RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375850.3

C9orf47-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 47, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene C9orf47, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47-202ENST00000375850 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.17■■■■■ 6.9
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C9orf47-202ENST00000375850 TRIM41Q8WV44 630 aa43■■■■■ 4.47
C9orf47-202ENST00000375850 IFT140Q96RY7 1462 aa42.94■■■■■ 4.46
C9orf47-202ENST00000375850 ABCC8Q09428 1581 aa42.9■■■■■ 4.46
C9orf47-202ENST00000375850 TOPBP1Q92547 1522 aa42.84■■■■■ 4.45
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C9orf47-202ENST00000375850 ARHGEF11O15085 1522 aa42.28■■■■■ 4.36
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C9orf47-202ENST00000375850 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.18■■■■■ 4.34
C9orf47-202ENST00000375850 WDR97A6NE52 1622 aa42.17■■■■■ 4.34
C9orf47-202ENST00000375850 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.12■■■■■ 4.33
C9orf47-202ENST00000375850 CHD1O14646 1710 aa42.12■■■■■ 4.33
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C9orf47-202ENST00000375850 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.95■■■■■ 4.31
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C9orf47-202ENST00000375850 CEP170Q5SW79 1584 aa41.11■■■■■ 4.17
C9orf47-202ENST00000375850 SHROOM2Q13796 1616 aa40.99■■■■■ 4.15
C9orf47-202ENST00000375850 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.98■■■■■ 4.15
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C9orf47-202ENST00000375850 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.68■■■■■ 4.1
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