Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CA1-223ENST00000524324 675 ntTSL 28.6□□□□□ -1.038e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-209ENST00000505922 555 ntTSL 58.38□□□□□ -1.073e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.078e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.088e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CA1-220ENST00000523712 574 ntTSL 28.21□□□□□ -1.18e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PAN2-217ENST00000551359 4685 ntTSL 57.77□□□□□ -1.173e-11■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.268e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.268e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.268e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.33e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.39e-13■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.378e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.379e-13■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.388e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.468e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.468e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-215ENST00000549780 801 ntTSL 55.81□□□□□ -1.488e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CA1-213ENST00000521679 606 ntTSL 35.8□□□□□ -1.488e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-212ENST00000549253 563 ntTSL 35.57□□□□□ -1.528e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-214ENST00000549546 820 ntTSL 55.57□□□□□ -1.528e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CA1-204ENST00000517618 832 ntTSL 1 (best)5.41□□□□□ -1.548e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 UGCG-205ENST00000495085 772 ntTSL 35□□□□□ -1.618e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-218ENST00000509246 495 ntTSL 24.95□□□□□ -1.623e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-207ENST00000503016 720 ntTSL 34.83□□□□□ -1.643e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-208ENST00000504654 552 ntTSL 33.82□□□□□ -1.83e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-222ENST00000511102 688 ntTSL 23.77□□□□□ -1.813e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.992e-8■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 MRPL4-211ENST00000592514 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 525.44■■□□□ 1.662e-8■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.122e-8■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.772e-8■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.13e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 LGALS3BP-212ENST00000588899 668 ntTSL 318.87■□□□□ 0.617e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 LGALS3BP-213ENST00000588990 618 ntTSL 518.77■□□□□ 0.67e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.393e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 LGALS3BP-209ENST00000588205 581 ntTSL 317.32■□□□□ 0.367e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 LGALS3BP-217ENST00000591274 379 ntTSL 517.01■□□□□ 0.317e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ANPEP-209ENST00000560137 638 ntTSL 316.85■□□□□ 0.293e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.093e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.033e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 RNASE4-202ENST00000555597 1341 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.433e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 LRP5-205ENST00000529702 586 ntTSL 312.23□□□□□ -0.457e-15■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 LRP5-204ENST00000529481 551 ntTSL 310.38□□□□□ -0.757e-15■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 RNASE4-201ENST00000397995 853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.833e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ANPEP-205ENST00000559874 663 ntTSL 39.55□□□□□ -0.883e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ANG-203ENST00000554073 251 ntTSL 33.3□□□□□ -1.883e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.84e-27■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.884e-27■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.394e-27■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ACTG1-205ENST00000572105 1168 ntTSL 515.47■□□□□ 0.074e-27■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ACTG1-215ENST00000576917 1958 ntTSL 514.45□□□□□ -0.14e-27■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.164e-27■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ACTG1-213ENST00000576214 1024 ntTSL 514.02□□□□□ -0.174e-27■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.224e-27■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ACTG1-214ENST00000576544 1720 ntTSL 513.58□□□□□ -0.244e-27■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ACTG1-212ENST00000576209 1698 ntTSL 1 (best)13.26□□□□□ -0.294e-27■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.974e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.724e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SERPINA1-211ENST00000553327 581 ntTSL 312.48□□□□□ -0.411e-323■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PGGHG-208ENST00000529087 745 ntTSL 219.89■□□□□ 0.772e-9■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 MED15-220ENST00000461076 826 ntTSL 315.22■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 FAM117A-210ENST00000514018 1128 ntTSL 519.62■□□□□ 0.732e-6■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 FAM117A-205ENST00000505159 739 ntTSL 316.85■□□□□ 0.292e-6■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 FAM117A-204ENST00000503855 582 ntTSL 313.24□□□□□ -0.292e-6■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.561e-9■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 RPLP0-227ENST00000552902 869 ntTSL 221.88■■□□□ 1.091e-10■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 RPLP0-223ENST00000551783 676 ntTSL 221.41■■□□□ 1.021e-10■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 RPLP0-216ENST00000550296 562 ntTSL 214.01□□□□□ -0.171e-10■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 RPLP0-215ENST00000549242 518 ntTSL 213.46□□□□□ -0.251e-10■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 RPLP0-217ENST00000550423 561 ntTSL 312.53□□□□□ -0.41e-10■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 RPLP0-224ENST00000551914 402 ntTSL 311.61□□□□□ -0.551e-10■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 RPLP0-208ENST00000547191 680 ntTSL 511.34□□□□□ -0.591e-10■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 RPLP0-212ENST00000548551 543 ntTSL 211.16□□□□□ -0.621e-10■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 RPLP0-211ENST00000548495 651 ntTSL 310.61□□□□□ -0.711e-10■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-214ENST00000503282 584 ntTSL 224.36■■□□□ 1.499e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-229ENST00000510129 582 ntTSL 323.78■■□□□ 1.49e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.399e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-216ENST00000503742 1977 ntTSL 1 (best)22.72■■□□□ 1.239e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-220ENST00000505307 743 ntTSL 522.3■■□□□ 1.169e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-215ENST00000503418 662 ntTSL 421.59■■□□□ 1.059e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-213ENST00000502690 599 ntTSL 418.89■□□□□ 0.619e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-228ENST00000508974 568 ntTSL 416.38■□□□□ 0.219e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.169e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-231ENST00000513098 702 ntTSL 314.05□□□□□ -0.169e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.259e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-232ENST00000514755 593 ntTSL 412.15□□□□□ -0.469e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-209ENST00000394804 4166 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.519e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-206ENST00000357194 660 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.599e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-227ENST00000508818 584 ntTSL 211.23□□□□□ -0.619e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.769e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-208ENST00000394803 2227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.769e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-223ENST00000508249 604 ntTSL 410.19□□□□□ -0.789e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-203ENST00000343106 2389 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.819e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-222ENST00000508238 547 ntTSL 48.88□□□□□ -0.999e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.19e-7■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.23e-12■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.043e-12■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.13e-12■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 RBP4-204ENST00000629763 838 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.53e-12■□□□□ 10.8
PCBP1Q15365 APOBEC3C-202ENST00000428892 1056 ntTSL 311.93□□□□□ -0.57e-19■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 EWSR1-205ENST00000360091 1289 ntTSL 521.82■■□□□ 1.081e-7■□□□□ 10.7
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