Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VAPBO95292 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
VAPBO95292 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
VAPBO95292 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
VAPBO95292 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
VAPBO95292 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
VAPBO95292 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
VAPBO95292 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
VAPBO95292 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
VAPBO95292 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
VAPBO95292 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
VAPBO95292 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
VAPBO95292 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VAPBO95292 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
VAPBO95292 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
VAPBO95292 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
VAPBO95292 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
VAPBO95292 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
VAPBO95292 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
VAPBO95292 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
VAPBO95292 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VAPBO95292 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
VAPBO95292 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
VAPBO95292 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
VAPBO95292 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
VAPBO95292 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
VAPBO95292 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
VAPBO95292 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
VAPBO95292 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
VAPBO95292 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
VAPBO95292 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
VAPBO95292 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VAPBO95292 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
VAPBO95292 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
VAPBO95292 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
VAPBO95292 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
VAPBO95292 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
VAPBO95292 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
VAPBO95292 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
VAPBO95292 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
VAPBO95292 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
VAPBO95292 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VAPBO95292 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VAPBO95292 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VAPBO95292 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VAPBO95292 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VAPBO95292 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VAPBO95292 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VAPBO95292 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VAPBO95292 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VAPBO95292 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VAPBO95292 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VAPBO95292 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VAPBO95292 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VAPBO95292 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VAPBO95292 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VAPBO95292 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VAPBO95292 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VAPBO95292 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VAPBO95292 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAPBO95292 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VAPBO95292 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
VAPBO95292 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VAPBO95292 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAPBO95292 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAPBO95292 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VAPBO95292 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VAPBO95292 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAPBO95292 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VAPBO95292 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VAPBO95292 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VAPBO95292 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VAPBO95292 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
VAPBO95292 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VAPBO95292 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VAPBO95292 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VAPBO95292 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VAPBO95292 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VAPBO95292 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VAPBO95292 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VAPBO95292 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VAPBO95292 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VAPBO95292 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VAPBO95292 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VAPBO95292 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAPBO95292 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAPBO95292 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
VAPBO95292 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VAPBO95292 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VAPBO95292 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VAPBO95292 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAPBO95292 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
VAPBO95292 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAPBO95292 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAPBO95292 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VAPBO95292 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VAPBO95292 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VAPBO95292 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VAPBO95292 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VAPBO95292 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms