ENST00000448157 CUX2O14529 1486 aa30.98■■■□□ 2.55
PTGES3-204ENST00000448157 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.96■■■□□ 2.55
PTGES3-204ENST00000448157 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
PTGES3-204ENST00000448157 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
PTGES3-204ENST00000448157 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.86■■■□□ 2.53
PTGES3-204ENST00000448157 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.83■■■□□ 2.53
PTGES3-204ENST00000448157 CFTRP13569 1480 aa30.7■■■□□ 2.51
PTGES3-204ENST00000448157 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.68■■■□□ 2.5
PTGES3-204ENST00000448157 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.64■■■□□ 2.5
PTGES3-204ENST00000448157 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.63■■■□□ 2.49
PTGES3-204ENST00000448157 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.59■■■□□ 2.49
PTGES3-204ENST00000448157 WDR62O43379 1518 aa30.55■■■□□ 2.48
PTGES3-204ENST00000448157 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
PTGES3-204ENST00000448157 PRDM2Q13029 1718 aa30.4■■■□□ 2.46
PTGES3-204ENST00000448157 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
PTGES3-204ENST00000448157 TOPBP1Q92547 1522 aa30.12■■■□□ 2.41
PTGES3-204ENST00000448157 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
PTGES3-204ENST00000448157 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
PTGES3-204ENST00000448157 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.01■■■□□ 2.39
PTGES3-204ENST00000448157 IFT140Q96RY7 1462 aa29.94■■■□□ 2.38
PTGES3-204ENST00000448157 ABCC8Q09428 1581 aa29.91■■■□□ 2.38
PTGES3-204ENST00000448157 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
PTGES3-204ENST00000448157 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
PTGES3-204ENST00000448157 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.83■■■□□ 2.37
PTGES3-204ENST00000448157 CUX1P39880 1505 aa29.82■■■□□ 2.36
PTGES3-204ENST00000448157 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
PTGES3-204ENST00000448157 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.78■■■□□ 2.365e-7■■■■□ 25
PTGES3-204ENST00000448157 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.74■■■□□ 2.35
PTGES3-204ENST00000448157 SOGA1O94964 1423 aa29.71■■■□□ 2.35
PTGES3-204ENST00000448157 OSCARQ8IYS5 282 aa29.7■■■□□ 2.35
PTGES3-204ENST00000448157 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
PTGES3-204ENST00000448157 TRIM41Q8WV44 630 aa29.54■■■□□ 2.32
PTGES3-204ENST00000448157 CHD1O14646 1710 aa29.52■■■□□ 2.32
PTGES3-204ENST00000448157 WDR97A6NE52 1622 aa29.49■■■□□ 2.31
PTGES3-204ENST00000448157 FBLN2P98095 1184 aa29.48■■■□□ 2.31
PTGES3-204ENST00000448157 SYNJ1O43426 1573 aa29.47■■■□□ 2.31
PTGES3-204ENST00000448157 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.44■■■□□ 2.3
PTGES3-204ENST00000448157 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
PTGES3-204ENST00000448157 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.38■■■□□ 2.29
PTGES3-204ENST00000448157 TOP2BQ02880 1626 aa29.38■■■□□ 2.29
PTGES3-204ENST00000448157 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.35■■■□□ 2.29
PTGES3-204ENST00000448157 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.35■■■□□ 2.29
PTGES3-204ENST00000448157 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.35■■■□□ 2.29
PTGES3-204ENST00000448157 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.35■■■□□ 2.29
PTGES3-204ENST00000448157 GRIN2BQ13224 1484 aa29.35■■■□□ 2.29
PTGES3-204ENST00000448157 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.34■■■□□ 2.29
PTGES3-204ENST00000448157 PBRM1Q86U86 1689 aa29.33■■■□□ 2.29
PTGES3-204ENST00000448157 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.31■■■□□ 2.28
PTGES3-204ENST00000448157 ARHGEF11O15085 1522 aa29.28■■■□□ 2.28
PTGES3-204ENST00000448157 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
PTGES3-204ENST00000448157 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
PTGES3-204ENST00000448157 SYNJ2O15056 1496 aa29.21■■■□□ 2.27
PTGES3-204ENST00000448157 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.15■■■□□ 2.26
PTGES3-204ENST00000448157 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.08■■■□□ 2.25
PTGES3-204ENST00000448157 ADAMTS12P58397 1594 aa29.06■■■□□ 2.24
PTGES3-204ENST00000448157 ARAP1Q96P48 1450 aa29.06■■■□□ 2.24
PTGES3-204ENST00000448157 GRIN2AQ12879 1464 aa29.01■■■□□ 2.23
PTGES3-204ENST00000448157 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.96■■■□□ 2.23
PTGES3-204ENST00000448157 CEP170Q5SW79 1584 aa28.95■■■□□ 2.22
PTGES3-204ENST00000448157 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.94■■■□□ 2.22
PTGES3-204ENST00000448157 NUP160Q12769 1436 aa28.88■■■□□ 2.21
PTGES3-204ENST00000448157 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.88■■■□□ 2.21
PTGES3-204ENST00000448157 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.86■■■□□ 2.21
PTGES3-204ENST00000448157 IGF1RP08069 1367 aa28.8■■■□□ 2.2
PTGES3-204ENST00000448157 KIF27Q86VH2 1401 aa28.77■■■□□ 2.2
PTGES3-204ENST00000448157 SHROOM2Q13796 1616 aa28.71■■■□□ 2.19
PTGES3-204ENST00000448157 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms