RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555835.2

RNASE4-203, Transcript of ribonuclease A family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNASE4, Length 2,520 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE4-203ENST00000555835 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.1■■■□□ 2.73
RNASE4-203ENST00000555835 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.56■■■□□ 2
RNASE4-203ENST00000555835 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
RNASE4-203ENST00000555835 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.85■■□□□ 1.89
RNASE4-203ENST00000555835 HRCP23327 699 aa26.47■■□□□ 1.83
RNASE4-203ENST00000555835 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.46■■□□□ 1.83
RNASE4-203ENST00000555835 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.44■■□□□ 1.82
RNASE4-203ENST00000555835 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
RNASE4-203ENST00000555835 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.95■■□□□ 1.74
RNASE4-203ENST00000555835 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.89■■□□□ 1.74
RNASE4-203ENST00000555835 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
RNASE4-203ENST00000555835 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.8■■□□□ 1.72
RNASE4-203ENST00000555835 SCRIBQ14160 1630 aa25.58■■□□□ 1.69
RNASE4-203ENST00000555835 ABCC9O60706 1549 aa25.58■■□□□ 1.68
RNASE4-203ENST00000555835 NACADO15069 1562 aa25.53■■□□□ 1.68
RNASE4-203ENST00000555835 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
RNASE4-203ENST00000555835 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RNASE4-203ENST00000555835 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
RNASE4-203ENST00000555835 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.15■■□□□ 1.62
RNASE4-203ENST00000555835 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.11■■□□□ 1.61
RNASE4-203ENST00000555835 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
RNASE4-203ENST00000555835 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.96■■□□□ 1.59
RNASE4-203ENST00000555835 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
RNASE4-203ENST00000555835 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.87■■□□□ 1.57
RNASE4-203ENST00000555835 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.76■■□□□ 1.55
RNASE4-203ENST00000555835 WIZO95785 1651 aa24.72■■□□□ 1.55
RNASE4-203ENST00000555835 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
RNASE4-203ENST00000555835 TRIM41Q8WV44 630 aa24.52■■□□□ 1.52
RNASE4-203ENST00000555835 SMARCA4P51532 1647 aa24.52■■□□□ 1.52
RNASE4-203ENST00000555835 MYT1Q01538 1121 aa24.46■■□□□ 1.51
RNASE4-203ENST00000555835 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.44■■□□□ 1.5
RNASE4-203ENST00000555835 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
RNASE4-203ENST00000555835 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
RNASE4-203ENST00000555835 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
RNASE4-203ENST00000555835 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
RNASE4-203ENST00000555835 NEUROD1Q13562 356 aa24.3■■□□□ 1.48
RNASE4-203ENST00000555835 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.23■■□□□ 1.47
RNASE4-203ENST00000555835 SMARCA2P51531 1590 aa24.23■■□□□ 1.47
RNASE4-203ENST00000555835 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
RNASE4-203ENST00000555835 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.16■■□□□ 1.46
RNASE4-203ENST00000555835 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.15■■□□□ 1.46
RNASE4-203ENST00000555835 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
RNASE4-203ENST00000555835 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.04■■□□□ 1.44
RNASE4-203ENST00000555835 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
RNASE4-203ENST00000555835 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
RNASE4-203ENST00000555835 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
RNASE4-203ENST00000555835 ABCC8Q09428 1581 aa23.99■■□□□ 1.43
RNASE4-203ENST00000555835 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.95■■□□□ 1.42
RNASE4-203ENST00000555835 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
RNASE4-203ENST00000555835 SOGA1O94964 1423 aa23.71■■□□□ 1.39
RNASE4-203ENST00000555835 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
RNASE4-203ENST00000555835 EEA1Q15075 1411 aa23.68■■□□□ 1.38
RNASE4-203ENST00000555835 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
RNASE4-203ENST00000555835 NCAPD3P42695 1498 aa23.59■■□□□ 1.37
RNASE4-203ENST00000555835 SYNJ1O43426 1573 aa23.59■■□□□ 1.37
RNASE4-203ENST00000555835 HMGXB3Q12766 1538 aa23.59■■□□□ 1.37
RNASE4-203ENST00000555835 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.59■■□□□ 1.37
RNASE4-203ENST00000555835 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.58■■□□□ 1.37
RNASE4-203ENST00000555835 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RNASE4-203ENST00000555835 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.51■■□□□ 1.35
RNASE4-203ENST00000555835 CEP162Q5TB80 1403 aa23.47■■□□□ 1.35
RNASE4-203ENST00000555835 GOLGA3Q08378 1498 aa23.43■■□□□ 1.34
RNASE4-203ENST00000555835 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
RNASE4-203ENST00000555835 TOP2BQ02880 1626 aa23.4■■□□□ 1.34
RNASE4-203ENST00000555835 MIER1Q8N108 512 aa23.39■■□□□ 1.34
RNASE4-203ENST00000555835 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RNASE4-203ENST00000555835 KIF21BO75037 1637 aa23.36■■□□□ 1.33
RNASE4-203ENST00000555835 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.35■■□□□ 1.33
RNASE4-203ENST00000555835 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.34■■□□□ 1.33
RNASE4-203ENST00000555835 CFTRP13569 1480 aa23.29■■□□□ 1.32
RNASE4-203ENST00000555835 CUX1P39880 1505 aa23.2■■□□□ 1.3
RNASE4-203ENST00000555835 PRDM2Q13029 1718 aa23.17■■□□□ 1.3
RNASE4-203ENST00000555835 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.16■■□□□ 1.3
RNASE4-203ENST00000555835 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.12■■□□□ 1.29
RNASE4-203ENST00000555835 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.12■■□□□ 1.29
RNASE4-203ENST00000555835 CLIP1P30622 1438 aa23.11■■□□□ 1.29
RNASE4-203ENST00000555835 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.07■■□□□ 1.28
RNASE4-203ENST00000555835 PRXQ9BXM0 1461 aa23.06■■□□□ 1.28
RNASE4-203ENST00000555835 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.06■■□□□ 1.28
RNASE4-203ENST00000555835 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
RNASE4-203ENST00000555835 KIF27Q86VH2 1401 aa23.02■■□□□ 1.28
RNASE4-203ENST00000555835 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RNASE4-203ENST00000555835 VPS8Q8N3P4 1428 aa23■■□□□ 1.27
RNASE4-203ENST00000555835 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.95■■□□□ 1.26
RNASE4-203ENST00000555835 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.92■■□□□ 1.26
RNASE4-203ENST00000555835 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RNASE4-203ENST00000555835 CUX2O14529 1486 aa22.83■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.83■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 APLP2Q06481 763 aa22.82■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.82■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 BCL11AQ9H165 835 aa22.81■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 ARAP1Q96P48 1450 aa22.79■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 IGF1RP08069 1367 aa22.78■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.71■■□□□ 1.23
RNASE4-203ENST00000555835 NESP48681 1621 aa22.7■■□□□ 1.22
RNASE4-203ENST00000555835 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.68■■□□□ 1.22
RNASE4-203ENST00000555835 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.67■■□□□ 1.22
RNASE4-203ENST00000555835 TOPBP1Q92547 1522 aa22.66■■□□□ 1.22
RNASE4-203ENST00000555835 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RNASE4-203ENST00000555835 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.65■■□□□ 1.22
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