Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPBO95292 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPBO95292 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPBO95292 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPBO95292 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPBO95292 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPBO95292 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPBO95292 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPBO95292 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms