RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550973.5

RPL18-211, Transcript of ribosomal protein L18, humanhuman

TSL 5

Gene RPL18, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18-211ENST00000550973 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50■■■■■ 5.59
RPL18-211ENST00000550973 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.39■■■■■ 4.7
RPL18-211ENST00000550973 ABCC9O60706 1549 aa43.99■■■■■ 4.63
RPL18-211ENST00000550973 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.23■■■■■ 4.35
RPL18-211ENST00000550973 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.06■■■■■ 4.32
RPL18-211ENST00000550973 NACADO15069 1562 aa41.97■■■■■ 4.31
RPL18-211ENST00000550973 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.6■■■■■ 4.25
RPL18-211ENST00000550973 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
RPL18-211ENST00000550973 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.3■■■■■ 4.2
RPL18-211ENST00000550973 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.22■■■■■ 4.19
RPL18-211ENST00000550973 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.93■■■■■ 4.14
RPL18-211ENST00000550973 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.84■■■■■ 4.13
RPL18-211ENST00000550973 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.78■■■■■ 4.12
RPL18-211ENST00000550973 SCRIBQ14160 1630 aa40.58■■■■■ 4.09
RPL18-211ENST00000550973 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.3■■■■■ 4.04
RPL18-211ENST00000550973 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.95
RPL18-211ENST00000550973 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.67■■■■□ 3.94
RPL18-211ENST00000550973 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.56■■■■□ 3.92
RPL18-211ENST00000550973 NCAPD3P42695 1498 aa38.82■■■■□ 3.81
RPL18-211ENST00000550973 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.77■■■■□ 3.8
RPL18-211ENST00000550973 SMARCA4P51532 1647 aa38.77■■■■□ 3.8
RPL18-211ENST00000550973 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
RPL18-211ENST00000550973 SMARCA2P51531 1590 aa38.63■■■■□ 3.77
RPL18-211ENST00000550973 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.53■■■■□ 3.76
RPL18-211ENST00000550973 HMGXB3Q12766 1538 aa38.44■■■■□ 3.74
RPL18-211ENST00000550973 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
RPL18-211ENST00000550973 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.4■■■■□ 3.74
RPL18-211ENST00000550973 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
RPL18-211ENST00000550973 WIZO95785 1651 aa38.03■■■■□ 3.68
RPL18-211ENST00000550973 NESP48681 1621 aa37.94■■■■□ 3.66
RPL18-211ENST00000550973 ERCC6Q03468 1493 aa37.93■■■■□ 3.66
RPL18-211ENST00000550973 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.73■■■■□ 3.63
RPL18-211ENST00000550973 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.72■■■■□ 3.63
RPL18-211ENST00000550973 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.63■■■■□ 3.61
RPL18-211ENST00000550973 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
RPL18-211ENST00000550973 CUX2O14529 1486 aa37.59■■■■□ 3.61
RPL18-211ENST00000550973 CFTRP13569 1480 aa37.35■■■■□ 3.57
RPL18-211ENST00000550973 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.31■■■■□ 3.56
RPL18-211ENST00000550973 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.3■■■■□ 3.56
RPL18-211ENST00000550973 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
RPL18-211ENST00000550973 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.2■■■■□ 3.55
RPL18-211ENST00000550973 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.17■■■■□ 3.54
RPL18-211ENST00000550973 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.15■■■■□ 3.54
RPL18-211ENST00000550973 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.04■■■■□ 3.52
RPL18-211ENST00000550973 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
RPL18-211ENST00000550973 WDR62O43379 1518 aa36.99■■■■□ 3.51
RPL18-211ENST00000550973 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
RPL18-211ENST00000550973 PRDM2Q13029 1718 aa36.73■■■■□ 3.47
RPL18-211ENST00000550973 ABCC8Q09428 1581 aa36.58■■■■□ 3.45
RPL18-211ENST00000550973 TOPBP1Q92547 1522 aa36.55■■■■□ 3.44
RPL18-211ENST00000550973 IFT140Q96RY7 1462 aa36.43■■■■□ 3.42
RPL18-211ENST00000550973 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.41■■■■□ 3.42
RPL18-211ENST00000550973 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
RPL18-211ENST00000550973 OSCARQ8IYS5 282 aa36.23■■■■□ 3.39
RPL18-211ENST00000550973 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
RPL18-211ENST00000550973 SOGA1O94964 1423 aa36.19■■■■□ 3.38
RPL18-211ENST00000550973 CUX1P39880 1505 aa36.14■■■■□ 3.38
RPL18-211ENST00000550973 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.13■■■■□ 3.37
RPL18-211ENST00000550973 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.12■■■■□ 3.375e-8■■■■■ 45.6
RPL18-211ENST00000550973 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
RPL18-211ENST00000550973 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.09■■■■□ 3.37
RPL18-211ENST00000550973 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
RPL18-211ENST00000550973 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
RPL18-211ENST00000550973 FBLN2P98095 1184 aa35.88■■■■□ 3.33
RPL18-211ENST00000550973 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.87■■■■□ 3.331e-7■■■■■ 66.8
RPL18-211ENST00000550973 WDR97A6NE52 1622 aa35.75■■■■□ 3.31
RPL18-211ENST00000550973 GRIN2BQ13224 1484 aa35.73■■■■□ 3.31
RPL18-211ENST00000550973 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.73■■■■□ 3.31
RPL18-211ENST00000550973 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
RPL18-211ENST00000550973 TOP2BQ02880 1626 aa35.69■■■■□ 3.3
RPL18-211ENST00000550973 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.69■■■■□ 3.3
RPL18-211ENST00000550973 TRIM41Q8WV44 630 aa35.69■■■■□ 3.3
RPL18-211ENST00000550973 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.68■■■■□ 3.3
RPL18-211ENST00000550973 SYNJ1O43426 1573 aa35.67■■■■□ 3.3
RPL18-211ENST00000550973 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.63■■■■□ 3.29
RPL18-211ENST00000550973 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
RPL18-211ENST00000550973 CHD1O14646 1710 aa35.55■■■■□ 3.28
RPL18-211ENST00000550973 SYNJ2O15056 1496 aa35.5■■■■□ 3.27
RPL18-211ENST00000550973 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.48■■■■□ 3.27
RPL18-211ENST00000550973 PBRM1Q86U86 1689 aa35.4■■■■□ 3.26
RPL18-211ENST00000550973 ARHGEF11O15085 1522 aa35.39■■■■□ 3.26
RPL18-211ENST00000550973 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.38■■■■□ 3.25
RPL18-211ENST00000550973 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.38■■■■□ 3.25
RPL18-211ENST00000550973 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.38■■■■□ 3.25
RPL18-211ENST00000550973 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.34■■■■□ 3.25
RPL18-211ENST00000550973 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.29■■■■□ 3.24
RPL18-211ENST00000550973 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.27■■■■□ 3.24
RPL18-211ENST00000550973 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.24■■■■□ 3.23
RPL18-211ENST00000550973 GRIN2AQ12879 1464 aa35.22■■■■□ 3.23
RPL18-211ENST00000550973 ADAMTS12P58397 1594 aa35.17■■■■□ 3.22
RPL18-211ENST00000550973 KIF27Q86VH2 1401 aa35.17■■■■□ 3.22
RPL18-211ENST00000550973 IGF1RP08069 1367 aa35.14■■■■□ 3.22
RPL18-211ENST00000550973 NUP160Q12769 1436 aa35.1■■■■□ 3.21
RPL18-211ENST00000550973 ARAP1Q96P48 1450 aa35.09■■■■□ 3.21
RPL18-211ENST00000550973 CEP170Q5SW79 1584 aa35■■■■□ 3.19
RPL18-211ENST00000550973 JPH4Q96JJ6 628 aa34.95■■■■□ 3.19
RPL18-211ENST00000550973 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.92■■■■□ 3.18
RPL18-211ENST00000550973 CUL7Q14999 1698 aa34.79■■■■□ 3.16
RPL18-211ENST00000550973 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
RPL18-211ENST00000550973 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.78■■■■□ 3.16
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