RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.22■■■■□ 3.87
PTPRM-201ENST00000332175 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
PTPRM-201ENST00000332175 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.4■■■■□ 3.42
PTPRM-201ENST00000332175 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.3■■■■□ 3.4
PTPRM-201ENST00000332175 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.86■■■■□ 3.33
PTPRM-201ENST00000332175 APLP2Q06481 763 aa35.29■■■■□ 3.24
PTPRM-201ENST00000332175 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
PTPRM-201ENST00000332175 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
PTPRM-201ENST00000332175 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
PTPRM-201ENST00000332175 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
PTPRM-201ENST00000332175 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.47■■■■□ 3.11
PTPRM-201ENST00000332175 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM41Q8WV44 630 aa34.05■■■■□ 3.04
PTPRM-201ENST00000332175 ERICH6Q7L0X2 663 aa34.03■■■■□ 3.04
PTPRM-201ENST00000332175 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
PTPRM-201ENST00000332175 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
PTPRM-201ENST00000332175 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
PTPRM-201ENST00000332175 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
PTPRM-201ENST00000332175 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
PTPRM-201ENST00000332175 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
PTPRM-201ENST00000332175 NEFLP07196 543 aa33.36■■■□□ 2.93
PTPRM-201ENST00000332175 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.21■■■□□ 2.91
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
PTPRM-201ENST00000332175 ITGAEP38570 1179 aa33.08■■■□□ 2.89
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
PTPRM-201ENST00000332175 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.06■■■□□ 2.88
PTPRM-201ENST00000332175 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
PTPRM-201ENST00000332175 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.82■■■□□ 2.85
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
PTPRM-201ENST00000332175 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
PTPRM-201ENST00000332175 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
PTPRM-201ENST00000332175 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.52■■■□□ 2.8
PTPRM-201ENST00000332175 MYT1Q01538 1121 aa32.43■■■□□ 2.78
PTPRM-201ENST00000332175 HRCP23327 699 aa32.35■■■□□ 2.77
PTPRM-201ENST00000332175 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM52Q96A61 297 aa31.97■■■□□ 2.71
PTPRM-201ENST00000332175 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.97■■■□□ 2.71
PTPRM-201ENST00000332175 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.91■■■□□ 2.7
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
PTPRM-201ENST00000332175 NEUROD1Q13562 356 aa31.85■■■□□ 2.69
PTPRM-201ENST00000332175 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
PTPRM-201ENST00000332175 FBLN2P98095 1184 aa31.67■■■□□ 2.66
PTPRM-201ENST00000332175 ABCC9O60706 1549 aa31.64■■■□□ 2.66
PTPRM-201ENST00000332175 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
PTPRM-201ENST00000332175 BCANQ96GW7 911 aa31.55■■■□□ 2.64
PTPRM-201ENST00000332175 SLC24A1O60721 1099 aa31.5■■■□□ 2.63
PTPRM-201ENST00000332175 BCL11AQ9H165 835 aa31.49■■■□□ 2.63
PTPRM-201ENST00000332175 ARID3CA6NKF2 412 aa31.44■■■□□ 2.62
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
PTPRM-201ENST00000332175 ANP32CO43423 234 aa31.33■■■□□ 2.61
PTPRM-201ENST00000332175 P3H3Q8IVL6 736 aa31.31■■■□□ 2.6
PTPRM-201ENST00000332175 CANXP27824 592 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
PTPRM-201ENST00000332175 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa31.08■■■□□ 2.57
PTPRM-201ENST00000332175 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
PTPRM-201ENST00000332175 NEFMP07197 916 aa31.03■■■□□ 2.56
PTPRM-201ENST00000332175 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.97■■■□□ 2.55
PTPRM-201ENST00000332175 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
PTPRM-201ENST00000332175 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
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PTPRM-201ENST00000332175 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.72■■■□□ 2.51
PTPRM-201ENST00000332175 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.7■■■□□ 2.51
PTPRM-201ENST00000332175 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
PTPRM-201ENST00000332175 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
PTPRM-201ENST00000332175 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.472e-6■■■□□ 15.5
PTPRM-201ENST00000332175 TONSLQ96HA7 1378 aa30.46■■■□□ 2.47
PTPRM-201ENST00000332175 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.43■■■□□ 2.46
PTPRM-201ENST00000332175 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.43■■■□□ 2.46
PTPRM-201ENST00000332175 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.42■■■□□ 2.46
PTPRM-201ENST00000332175 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
PTPRM-201ENST00000332175 FKBP8Q14318 412 aa30.39■■■□□ 2.46
PTPRM-201ENST00000332175 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
PTPRM-201ENST00000332175 SCRIBQ14160 1630 aa30.36■■■□□ 2.45
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.34■■■□□ 2.45
PTPRM-201ENST00000332175 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
PTPRM-201ENST00000332175 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
PTPRM-201ENST00000332175 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
PTPRM-201ENST00000332175 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.24■■■□□ 2.43
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHG5O94827 1062 aa30.18■■■□□ 2.42
PTPRM-201ENST00000332175 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
PTPRM-201ENST00000332175 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0G2JS52 829 aa30.16■■■□□ 2.42
PTPRM-201ENST00000332175 TMC1Q8TDI8 760 aa30.14■■■□□ 2.41
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB7CA1YPR0 619 aa30.12■■■□□ 2.41
PTPRM-201ENST00000332175 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP30.1■■■□□ 2.41
PTPRM-201ENST00000332175 ARXQ96QS3 562 aa30.02■■■□□ 2.4
PTPRM-201ENST00000332175 TSPY4P0CV99 314 aa30.01■■■□□ 2.4
PTPRM-201ENST00000332175 TSPY10P0CW01 314 aa30.01■■■□□ 2.4
PTPRM-201ENST00000332175 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
PTPRM-201ENST00000332175 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC136Q96JN2 1154 aa30■■■□□ 2.39
PTPRM-201ENST00000332175 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
PTPRM-201ENST00000332175 C14orf37Q86TY3 774 aa29.95■■■□□ 2.39
PTPRM-201ENST00000332175 MRS2Q9HD23 443 aa29.95■■■□□ 2.38
PTPRM-201ENST00000332175 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PTPRM-201ENST00000332175 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPRM-201ENST00000332175 NBR1Q14596 966 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPRM-201ENST00000332175 KCNH8Q96L42 1107 aa29.89■■■□□ 2.37
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