RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414274.7

PTGES3-202, Transcript of prostaglandin E synthase 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTGES3, Length 1,547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGES3-202ENST00000414274 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.39■■■■□ 3.74
PTGES3-202ENST00000414274 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.05■■■■□ 3.04
PTGES3-202ENST00000414274 ABCC9O60706 1549 aa33.41■■■□□ 2.94
PTGES3-202ENST00000414274 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.27■■■□□ 2.76
PTGES3-202ENST00000414274 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.08■■■□□ 2.73
PTGES3-202ENST00000414274 NACADO15069 1562 aa32.03■■■□□ 2.72
PTGES3-202ENST00000414274 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
PTGES3-202ENST00000414274 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.78■■■□□ 2.68
PTGES3-202ENST00000414274 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.69■■■□□ 2.66
PTGES3-202ENST00000414274 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.34■■■□□ 2.61
PTGES3-202ENST00000414274 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.6
PTGES3-202ENST00000414274 SCRIBQ14160 1630 aa31.19■■■□□ 2.58
PTGES3-202ENST00000414274 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.09■■■□□ 2.57
PTGES3-202ENST00000414274 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.69■■■□□ 2.5
PTGES3-202ENST00000414274 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.61■■■□□ 2.49
PTGES3-202ENST00000414274 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
PTGES3-202ENST00000414274 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.16■■■□□ 2.42
PTGES3-202ENST00000414274 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.98■■■□□ 2.39
PTGES3-202ENST00000414274 SMARCA4P51532 1647 aa29.78■■■□□ 2.36
PTGES3-202ENST00000414274 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
PTGES3-202ENST00000414274 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.62■■■□□ 2.33
PTGES3-202ENST00000414274 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.61■■■□□ 2.33
PTGES3-202ENST00000414274 SMARCA2P51531 1590 aa29.57■■■□□ 2.32
PTGES3-202ENST00000414274 NCAPD3P42695 1498 aa29.56■■■□□ 2.32
PTGES3-202ENST00000414274 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.42■■■□□ 2.3
PTGES3-202ENST00000414274 HMGXB3Q12766 1538 aa29.4■■■□□ 2.3
PTGES3-202ENST00000414274 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
PTGES3-202ENST00000414274 WIZO95785 1651 aa29.31■■■□□ 2.28
PTGES3-202ENST00000414274 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
PTGES3-202ENST00000414274 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PTGES3-202ENST00000414274 NESP48681 1621 aa28.91■■■□□ 2.22
PTGES3-202ENST00000414274 ERCC6Q03468 1493 aa28.81■■■□□ 2.2
PTGES3-202ENST00000414274 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.78■■■□□ 2.2
PTGES3-202ENST00000414274 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
PTGES3-202ENST00000414274 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.74■■■□□ 2.19
PTGES3-202ENST00000414274 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.66■■■□□ 2.18
PTGES3-202ENST00000414274 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.63■■■□□ 2.17
PTGES3-202ENST00000414274 CFTRP13569 1480 aa28.55■■■□□ 2.16
PTGES3-202ENST00000414274 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.54■■■□□ 2.16
PTGES3-202ENST00000414274 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.42■■■□□ 2.14
PTGES3-202ENST00000414274 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.39■■■□□ 2.13
PTGES3-202ENST00000414274 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
PTGES3-202ENST00000414274 CUX2O14529 1486 aa28.38■■■□□ 2.13
PTGES3-202ENST00000414274 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.32■■■□□ 2.12
PTGES3-202ENST00000414274 PRDM2Q13029 1718 aa28.32■■■□□ 2.12
PTGES3-202ENST00000414274 WDR62O43379 1518 aa28.18■■■□□ 2.1
PTGES3-202ENST00000414274 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PTGES3-202ENST00000414274 TOPBP1Q92547 1522 aa27.97■■■□□ 2.07
PTGES3-202ENST00000414274 ABCC8Q09428 1581 aa27.94■■■□□ 2.06
PTGES3-202ENST00000414274 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.92■■■□□ 2.06
PTGES3-202ENST00000414274 CUX1P39880 1505 aa27.77■■■□□ 2.04
PTGES3-202ENST00000414274 IFT140Q96RY7 1462 aa27.77■■■□□ 2.04
PTGES3-202ENST00000414274 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
PTGES3-202ENST00000414274 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.69■■■□□ 2.02
PTGES3-202ENST00000414274 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
PTGES3-202ENST00000414274 SOGA1O94964 1423 aa27.66■■■□□ 2.02
PTGES3-202ENST00000414274 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.65■■■□□ 2.02
PTGES3-202ENST00000414274 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.02
PTGES3-202ENST00000414274 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
PTGES3-202ENST00000414274 SYNJ1O43426 1573 aa27.55■■■□□ 2
PTGES3-202ENST00000414274 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 25e-7■■■■□ 25
PTGES3-202ENST00000414274 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
PTGES3-202ENST00000414274 TOP2BQ02880 1626 aa27.53■■■□□ 2
PTGES3-202ENST00000414274 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
PTGES3-202ENST00000414274 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.51■■□□□ 1.99
PTGES3-202ENST00000414274 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.51■■□□□ 1.99
PTGES3-202ENST00000414274 WDR97A6NE52 1622 aa27.39■■□□□ 1.97
PTGES3-202ENST00000414274 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.38■■□□□ 1.97
PTGES3-202ENST00000414274 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.32■■□□□ 1.96
PTGES3-202ENST00000414274 FBLN2P98095 1184 aa27.31■■□□□ 1.96
PTGES3-202ENST00000414274 OSCARQ8IYS5 282 aa27.31■■□□□ 1.96
PTGES3-202ENST00000414274 GRIN2BQ13224 1484 aa27.3■■□□□ 1.96
PTGES3-202ENST00000414274 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.27■■□□□ 1.96
PTGES3-202ENST00000414274 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.26■■□□□ 1.95
PTGES3-202ENST00000414274 PBRM1Q86U86 1689 aa27.23■■□□□ 1.95
PTGES3-202ENST00000414274 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
PTGES3-202ENST00000414274 CHD1O14646 1710 aa27.19■■□□□ 1.94
PTGES3-202ENST00000414274 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
PTGES3-202ENST00000414274 TRIM41Q8WV44 630 aa27.11■■□□□ 1.93
PTGES3-202ENST00000414274 SYNJ2O15056 1496 aa27.1■■□□□ 1.93
PTGES3-202ENST00000414274 KIF27Q86VH2 1401 aa27.06■■□□□ 1.92
PTGES3-202ENST00000414274 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.05■■□□□ 1.92
PTGES3-202ENST00000414274 ADAMTS12P58397 1594 aa27.01■■□□□ 1.91
PTGES3-202ENST00000414274 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.99■■□□□ 1.91
PTGES3-202ENST00000414274 GRIN2AQ12879 1464 aa26.94■■□□□ 1.9
PTGES3-202ENST00000414274 IGF1RP08069 1367 aa26.93■■□□□ 1.9
PTGES3-202ENST00000414274 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.86■■□□□ 1.89
PTGES3-202ENST00000414274 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.85■■□□□ 1.89
PTGES3-202ENST00000414274 CUL7Q14999 1698 aa26.82■■□□□ 1.88
PTGES3-202ENST00000414274 ARHGEF11O15085 1522 aa26.81■■□□□ 1.88
PTGES3-202ENST00000414274 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.81■■□□□ 1.88
PTGES3-202ENST00000414274 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.81■■□□□ 1.88
PTGES3-202ENST00000414274 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.81■■□□□ 1.88
PTGES3-202ENST00000414274 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.8■■□□□ 1.88
PTGES3-202ENST00000414274 CEP170Q5SW79 1584 aa26.8■■□□□ 1.88
PTGES3-202ENST00000414274 NUP160Q12769 1436 aa26.79■■□□□ 1.88
PTGES3-202ENST00000414274 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.78■■□□□ 1.88
PTGES3-202ENST00000414274 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.66■■□□□ 1.86
PTGES3-202ENST00000414274 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.62■■□□□ 1.85
PTGES3-202ENST00000414274 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms