RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491487.1

CIZ1-222, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CIZ1, Length 339 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1-222ENST00000491487 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.24■■■■□ 3.39
CIZ1-222ENST00000491487 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.15■■■□□ 2.74
CIZ1-222ENST00000491487 ABCC9O60706 1549 aa31.54■■■□□ 2.64
CIZ1-222ENST00000491487 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CIZ1-222ENST00000491487 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.2■■■□□ 2.43
CIZ1-222ENST00000491487 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.2■■■□□ 2.43
CIZ1-222ENST00000491487 NACADO15069 1562 aa30.17■■■□□ 2.42
CIZ1-222ENST00000491487 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.97■■■□□ 2.39
CIZ1-222ENST00000491487 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.9■■■□□ 2.38
CIZ1-222ENST00000491487 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.78■■■□□ 2.36
CIZ1-222ENST00000491487 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.52■■■□□ 2.32
CIZ1-222ENST00000491487 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.5■■■□□ 2.31
CIZ1-222ENST00000491487 SCRIBQ14160 1630 aa29.45■■■□□ 2.3
CIZ1-222ENST00000491487 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.1■■■□□ 2.25
CIZ1-222ENST00000491487 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.87■■■□□ 2.21
CIZ1-222ENST00000491487 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CIZ1-222ENST00000491487 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.52■■■□□ 2.16
CIZ1-222ENST00000491487 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.37■■■□□ 2.13
CIZ1-222ENST00000491487 SMARCA4P51532 1647 aa28.14■■■□□ 2.09
CIZ1-222ENST00000491487 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.03■■■□□ 2.08
CIZ1-222ENST00000491487 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CIZ1-222ENST00000491487 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.96■■■□□ 2.07
CIZ1-222ENST00000491487 NCAPD3P42695 1498 aa27.89■■■□□ 2.06
CIZ1-222ENST00000491487 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.82■■■□□ 2.04
CIZ1-222ENST00000491487 SMARCA2P51531 1590 aa27.82■■■□□ 2.04
CIZ1-222ENST00000491487 WIZO95785 1651 aa27.75■■■□□ 2.03
CIZ1-222ENST00000491487 HMGXB3Q12766 1538 aa27.74■■■□□ 2.03
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CIZ1-222ENST00000491487 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.12■■□□□ 1.93
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CIZ1-222ENST00000491487 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.06■■□□□ 1.92
CIZ1-222ENST00000491487 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.03■■□□□ 1.92
CIZ1-222ENST00000491487 ERCC6Q03468 1493 aa27.01■■□□□ 1.91
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CIZ1-222ENST00000491487 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.78■■□□□ 1.88
CIZ1-222ENST00000491487 PRDM2Q13029 1718 aa26.76■■□□□ 1.87
CIZ1-222ENST00000491487 CUX2O14529 1486 aa26.72■■□□□ 1.87
CIZ1-222ENST00000491487 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.7■■□□□ 1.87
CIZ1-222ENST00000491487 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.68■■□□□ 1.86
CIZ1-222ENST00000491487 WDR62O43379 1518 aa26.63■■□□□ 1.85
CIZ1-222ENST00000491487 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CIZ1-222ENST00000491487 TOPBP1Q92547 1522 aa26.39■■□□□ 1.82
CIZ1-222ENST00000491487 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.33■■□□□ 1.8
CIZ1-222ENST00000491487 CUX1P39880 1505 aa26.27■■□□□ 1.8
CIZ1-222ENST00000491487 ABCC8Q09428 1581 aa26.2■■□□□ 1.78
CIZ1-222ENST00000491487 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CIZ1-222ENST00000491487 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CIZ1-222ENST00000491487 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CIZ1-222ENST00000491487 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.13■■□□□ 1.77
CIZ1-222ENST00000491487 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.12■■□□□ 1.77
CIZ1-222ENST00000491487 IFT140Q96RY7 1462 aa26.12■■□□□ 1.77
CIZ1-222ENST00000491487 SYNJ1O43426 1573 aa26.07■■□□□ 1.76
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CIZ1-222ENST00000491487 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26■■□□□ 1.75
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CIZ1-222ENST00000491487 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
CIZ1-222ENST00000491487 TOP2BQ02880 1626 aa25.98■■□□□ 1.75
CIZ1-222ENST00000491487 WDR97A6NE52 1622 aa25.97■■□□□ 1.75
CIZ1-222ENST00000491487 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.96■■□□□ 1.75
CIZ1-222ENST00000491487 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CIZ1-222ENST00000491487 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.82■■□□□ 1.72
CIZ1-222ENST00000491487 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.78■■□□□ 1.72
CIZ1-222ENST00000491487 CHD1O14646 1710 aa25.74■■□□□ 1.71
CIZ1-222ENST00000491487 PBRM1Q86U86 1689 aa25.74■■□□□ 1.71
CIZ1-222ENST00000491487 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.72■■□□□ 1.71
CIZ1-222ENST00000491487 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.71■■□□□ 1.71
CIZ1-222ENST00000491487 GRIN2BQ13224 1484 aa25.67■■□□□ 1.7
CIZ1-222ENST00000491487 OSCARQ8IYS5 282 aa25.61■■□□□ 1.69
CIZ1-222ENST00000491487 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CIZ1-222ENST00000491487 FBLN2P98095 1184 aa25.55■■□□□ 1.68
CIZ1-222ENST00000491487 ADAMTS12P58397 1594 aa25.52■■□□□ 1.68
CIZ1-222ENST00000491487 SYNJ2O15056 1496 aa25.51■■□□□ 1.67
CIZ1-222ENST00000491487 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.47■■□□□ 1.67
CIZ1-222ENST00000491487 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.45■■□□□ 1.66
CIZ1-222ENST00000491487 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CIZ1-222ENST00000491487 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.42■■□□□ 1.66
CIZ1-222ENST00000491487 IGF1RP08069 1367 aa25.4■■□□□ 1.66
CIZ1-222ENST00000491487 GRIN2AQ12879 1464 aa25.39■■□□□ 1.65
CIZ1-222ENST00000491487 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.37■■□□□ 1.65
CIZ1-222ENST00000491487 KIF27Q86VH2 1401 aa25.37■■□□□ 1.65
CIZ1-222ENST00000491487 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.37■■□□□ 1.65
CIZ1-222ENST00000491487 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.37■■□□□ 1.65
CIZ1-222ENST00000491487 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.37■■□□□ 1.65
CIZ1-222ENST00000491487 CEP170Q5SW79 1584 aa25.36■■□□□ 1.65
CIZ1-222ENST00000491487 TRIM41Q8WV44 630 aa25.33■■□□□ 1.65
CIZ1-222ENST00000491487 ARHGEF11O15085 1522 aa25.32■■□□□ 1.64
CIZ1-222ENST00000491487 NUP160Q12769 1436 aa25.29■■□□□ 1.64
CIZ1-222ENST00000491487 CUL7Q14999 1698 aa25.23■■□□□ 1.63
CIZ1-222ENST00000491487 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.21■■□□□ 1.63
CIZ1-222ENST00000491487 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.21■■□□□ 1.63
CIZ1-222ENST00000491487 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.18■■□□□ 1.62
CIZ1-222ENST00000491487 ARAP1Q96P48 1450 aa25.17■■□□□ 1.62
CIZ1-222ENST00000491487 SHROOM2Q13796 1616 aa25.14■■□□□ 1.61
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