Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUPL2O15504 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUPL2O15504 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUPL2O15504 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms