Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CIC-205ENST00000573349 927 ntTSL 220.63■□□□□ 0.891e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 EWSR1-218ENST00000483629 1818 ntTSL 519.55■□□□□ 0.721e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 CIC-206ENST00000575287 846 ntTSL 318.53■□□□□ 0.561e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 GDI1-211ENST00000481304 1014 ntTSL 1 (best)18.42■□□□□ 0.541e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 EWSR1-221ENST00000610553 2300 ntTSL 217.25■□□□□ 0.351e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 EWSR1-215ENST00000469669 2630 ntTSL 216.03■□□□□ 0.161e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 GDI1-208ENST00000471972 534 ntTSL 212.98□□□□□ -0.331e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 CIC-202ENST00000571033 458 ntTSL 212.88□□□□□ -0.351e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 GDI1-213ENST00000489589 918 ntTSL 212.67□□□□□ -0.381e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 YTHDC2-201ENST00000161863 6316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.661e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 VEGFA-214ENST00000493786 551 ntTSL 28.38□□□□□ -1.071e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 YTHDC2-205ENST00000512600 6708 ntTSL 24.74□□□□□ -1.651e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.863e-6■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 KDM3B-207ENST00000510866 6324 ntTSL 1 (best)7.4□□□□□ -1.223e-6■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 KDM3B-204ENST00000507996 3034 ntTSL 26.06□□□□□ -1.443e-6■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.573e-6■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 BCAM-204ENST00000588714 723 ntTSL 216.22■□□□□ 0.191e-8■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SLC16A3-205ENST00000578574 958 ntTSL 226.55■■□□□ 1.842e-20■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SLC16A3-212ENST00000581642 557 ntTSL 420.12■□□□□ 0.812e-20■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.261e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 RACK1-229ENST00000513027 697 ntTSL 313.5□□□□□ -0.257e-27■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 RACK1-218ENST00000508044 554 ntTSL 511.73□□□□□ -0.537e-27■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 RACK1-234ENST00000515417 873 ntTSL 310.68□□□□□ -0.77e-27■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.419e-9■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SPTAN1-211ENST00000625980 1713 ntTSL 213.93□□□□□ -0.182e-8■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SPTAN1-229ENST00000636010 1472 ntTSL 512.71□□□□□ -0.382e-8■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SPTAN1-220ENST00000630147 785 ntTSL 211.6□□□□□ -0.552e-8■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.692e-8■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SPTAN1-221ENST00000630763 1503 ntTSL 210.64□□□□□ -0.712e-8■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-8■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.922e-8■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-8■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 MAGI1-207ENST00000470990 2138 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.022e-8■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.092e-8■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 TALDO1-202ENST00000528070 856 ntTSL 519.94■□□□□ 0.781e-14■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-6■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 TMEM123-203ENST00000525577 550 ntTSL 44.47□□□□□ -1.691e-6■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 TMEM123-206ENST00000529492 549 ntTSL 23.03□□□□□ -1.921e-6■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SPPL2B-210ENST00000614784 1411 ntTSL 1 (best)19.71■□□□□ 0.756e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SPPL2B-214ENST00000622308 749 ntTSL 1 (best)19.11■□□□□ 0.656e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SPPL2B-208ENST00000612623 495 ntTSL 518.59■□□□□ 0.576e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SPPL2B-206ENST00000593243 551 ntTSL 417.39■□□□□ 0.376e-7■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 ATP1A1-207ENST00000479960 611 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-15■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.485e-9■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.375e-9■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.225e-9■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.445e-9■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 ATXN2-210ENST00000483311 4159 ntTSL 1 (best)12.22□□□□□ -0.455e-9■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.145e-9■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.425e-9■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SERPINA1-215ENST00000556955 571 ntTSL 415.39■□□□□ 0.051e-61■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 RACK1-230ENST00000513060 1651 ntTSL 514.95□□□□□ -0.025e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RACK1-226ENST00000511900 922 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.545e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.65e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RACK1-224ENST00000511473 1150 ntTSL 510.89□□□□□ -0.675e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RACK1-225ENST00000511566 825 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.675e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RACK1-205ENST00000502905 643 ntTSL 310.71□□□□□ -0.695e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RACK1-219ENST00000508682 1208 ntTSL 510.7□□□□□ -0.75e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RACK1-210ENST00000504325 1098 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.755e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RACK1-228ENST00000512968 1058 ntTSL 510.1□□□□□ -0.795e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RACK1-211ENST00000504726 388 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.845e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RACK1-217ENST00000507756 889 ntTSL 59.53□□□□□ -0.885e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RACK1-222ENST00000509535 456 ntTSL 39.44□□□□□ -0.95e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.925e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RACK1-209ENST00000504128 990 ntTSL 29.28□□□□□ -0.925e-8■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.482e-29■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-29■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 CIZ1-222ENST00000491487 339 ntTSL 216.25■□□□□ 0.194e-7■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 CIZ1-219ENST00000485001 596 ntTSL 312.9□□□□□ -0.344e-7■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 CIZ1-213ENST00000471839 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.19□□□□□ -0.624e-7■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 BCAM-205ENST00000589558 611 ntTSL 222.27■■□□□ 1.162e-11■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 HLF-205ENST00000572234 298 ntTSL 53.6□□□□□ -1.832e-11■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 KRT8-213ENST00000550170 2202 ntTSL 518.51■□□□□ 0.553e-7■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.443e-7■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.413e-7■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 KRT8-203ENST00000546583 2862 ntTSL 515.18■□□□□ 0.023e-7■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 FTH1-211ENST00000534719 788 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.031e-70■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 FTH1-209ENST00000533138 885 ntTSL 512.57□□□□□ -0.41e-70■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 FTH1-204ENST00000529548 567 ntTSL 311.25□□□□□ -0.611e-70■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 TPM3-202ENST00000302206 741 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.342e-16■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.872e-6■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.212e-6■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.122e-6■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 221.88■■□□□ 1.092e-6■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.872e-6■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 520.26■□□□□ 0.832e-6■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 519.94■□□□□ 0.782e-6■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.572e-6■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 217.73■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.43■□□□□ 0.862e-7■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-7■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 RPL10-211ENST00000467168 802 ntTSL 211.74□□□□□ -0.531e-13■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.568e-13■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 FKBP4-207ENST00000544366 287 ntTSL 34.63□□□□□ -1.678e-13■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 SERPINA1-214ENST00000556091 643 ntTSL 313.84□□□□□ -0.196e-38■□□□□ 10.5
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