Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SEPT9-213ENST00000586433 569 ntTSL 413.61□□□□□ -0.234e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-238ENST00000591472 555 ntTSL 413.23□□□□□ -0.294e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-220ENST00000514830 802 ntTSL 213.23□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.325e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-213ENST00000482570 582 ntTSL 212.79□□□□□ -0.365e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 MEMO1-201ENST00000295065 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-235ENST00000591020 582 ntTSL 412.27□□□□□ -0.454e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-206ENST00000437932 5713 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.555e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 511.48□□□□□ -0.575e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-234ENST00000590938 611 ntTSL 411.36□□□□□ -0.594e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-210ENST00000508216 1794 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.685e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-236ENST00000521981 552 ntTSL 510.54□□□□□ -0.725e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-230ENST00000521250 592 ntTSL 410.5□□□□□ -0.735e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-223ENST00000627587 1853 ntTSL 210.21□□□□□ -0.785e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-207ENST00000503974 2081 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 39.91□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-213ENST00000509357 554 ntTSL 59.65□□□□□ -0.865e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 MEMO1-203ENST00000404530 1482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.895e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 AL020996.2-202ENST00000527604 334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.895e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.935e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SELENON-205ENST00000630065 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.955e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-222ENST00000615540 6219 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.965e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-238ENST00000521986 2393 ntTSL 28.46□□□□□ -1.065e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.15e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-227ENST00000521029 584 ntTSL 48.17□□□□□ -1.15e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-255ENST00000524202 3014 ntTSL 1 (best)8.05□□□□□ -1.125e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.185e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-246ENST00000523539 3236 ntTSL 27.5□□□□□ -1.215e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.225e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.265e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.285e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.295e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-217ENST00000519899 762 ntTSL 26.8□□□□□ -1.325e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-211ENST00000519361 553 ntTSL 56.8□□□□□ -1.325e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-250ENST00000523746 574 ntTSL 46.67□□□□□ -1.345e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-247ENST00000523670 542 ntTSL 46.15□□□□□ -1.425e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-215ENST00000519654 4129 ntTSL 1 (best)6.1□□□□□ -1.435e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.445e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.495e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.57e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-211ENST00000508531 480 ntTSL 45.49□□□□□ -1.535e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 DPY30-206ENST00000446765 1519 ntTSL 55.15□□□□□ -1.585e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.65e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-214ENST00000510099 554 ntTSL 45.05□□□□□ -1.65e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-210ENST00000519024 576 ntTSL 44.73□□□□□ -1.655e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-218ENST00000513341 794 ntTSL 34.05□□□□□ -1.765e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-245ENST00000523474 567 ntTSL 52.72□□□□□ -1.975e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.872e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.982e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 28.25□□□□□ -1.093e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.093e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBAP2-206ENST00000412543 1349 ntTSL 57.83□□□□□ -1.163e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.163e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 56.95□□□□□ -1.33e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 VARS-217ENST00000440048 804 ntTSL 1 (best)26.2■■□□□ 1.782e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.58e-7■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 FTCD-210ENST00000488577 447 ntTSL 321.65■■□□□ 1.064e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.015e-8■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.988e-7■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 MLF2-208ENST00000541305 564 ntTSL 220.46■□□□□ 0.878e-7■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 MLF2-205ENST00000537126 851 ntTSL 518.55■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 FADS1-215ENST00000541683 1844 ntTSL 218.37■□□□□ 0.534e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 TRIM28-205ENST00000595028 486 ntTSL 216.77■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 41.5
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PCBP1Q15365 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.155e-8■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 TNS3-210ENST00000469470 584 ntTSL 314.63□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 41.5
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PCBP1Q15365 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 TNS3-207ENST00000450444 1832 ntTSL 514.04□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.24e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RAP2C-203ENST00000460462 804 ntTSL 313.76□□□□□ -0.215e-8■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.324e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 COL4A5-202ENST00000361603 6469 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 COL4A5-201ENST00000328300 6483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.654e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 TNS3-208ENST00000457718 3836 ntTSL 510.75□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RNF43-207ENST00000583753 3560 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.764e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 TNS3-212ENST00000485555 357 ntTSL 39.58□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RAP2C-205ENST00000620646 3341 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.945e-8■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.154e-13■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.364e-13■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 NCSTN-212ENST00000469159 856 ntTSL 28.86□□□□□ -0.994e-13■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.652e-35■■■■■ 41.4
PCBP1Q15365 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-35■■■■■ 41.4
PCBP1Q15365 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.112e-35■■■■■ 41.4
PCBP1Q15365 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-35■■■■■ 41.4
PCBP1Q15365 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 41.3
PCBP1Q15365 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 41.3
PCBP1Q15365 SLC35A4-202ENST00000514199 3617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 41.3
PCBP1Q15365 C9orf16-202ENST00000486420 434 ntTSL 513.84□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 41.2
PCBP1Q15365 ARHGEF1-223ENST00000617585 737 ntTSL 224.93■■□□□ 1.581e-6■■■■■ 41.2
PCBP1Q15365 AC005307.1-201ENST00000567877 1570 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.733e-13■■■■■ 41.1
PCBP1Q15365 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 41.1
PCBP1Q15365 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.574e-8■■■■■ 41
PCBP1Q15365 DPM2-205ENST00000495270 1662 ntTSL 1 (best)17.8■□□□□ 0.444e-8■■■■■ 41
PCBP1Q15365 DPM2-203ENST00000470181 928 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 41
PCBP1Q15365 DPM2-204ENST00000473360 744 ntTSL 514.36□□□□□ -0.114e-8■■■■■ 41
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