Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20BO75063 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20BO75063 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20BO75063 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20BO75063 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20BO75063 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20BO75063 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20BO75063 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20BO75063 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20BO75063 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20BO75063 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM20BO75063 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM20BO75063 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms