RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512212.1

CD164-209, Transcript of CD164 molecule, humanhuman

TSL 2

Gene CD164, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164-209ENST00000512212 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.17■■■■□ 3.06
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CD164-209ENST00000512212 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.5■■■□□ 2.15
CD164-209ENST00000512212 NACADO15069 1562 aa28.2■■■□□ 2.11
CD164-209ENST00000512212 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.16■■■□□ 2.1
CD164-209ENST00000512212 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.14■■■□□ 2.1
CD164-209ENST00000512212 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.07■■■□□ 2.08
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CD164-209ENST00000512212 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.75■■□□□ 1.87
CD164-209ENST00000512212 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CD164-209ENST00000512212 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.5■■□□□ 1.83
CD164-209ENST00000512212 SMARCA4P51532 1647 aa26.47■■□□□ 1.83
CD164-209ENST00000512212 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.46■■□□□ 1.83
CD164-209ENST00000512212 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
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CD164-209ENST00000512212 WIZO95785 1651 aa26.23■■□□□ 1.79
CD164-209ENST00000512212 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.21■■□□□ 1.79
CD164-209ENST00000512212 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.1■■□□□ 1.77
CD164-209ENST00000512212 SMARCA2P51531 1590 aa26.07■■□□□ 1.76
CD164-209ENST00000512212 NCAPD3P42695 1498 aa26.07■■□□□ 1.76
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CD164-209ENST00000512212 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CD164-209ENST00000512212 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CD164-209ENST00000512212 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.6■■□□□ 1.69
CD164-209ENST00000512212 NESP48681 1621 aa25.56■■□□□ 1.68
CD164-209ENST00000512212 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.34■■□□□ 1.65
CD164-209ENST00000512212 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.28■■□□□ 1.64
CD164-209ENST00000512212 CFTRP13569 1480 aa25.28■■□□□ 1.64
CD164-209ENST00000512212 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.23■■□□□ 1.63
CD164-209ENST00000512212 PRDM2Q13029 1718 aa25.15■■□□□ 1.62
CD164-209ENST00000512212 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.11■■□□□ 1.61
CD164-209ENST00000512212 ERCC6Q03468 1493 aa25.09■■□□□ 1.61
CD164-209ENST00000512212 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.09■■□□□ 1.61
CD164-209ENST00000512212 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.06■■□□□ 1.6
CD164-209ENST00000512212 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CD164-209ENST00000512212 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.96■■□□□ 1.59
CD164-209ENST00000512212 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CD164-209ENST00000512212 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.88■■□□□ 1.57
CD164-209ENST00000512212 ABCC8Q09428 1581 aa24.87■■□□□ 1.57
CD164-209ENST00000512212 WDR62O43379 1518 aa24.79■■□□□ 1.56
CD164-209ENST00000512212 CUX1P39880 1505 aa24.78■■□□□ 1.56
CD164-209ENST00000512212 TOPBP1Q92547 1522 aa24.76■■□□□ 1.55
CD164-209ENST00000512212 SYNJ1O43426 1573 aa24.71■■□□□ 1.55
CD164-209ENST00000512212 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.71■■□□□ 1.55
CD164-209ENST00000512212 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.543e-7■■□□□ 13.1
CD164-209ENST00000512212 CUX2O14529 1486 aa24.64■■□□□ 1.53
CD164-209ENST00000512212 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.58■■□□□ 1.53
CD164-209ENST00000512212 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.58■■□□□ 1.53
CD164-209ENST00000512212 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
CD164-209ENST00000512212 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.58■■□□□ 1.52
CD164-209ENST00000512212 TOP2BQ02880 1626 aa24.57■■□□□ 1.52
CD164-209ENST00000512212 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CD164-209ENST00000512212 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CD164-209ENST00000512212 SOGA1O94964 1423 aa24.45■■□□□ 1.51
CD164-209ENST00000512212 IFT140Q96RY7 1462 aa24.4■■□□□ 1.5
CD164-209ENST00000512212 WDR97A6NE52 1622 aa24.39■■□□□ 1.49
CD164-209ENST00000512212 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CD164-209ENST00000512212 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.492e-10■■■■□ 24.3
CD164-209ENST00000512212 TRIM41Q8WV44 630 aa24.32■■□□□ 1.48
CD164-209ENST00000512212 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CD164-209ENST00000512212 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.29■■□□□ 1.48
CD164-209ENST00000512212 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.25■■□□□ 1.47
CD164-209ENST00000512212 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.22■■□□□ 1.47
CD164-209ENST00000512212 PBRM1Q86U86 1689 aa24.16■■□□□ 1.46
CD164-209ENST00000512212 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.16■■□□□ 1.46
CD164-209ENST00000512212 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.07■■□□□ 1.44
CD164-209ENST00000512212 GRIN2BQ13224 1484 aa24.07■■□□□ 1.44
CD164-209ENST00000512212 KIF27Q86VH2 1401 aa24.03■■□□□ 1.44
CD164-209ENST00000512212 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CD164-209ENST00000512212 IGF1RP08069 1367 aa24.02■■□□□ 1.44
CD164-209ENST00000512212 CHD1O14646 1710 aa24.01■■□□□ 1.43
CD164-209ENST00000512212 ADAMTS12P58397 1594 aa23.96■■□□□ 1.43
CD164-209ENST00000512212 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.95■■□□□ 1.43
CD164-209ENST00000512212 FBLN2P98095 1184 aa23.93■■□□□ 1.42
CD164-209ENST00000512212 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
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CD164-209ENST00000512212 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.84■■□□□ 1.41
CD164-209ENST00000512212 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.83■■□□□ 1.41
CD164-209ENST00000512212 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CD164-209ENST00000512212 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.82■■□□□ 1.4
CD164-209ENST00000512212 CUL7Q14999 1698 aa23.81■■□□□ 1.4
CD164-209ENST00000512212 GRIN2AQ12879 1464 aa23.81■■□□□ 1.4
CD164-209ENST00000512212 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.79■■□□□ 1.4
CD164-209ENST00000512212 CEP170Q5SW79 1584 aa23.77■■□□□ 1.4
CD164-209ENST00000512212 PRXQ9BXM0 1461 aa23.75■■□□□ 1.39
CD164-209ENST00000512212 OSCARQ8IYS5 282 aa23.72■■□□□ 1.39
CD164-209ENST00000512212 EEA1Q15075 1411 aa23.72■■□□□ 1.39
CD164-209ENST00000512212 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.72■■□□□ 1.39
CD164-209ENST00000512212 NUP160Q12769 1436 aa23.67■■□□□ 1.38
CD164-209ENST00000512212 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.67■■□□□ 1.38
CD164-209ENST00000512212 KIF21BO75037 1637 aa23.6■■□□□ 1.37
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