RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395566.8

MDK-203, Transcript of midkine, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDK, Length 828 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDK-203ENST00000395566 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.51■■■■■ 6.96
MDK-203ENST00000395566 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.43■■■■■ 5.98
MDK-203ENST00000395566 ABCC9O60706 1549 aa52.3■■■■■ 5.96
MDK-203ENST00000395566 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.79■■■■■ 5.56
MDK-203ENST00000395566 NACADO15069 1562 aa49.47■■■■■ 5.51
MDK-203ENST00000395566 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.26■■■■■ 5.48
MDK-203ENST00000395566 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.89■■■■■ 5.42
MDK-203ENST00000395566 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.82■■■■■ 5.41
MDK-203ENST00000395566 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.8■■■■■ 5.4
MDK-203ENST00000395566 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.7■■■■■ 5.39
MDK-203ENST00000395566 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.56■■■■■ 5.36
MDK-203ENST00000395566 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.43■■■■■ 5.34
MDK-203ENST00000395566 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.28■■■■■ 5.32
MDK-203ENST00000395566 SCRIBQ14160 1630 aa47.88■■■■■ 5.25
MDK-203ENST00000395566 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.64■■■■■ 5.22
MDK-203ENST00000395566 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.25■■■■■ 5.15
MDK-203ENST00000395566 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.19■■■■■ 5.14
MDK-203ENST00000395566 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.05■■■■■ 5.12
MDK-203ENST00000395566 NCAPD3P42695 1498 aa45.67■■■■■ 4.9
MDK-203ENST00000395566 SMARCA4P51532 1647 aa45.64■■■■■ 4.9
MDK-203ENST00000395566 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.6■■■■■ 4.89
MDK-203ENST00000395566 SMARCA2P51531 1590 aa45.45■■■■■ 4.87
MDK-203ENST00000395566 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.38■■■■■ 4.86
MDK-203ENST00000395566 HMGXB3Q12766 1538 aa45.38■■■■■ 4.86
MDK-203ENST00000395566 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
MDK-203ENST00000395566 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.16■■■■■ 4.82
MDK-203ENST00000395566 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.15■■■■■ 4.82
MDK-203ENST00000395566 ERCC6Q03468 1493 aa45.08■■■■■ 4.81
MDK-203ENST00000395566 NESP48681 1621 aa45.01■■■■■ 4.8
MDK-203ENST00000395566 CUX2O14529 1486 aa44.91■■■■■ 4.78
MDK-203ENST00000395566 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.64■■■■■ 4.74
MDK-203ENST00000395566 WIZO95785 1651 aa44.64■■■■■ 4.74
MDK-203ENST00000395566 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.63■■■■■ 4.73
MDK-203ENST00000395566 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.52■■■■■ 4.72
MDK-203ENST00000395566 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.45■■■■■ 4.71
MDK-203ENST00000395566 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.31■■■■■ 4.68
MDK-203ENST00000395566 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.29■■■■■ 4.68
MDK-203ENST00000395566 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.24■■■■■ 4.67
MDK-203ENST00000395566 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
MDK-203ENST00000395566 MRC2Q9UBG0 1479 aa44■■■■■ 4.63
MDK-203ENST00000395566 WDR62O43379 1518 aa43.9■■■■■ 4.62
MDK-203ENST00000395566 CFTRP13569 1480 aa43.85■■■■■ 4.61
MDK-203ENST00000395566 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.85■■■■■ 4.61
MDK-203ENST00000395566 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.83■■■■■ 4.61
MDK-203ENST00000395566 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.52■■■■■ 4.56
MDK-203ENST00000395566 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
MDK-203ENST00000395566 PRDM2Q13029 1718 aa43.5■■■■■ 4.55
MDK-203ENST00000395566 TOPBP1Q92547 1522 aa43.04■■■■■ 4.48
MDK-203ENST00000395566 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.96■■■■■ 4.47
MDK-203ENST00000395566 IFT140Q96RY7 1462 aa42.94■■■■■ 4.47
MDK-203ENST00000395566 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.9■■■■■ 4.46
MDK-203ENST00000395566 ABCC8Q09428 1581 aa42.83■■■■■ 4.45
MDK-203ENST00000395566 OSCARQ8IYS5 282 aa42.83■■■■■ 4.45
MDK-203ENST00000395566 TRIM41Q8WV44 630 aa42.83■■■■■ 4.45
MDK-203ENST00000395566 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
MDK-203ENST00000395566 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
MDK-203ENST00000395566 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
MDK-203ENST00000395566 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.55■■■■■ 4.41e-9■■■■■ 32.7
MDK-203ENST00000395566 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.49■■■■■ 4.39
MDK-203ENST00000395566 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
MDK-203ENST00000395566 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.41■■■■■ 4.38
MDK-203ENST00000395566 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.41■■■■■ 4.38
MDK-203ENST00000395566 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.41■■■■■ 4.38
MDK-203ENST00000395566 CUX1P39880 1505 aa42.41■■■■■ 4.38
MDK-203ENST00000395566 CHD1O14646 1710 aa42.4■■■■■ 4.38
MDK-203ENST00000395566 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.39■■■■■ 4.38
MDK-203ENST00000395566 SOGA1O94964 1423 aa42.37■■■■■ 4.37
MDK-203ENST00000395566 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
MDK-203ENST00000395566 ARHGEF11O15085 1522 aa42.27■■■■■ 4.36
MDK-203ENST00000395566 FBLN2P98095 1184 aa42.17■■■■■ 4.34
MDK-203ENST00000395566 WDR97A6NE52 1622 aa42.15■■■■■ 4.34
MDK-203ENST00000395566 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.14■■■■■ 4.34
MDK-203ENST00000395566 GRIN2BQ13224 1484 aa41.98■■■■■ 4.31
MDK-203ENST00000395566 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
MDK-203ENST00000395566 PBRM1Q86U86 1689 aa41.93■■■■■ 4.3
MDK-203ENST00000395566 ARAP1Q96P48 1450 aa41.89■■■■■ 4.3
MDK-203ENST00000395566 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.88■■■■■ 4.29
MDK-203ENST00000395566 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.88■■■■■ 4.29
MDK-203ENST00000395566 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.88■■■■■ 4.29
MDK-203ENST00000395566 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.88■■■■■ 4.29
MDK-203ENST00000395566 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.86■■■■■ 4.29
MDK-203ENST00000395566 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
MDK-203ENST00000395566 SYNJ2O15056 1496 aa41.84■■■■■ 4.29
MDK-203ENST00000395566 SYNJ1O43426 1573 aa41.81■■■■■ 4.28
MDK-203ENST00000395566 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.76■■■■■ 4.28
MDK-203ENST00000395566 TOP2BQ02880 1626 aa41.74■■■■■ 4.27
MDK-203ENST00000395566 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.7■■■■■ 4.27
MDK-203ENST00000395566 ADAMTS12P58397 1594 aa41.54■■■■■ 4.24
MDK-203ENST00000395566 GRIN2AQ12879 1464 aa41.48■■■■■ 4.23
MDK-203ENST00000395566 CEP170Q5SW79 1584 aa41.38■■■■■ 4.22
MDK-203ENST00000395566 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.34■■■■■ 4.21
MDK-203ENST00000395566 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
MDK-203ENST00000395566 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.33■■■■■ 4.21
MDK-203ENST00000395566 NUP160Q12769 1436 aa41.33■■■■■ 4.21
MDK-203ENST00000395566 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.31■■■■■ 4.2
MDK-203ENST00000395566 SHROOM2Q13796 1616 aa41.16■■■■■ 4.18
MDK-203ENST00000395566 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.96■■■■■ 4.15
MDK-203ENST00000395566 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
MDK-203ENST00000395566 KIF27Q86VH2 1401 aa40.86■■■■■ 4.13
MDK-203ENST00000395566 IGF1RP08069 1367 aa40.85■■■■■ 4.13
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