Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DYNC1LI1Q9Y6G9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI1Q9Y6G9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms