RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488577.1

FTCD-210, Transcript of formimidoyltransferase cyclodeaminase, humanhuman

TSL 3

Gene FTCD, Length 447 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTCD-210ENST00000488577 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.53■■■■■ 5.2
FTCD-210ENST00000488577 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.29■■■■■ 4.36
FTCD-210ENST00000488577 ABCC9O60706 1549 aa41.53■■■■■ 4.24
FTCD-210ENST00000488577 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.9■■■■□ 3.98
FTCD-210ENST00000488577 NACADO15069 1562 aa39.84■■■■□ 3.97
FTCD-210ENST00000488577 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.79■■■■□ 3.96
FTCD-210ENST00000488577 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.58■■■■□ 3.93
FTCD-210ENST00000488577 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
FTCD-210ENST00000488577 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.35■■■■□ 3.89
FTCD-210ENST00000488577 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.9■■■■□ 3.82
FTCD-210ENST00000488577 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.81■■■■□ 3.82e-12■■■□□ 15.5
FTCD-210ENST00000488577 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.67■■■■□ 3.78
FTCD-210ENST00000488577 SCRIBQ14160 1630 aa38.56■■■■□ 3.76
FTCD-210ENST00000488577 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.33■■■■□ 3.73
FTCD-210ENST00000488577 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.26■■■■□ 3.72
FTCD-210ENST00000488577 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
FTCD-210ENST00000488577 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.55■■■■□ 3.6
FTCD-210ENST00000488577 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.36■■■■□ 3.57
FTCD-210ENST00000488577 SMARCA4P51532 1647 aa36.88■■■■□ 3.5
FTCD-210ENST00000488577 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
FTCD-210ENST00000488577 NCAPD3P42695 1498 aa36.78■■■■□ 3.48
FTCD-210ENST00000488577 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.76■■■■□ 3.48
FTCD-210ENST00000488577 SMARCA2P51531 1590 aa36.71■■■■□ 3.47
FTCD-210ENST00000488577 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.61■■■■□ 3.45
FTCD-210ENST00000488577 HMGXB3Q12766 1538 aa36.56■■■■□ 3.44
FTCD-210ENST00000488577 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.56■■■■□ 3.44
FTCD-210ENST00000488577 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
FTCD-210ENST00000488577 WIZO95785 1651 aa36.17■■■■□ 3.38
FTCD-210ENST00000488577 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
FTCD-210ENST00000488577 NESP48681 1621 aa35.88■■■■□ 3.33
FTCD-210ENST00000488577 ERCC6Q03468 1493 aa35.84■■■■□ 3.33
FTCD-210ENST00000488577 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
FTCD-210ENST00000488577 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.81■■■■□ 3.32
FTCD-210ENST00000488577 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.71■■■■□ 3.31
FTCD-210ENST00000488577 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.61■■■■□ 3.29
FTCD-210ENST00000488577 CUX2O14529 1486 aa35.52■■■■□ 3.28
FTCD-210ENST00000488577 CFTRP13569 1480 aa35.45■■■■□ 3.27
FTCD-210ENST00000488577 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.42■■■■□ 3.26
FTCD-210ENST00000488577 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.41■■■■□ 3.26
FTCD-210ENST00000488577 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
FTCD-210ENST00000488577 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.27■■■■□ 3.24
FTCD-210ENST00000488577 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.23■■■■□ 3.23
FTCD-210ENST00000488577 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.22■■■■□ 3.23
FTCD-210ENST00000488577 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
FTCD-210ENST00000488577 WDR62O43379 1518 aa35.1■■■■□ 3.21
FTCD-210ENST00000488577 PRDM2Q13029 1718 aa35.08■■■■□ 3.21
FTCD-210ENST00000488577 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
FTCD-210ENST00000488577 ABCC8Q09428 1581 aa34.71■■■■□ 3.15
FTCD-210ENST00000488577 TOPBP1Q92547 1522 aa34.68■■■■□ 3.14
FTCD-210ENST00000488577 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.62■■■■□ 3.13
FTCD-210ENST00000488577 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.62■■■■□ 3.13
FTCD-210ENST00000488577 IFT140Q96RY7 1462 aa34.52■■■■□ 3.12
FTCD-210ENST00000488577 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
FTCD-210ENST00000488577 CUX1P39880 1505 aa34.35■■■■□ 3.09
FTCD-210ENST00000488577 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
FTCD-210ENST00000488577 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
FTCD-210ENST00000488577 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.27■■■■□ 3.08
FTCD-210ENST00000488577 SOGA1O94964 1423 aa34.26■■■■□ 3.07
FTCD-210ENST00000488577 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.22■■■■□ 3.07
FTCD-210ENST00000488577 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
FTCD-210ENST00000488577 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.15■■■■□ 3.066e-11■■■■□ 22.1
FTCD-210ENST00000488577 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.12■■■■□ 3.05
FTCD-210ENST00000488577 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
FTCD-210ENST00000488577 OSCARQ8IYS5 282 aa34.06■■■■□ 3.04
FTCD-210ENST00000488577 WDR97A6NE52 1622 aa34.04■■■■□ 3.04
FTCD-210ENST00000488577 TOP2BQ02880 1626 aa34.02■■■■□ 3.04
FTCD-210ENST00000488577 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34■■■■□ 3.03
FTCD-210ENST00000488577 SYNJ1O43426 1573 aa33.98■■■■□ 3.03
FTCD-210ENST00000488577 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.95■■■■□ 3.03
FTCD-210ENST00000488577 GRIN2BQ13224 1484 aa33.88■■■■□ 3.01
FTCD-210ENST00000488577 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.85■■■■□ 3.01
FTCD-210ENST00000488577 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.82■■■■□ 3
FTCD-210ENST00000488577 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
FTCD-210ENST00000488577 FBLN2P98095 1184 aa33.79■■■■□ 3
FTCD-210ENST00000488577 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.79■■■■□ 3
FTCD-210ENST00000488577 CHD1O14646 1710 aa33.75■■■□□ 2.99
FTCD-210ENST00000488577 PBRM1Q86U86 1689 aa33.71■■■□□ 2.99
FTCD-210ENST00000488577 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
FTCD-210ENST00000488577 SYNJ2O15056 1496 aa33.67■■■□□ 2.98
FTCD-210ENST00000488577 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.54■■■□□ 2.96
FTCD-210ENST00000488577 ADAMTS12P58397 1594 aa33.48■■■□□ 2.95
FTCD-210ENST00000488577 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.46■■■□□ 2.95
FTCD-210ENST00000488577 ARHGEF11O15085 1522 aa33.45■■■□□ 2.95
FTCD-210ENST00000488577 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.43■■■□□ 2.94
FTCD-210ENST00000488577 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.43■■■□□ 2.94
FTCD-210ENST00000488577 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.43■■■□□ 2.94
FTCD-210ENST00000488577 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.43■■■□□ 2.94
FTCD-210ENST00000488577 KIF27Q86VH2 1401 aa33.43■■■□□ 2.94
FTCD-210ENST00000488577 GRIN2AQ12879 1464 aa33.43■■■□□ 2.94
FTCD-210ENST00000488577 TRIM41Q8WV44 630 aa33.39■■■□□ 2.94
FTCD-210ENST00000488577 IGF1RP08069 1367 aa33.31■■■□□ 2.92
FTCD-210ENST00000488577 NUP160Q12769 1436 aa33.29■■■□□ 2.92
FTCD-210ENST00000488577 CEP170Q5SW79 1584 aa33.23■■■□□ 2.91
FTCD-210ENST00000488577 CUL7Q14999 1698 aa33.18■■■□□ 2.9
FTCD-210ENST00000488577 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.18■■■□□ 2.9
FTCD-210ENST00000488577 ARAP1Q96P48 1450 aa33.17■■■□□ 2.9
FTCD-210ENST00000488577 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.1■■■□□ 2.89
FTCD-210ENST00000488577 SHROOM2Q13796 1616 aa33.02■■■□□ 2.88
FTCD-210ENST00000488577 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.02■■■□□ 2.88
FTCD-210ENST00000488577 JPH4Q96JJ6 628 aa32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms