Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 USP33-209ENST00000481579 2866 ntTSL 26.26□□□□□ -1.415e-10■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.765e-10■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.868e-7■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 ASH2L-204ENST00000517719 656 ntTSL 320.18■□□□□ 0.822e-9■■■■■ 173.8
UTP3Q9NQZ2 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 173.7
UTP3Q9NQZ2 HERC2P3-205ENST00000428453 4383 ntTSL 211.84□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 173.7
UTP3Q9NQZ2 HERC2P3-209ENST00000437318 4161 ntTSL 1 (best)9.1□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 173.7
UTP3Q9NQZ2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.555e-7■■■■■ 173.6
UTP3Q9NQZ2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.597e-7■■■■■ 173.6
UTP3Q9NQZ2 IFT140-202ENST00000397417 4023 ntTSL 512.73□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 173.6
UTP3Q9NQZ2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.384e-7■■■■■ 173.6
UTP3Q9NQZ2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 173.6
UTP3Q9NQZ2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 173.6
UTP3Q9NQZ2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 173.6
UTP3Q9NQZ2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 173.6
UTP3Q9NQZ2 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 173.4
UTP3Q9NQZ2 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.996e-8■■■■■ 173.4
UTP3Q9NQZ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.192e-6■■■■■ 173.4
UTP3Q9NQZ2 SSU72-203ENST00000378725 619 ntTSL 220.05■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 173.4
UTP3Q9NQZ2 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 173.3
UTP3Q9NQZ2 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 173.3
UTP3Q9NQZ2 ACSF2-218ENST00000510410 1745 ntTSL 226.4■■□□□ 1.823e-6■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.53e-6■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.373e-6■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ACSF2-206ENST00000503408 554 ntTSL 422.49■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ACSF2-211ENST00000506582 594 ntTSL 519.26■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ACSF2-208ENST00000504945 544 ntTSL 219.26■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.179e-7■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.389e-7■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.42e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 VDAC1-204ENST00000425992 703 ntTSL 325.31■■□□□ 1.642e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.592e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.542e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF362-203ENST00000483388 712 ntTSL 224.61■■□□□ 1.532e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PEMT-208ENST00000472446 473 ntTSL 324.59■■□□□ 1.532e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PEMT-207ENST00000461404 591 ntTSL 524.5■■□□□ 1.512e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.482e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.14■■□□□ 1.452e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.422e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PEMT-212ENST00000580147 708 ntTSL 323.89■■□□□ 1.412e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM62-214ENST00000569926 500 ntTSL 323.66■■□□□ 1.382e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TFEB-213ENST00000425401 281 ntTSL 1 (best)23.41■■□□□ 1.342e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.312e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 CPZ-205ENST00000506287 906 ntTSL 322.86■■□□□ 1.255e-22■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.212e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.162e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-217ENST00000457212 905 ntTSL 521.99■■□□□ 1.112e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 Z98749.2-206ENST00000381645 938 ntTSL 221.85■■□□□ 1.092e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.062e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TFEB-208ENST00000416140 1022 ntTSL 521.4■■□□□ 1.022e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-210ENST00000426266 936 ntTSL 321.39■■□□□ 1.012e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.992e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 RCSD1-201ENST00000361496 822 ntTSL 321.17■□□□□ 0.982e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-207ENST00000416319 1113 ntTSL 521.15■□□□□ 0.982e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.962e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.952e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.942e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.932e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-211ENST00000433619 706 ntTSL 520.49■□□□□ 0.872e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.872e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 BX322557.1-201ENST00000454115 389 ntTSL 1 (best)20.42■□□□□ 0.862e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.862e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 SLC44A2-208ENST00000588465 1487 ntTSL 1 (best)20.37■□□□□ 0.852e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-214ENST00000442929 500 ntTSL 320.32■□□□□ 0.842e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.842e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-218ENST00000460834 455 ntTSL 320.28■□□□□ 0.842e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 RHBDF1-207ENST00000472390 577 ntTSL 420.14■□□□□ 0.812e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.791e-14■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.782e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.782e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.772e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.772e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-212ENST00000434658 1817 ntTSL 519.85■□□□□ 0.772e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 CHMP1A-207ENST00000549328 1003 ntTSL 319.75■□□□□ 0.752e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 CHMP1A-203ENST00000547614 653 ntTSL 219.75■□□□□ 0.752e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PRKCD-204ENST00000477794 404 ntTSL 319.74■□□□□ 0.752e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PEAR1-205ENST00000465101 980 ntTSL 219.63■□□□□ 0.732e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TFEB-210ENST00000419574 984 ntTSL 319.54■□□□□ 0.722e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.712e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 UBXN2B-205ENST00000523409 1225 ntTSL 519.37■□□□□ 0.692e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 DECR2-207ENST00000461749 2062 ntTSL 219.15■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.657e-8■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 GRSF1-202ENST00000499044 2491 ntTSL 219.03■□□□□ 0.642e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 LST1-220ENST00000464526 1832 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.632e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 SLC19A1-208ENST00000468508 1435 ntTSL 218.72■□□□□ 0.592e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM62-208ENST00000567441 627 ntTSL 318.68■□□□□ 0.582e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-216ENST00000449971 1056 ntTSL 518.66■□□□□ 0.582e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 ITPR1-214ENST00000487016 697 ntTSL 318.64■□□□□ 0.572e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-222ENST00000621967 1901 ntTSL 218.59■□□□□ 0.572e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FRMD4A-202ENST00000342409 1741 ntTSL 218.57■□□□□ 0.562e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.552e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 PEAR1-206ENST00000469390 4470 ntTSL 218.49■□□□□ 0.552e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.552e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 CHMP1A-205ENST00000548650 566 ntTSL 318.41■□□□□ 0.542e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TPM2-205ENST00000471212 1363 ntTSL 218.35■□□□□ 0.532e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.532e-11■■■■■ 173.1
UTP3Q9NQZ2 TFEB-209ENST00000419396 914 ntTSL 518.31■□□□□ 0.522e-11■■■■■ 173.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 613.9 ms