Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP9O75884 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP9O75884 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP9O75884 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP9O75884 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP9O75884 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP9O75884 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP9O75884 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBBP9O75884 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RBBP9O75884 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP9O75884 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP9O75884 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP9O75884 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RBBP9O75884 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP9O75884 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP9O75884 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP9O75884 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP9O75884 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP9O75884 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RBBP9O75884 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP9O75884 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP9O75884 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP9O75884 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP9O75884 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP9O75884 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP9O75884 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP9O75884 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP9O75884 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP9O75884 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP9O75884 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP9O75884 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP9O75884 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP9O75884 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP9O75884 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP9O75884 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP9O75884 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP9O75884 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP9O75884 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP9O75884 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP9O75884 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP9O75884 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP9O75884 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP9O75884 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP9O75884 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP9O75884 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP9O75884 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP9O75884 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP9O75884 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP9O75884 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP9O75884 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP9O75884 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP9O75884 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP9O75884 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP9O75884 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms