Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CRB1P82279 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CRB1P82279 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CRB1P82279 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CRB1P82279 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CRB1P82279 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CRB1P82279 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CRB1P82279 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CRB1P82279 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CRB1P82279 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CRB1P82279 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CRB1P82279 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CRB1P82279 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CRB1P82279 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CRB1P82279 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CRB1P82279 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CRB1P82279 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CRB1P82279 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CRB1P82279 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CRB1P82279 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CRB1P82279 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CRB1P82279 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CRB1P82279 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CRB1P82279 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CRB1P82279 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CRB1P82279 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CRB1P82279 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CRB1P82279 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CRB1P82279 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CRB1P82279 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CRB1P82279 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CRB1P82279 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CRB1P82279 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CRB1P82279 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CRB1P82279 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CRB1P82279 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CRB1P82279 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CRB1P82279 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CRB1P82279 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CRB1P82279 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CRB1P82279 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CRB1P82279 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CRB1P82279 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CRB1P82279 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CRB1P82279 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CRB1P82279 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CRB1P82279 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CRB1P82279 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CRB1P82279 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CRB1P82279 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CRB1P82279 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CRB1P82279 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CRB1P82279 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CRB1P82279 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CRB1P82279 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CRB1P82279 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CRB1P82279 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CRB1P82279 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CRB1P82279 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CRB1P82279 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CRB1P82279 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CRB1P82279 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CRB1P82279 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CRB1P82279 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CRB1P82279 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CRB1P82279 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CRB1P82279 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CRB1P82279 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CRB1P82279 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CRB1P82279 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CRB1P82279 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CRB1P82279 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CRB1P82279 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CRB1P82279 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CRB1P82279 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CRB1P82279 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CRB1P82279 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CRB1P82279 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CRB1P82279 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CRB1P82279 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CRB1P82279 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CRB1P82279 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CRB1P82279 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CRB1P82279 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CRB1P82279 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CRB1P82279 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CRB1P82279 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CRB1P82279 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CRB1P82279 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CRB1P82279 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CRB1P82279 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CRB1P82279 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CRB1P82279 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CRB1P82279 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CRB1P82279 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CRB1P82279 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CRB1P82279 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CRB1P82279 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CRB1P82279 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CRB1P82279 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms