RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527273.5

RPS3-208, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 3

Gene RPS3, Length 390 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-208ENST00000527273 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.89■■■□□ 2.22
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RPS3-208ENST00000527273 ABCC9O60706 1549 aa25.84■■□□□ 1.73
RPS3-208ENST00000527273 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.61■■□□□ 1.53
RPS3-208ENST00000527273 NACADO15069 1562 aa24.44■■□□□ 1.5
RPS3-208ENST00000527273 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.4■■□□□ 1.5
RPS3-208ENST00000527273 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.15■■□□□ 1.46
RPS3-208ENST00000527273 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.15■■□□□ 1.46
RPS3-208ENST00000527273 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.09■■□□□ 1.45
RPS3-208ENST00000527273 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
RPS3-208ENST00000527273 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
RPS3-208ENST00000527273 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.91■■□□□ 1.42
RPS3-208ENST00000527273 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.84■■□□□ 1.41
RPS3-208ENST00000527273 SCRIBQ14160 1630 aa23.66■■□□□ 1.38
RPS3-208ENST00000527273 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.5■■□□□ 1.35
RPS3-208ENST00000527273 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.35■■□□□ 1.33
RPS3-208ENST00000527273 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
RPS3-208ENST00000527273 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS3-208ENST00000527273 NCAPD3P42695 1498 aa22.55■■□□□ 1.2
RPS3-208ENST00000527273 SMARCA4P51532 1647 aa22.55■■□□□ 1.2
RPS3-208ENST00000527273 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.51■■□□□ 1.19
RPS3-208ENST00000527273 SMARCA2P51531 1590 aa22.46■■□□□ 1.19
RPS3-208ENST00000527273 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
RPS3-208ENST00000527273 HMGXB3Q12766 1538 aa22.41■■□□□ 1.18
RPS3-208ENST00000527273 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RPS3-208ENST00000527273 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.29■■□□□ 1.16
RPS3-208ENST00000527273 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.29■■□□□ 1.16
RPS3-208ENST00000527273 ERCC6Q03468 1493 aa22.28■■□□□ 1.16
RPS3-208ENST00000527273 NESP48681 1621 aa22.24■■□□□ 1.15
RPS3-208ENST00000527273 CUX2O14529 1486 aa22.18■■□□□ 1.14
RPS3-208ENST00000527273 WIZO95785 1651 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS3-208ENST00000527273 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS3-208ENST00000527273 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.06■■□□□ 1.12
RPS3-208ENST00000527273 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.99■■□□□ 1.11
RPS3-208ENST00000527273 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
RPS3-208ENST00000527273 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.9■■□□□ 1.1
RPS3-208ENST00000527273 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.87■■□□□ 1.09
RPS3-208ENST00000527273 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RPS3-208ENST00000527273 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RPS3-208ENST00000527273 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.72■■□□□ 1.07
RPS3-208ENST00000527273 WDR62O43379 1518 aa21.67■■□□□ 1.06
RPS3-208ENST00000527273 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.66■■□□□ 1.06
RPS3-208ENST00000527273 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.65■■□□□ 1.06
RPS3-208ENST00000527273 CFTRP13569 1480 aa21.64■■□□□ 1.06
RPS3-208ENST00000527273 PRDM2Q13029 1718 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS3-208ENST00000527273 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS3-208ENST00000527273 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
RPS3-208ENST00000527273 TOPBP1Q92547 1522 aa21.25■□□□□ 0.99
RPS3-208ENST00000527273 IFT140Q96RY7 1462 aa21.21■□□□□ 0.99
RPS3-208ENST00000527273 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
RPS3-208ENST00000527273 TRIM41Q8WV44 630 aa21.2■□□□□ 0.98
RPS3-208ENST00000527273 OSCARQ8IYS5 282 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS3-208ENST00000527273 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS3-208ENST00000527273 ABCC8Q09428 1581 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS3-208ENST00000527273 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
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RPS3-208ENST00000527273 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
RPS3-208ENST00000527273 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.968e-8■■■■□ 20.2
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RPS3-208ENST00000527273 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.96■□□□□ 0.95
RPS3-208ENST00000527273 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.96■□□□□ 0.95
RPS3-208ENST00000527273 SOGA1O94964 1423 aa20.95■□□□□ 0.94
RPS3-208ENST00000527273 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.94■□□□□ 0.94
RPS3-208ENST00000527273 CUX1P39880 1505 aa20.94■□□□□ 0.94
RPS3-208ENST00000527273 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
RPS3-208ENST00000527273 FBLN2P98095 1184 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS3-208ENST00000527273 ARHGEF11O15085 1522 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS3-208ENST00000527273 WDR97A6NE52 1622 aa20.82■□□□□ 0.92
RPS3-208ENST00000527273 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.81■□□□□ 0.92
RPS3-208ENST00000527273 PBRM1Q86U86 1689 aa20.75■□□□□ 0.91
RPS3-208ENST00000527273 GRIN2BQ13224 1484 aa20.74■□□□□ 0.91
RPS3-208ENST00000527273 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
RPS3-208ENST00000527273 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.72■□□□□ 0.91
RPS3-208ENST00000527273 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
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RPS3-208ENST00000527273 ARAP1Q96P48 1450 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS3-208ENST00000527273 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS3-208ENST00000527273 SYNJ2O15056 1496 aa20.67■□□□□ 0.9
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RPS3-208ENST00000527273 SYNJ1O43426 1573 aa20.67■□□□□ 0.9
RPS3-208ENST00000527273 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.67■□□□□ 0.9
RPS3-208ENST00000527273 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.64■□□□□ 0.9
RPS3-208ENST00000527273 TOP2BQ02880 1626 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS3-208ENST00000527273 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
RPS3-208ENST00000527273 ADAMTS12P58397 1594 aa20.51■□□□□ 0.87
RPS3-208ENST00000527273 GRIN2AQ12879 1464 aa20.49■□□□□ 0.87
RPS3-208ENST00000527273 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RPS3-208ENST00000527273 CEP170Q5SW79 1584 aa20.44■□□□□ 0.86
RPS3-208ENST00000527273 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.42■□□□□ 0.86
RPS3-208ENST00000527273 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.42■□□□□ 0.86
RPS3-208ENST00000527273 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.4■□□□□ 0.86
RPS3-208ENST00000527273 NUP160Q12769 1436 aa20.39■□□□□ 0.85
RPS3-208ENST00000527273 SHROOM2Q13796 1616 aa20.33■□□□□ 0.84
RPS3-208ENST00000527273 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS3-208ENST00000527273 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
RPS3-208ENST00000527273 JPH4Q96JJ6 628 aa20.2■□□□□ 0.82
RPS3-208ENST00000527273 KIF27Q86VH2 1401 aa20.19■□□□□ 0.82
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