RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580147.5

PEMT-212, Transcript of phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

TSL 3

Gene PEMT, Length 708 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMT-212ENST00000580147 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.68■■■■■ 6.66
PEMT-212ENST00000580147 ABCC9O60706 1549 aa50.95■■■■■ 5.75
PEMT-212ENST00000580147 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.7■■■■■ 5.71
PEMT-212ENST00000580147 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.39■■■■■ 5.34
PEMT-212ENST00000580147 NACADO15069 1562 aa48.08■■■■■ 5.29
PEMT-212ENST00000580147 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.05■■■■■ 5.28
PEMT-212ENST00000580147 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.96■■■■■ 5.27
PEMT-212ENST00000580147 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.55■■■■■ 5.2
PEMT-212ENST00000580147 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.42■■■■■ 5.18
PEMT-212ENST00000580147 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.1■■■■■ 5.13
PEMT-212ENST00000580147 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.98■■■■■ 5.11
PEMT-212ENST00000580147 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.93■■■■■ 5.1
PEMT-212ENST00000580147 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.79■■■■■ 5.08
PEMT-212ENST00000580147 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.36■■■■■ 5.01
PEMT-212ENST00000580147 SCRIBQ14160 1630 aa46.28■■■■■ 5
PEMT-212ENST00000580147 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.94■■■■■ 4.94
PEMT-212ENST00000580147 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.91■■■■■ 4.94
PEMT-212ENST00000580147 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
PEMT-212ENST00000580147 NCAPD3P42695 1498 aa44.47■■■■■ 4.71
PEMT-212ENST00000580147 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.3■■■■■ 4.68
PEMT-212ENST00000580147 SMARCA4P51532 1647 aa44.13■■■■■ 4.66
PEMT-212ENST00000580147 SMARCA2P51531 1590 aa44.12■■■■■ 4.65
PEMT-212ENST00000580147 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.09■■■■■ 4.65
PEMT-212ENST00000580147 HMGXB3Q12766 1538 aa44.03■■■■■ 4.64
PEMT-212ENST00000580147 ERCC6Q03468 1493 aa44■■■■■ 4.63
PEMT-212ENST00000580147 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
PEMT-212ENST00000580147 CUX2O14529 1486 aa43.91■■■■■ 4.62
PEMT-212ENST00000580147 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
PEMT-212ENST00000580147 NESP48681 1621 aa43.74■■■■■ 4.59
PEMT-212ENST00000580147 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.73■■■■■ 4.59
PEMT-212ENST00000580147 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.67■■■■■ 4.58
PEMT-212ENST00000580147 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.37■■■■■ 4.53
PEMT-212ENST00000580147 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.23■■■■■ 4.51
PEMT-212ENST00000580147 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
PEMT-212ENST00000580147 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.16■■■■■ 4.5
PEMT-212ENST00000580147 WIZO95785 1651 aa43.06■■■■■ 4.48
PEMT-212ENST00000580147 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.01■■■■■ 4.48
PEMT-212ENST00000580147 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
PEMT-212ENST00000580147 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.81■■■■■ 4.44
PEMT-212ENST00000580147 WDR62O43379 1518 aa42.65■■■■■ 4.42
PEMT-212ENST00000580147 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.62■■■■■ 4.41
PEMT-212ENST00000580147 CFTRP13569 1480 aa42.6■■■■■ 4.41
PEMT-212ENST00000580147 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.6■■■■■ 4.41
PEMT-212ENST00000580147 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
PEMT-212ENST00000580147 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
PEMT-212ENST00000580147 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.16■■■■■ 4.34
PEMT-212ENST00000580147 TRIM41Q8WV44 630 aa42.12■■■■■ 4.33
PEMT-212ENST00000580147 OSCARQ8IYS5 282 aa42.05■■■■■ 4.32
PEMT-212ENST00000580147 PRDM2Q13029 1718 aa41.86■■■■■ 4.29
PEMT-212ENST00000580147 IFT140Q96RY7 1462 aa41.8■■■■■ 4.28
PEMT-212ENST00000580147 TOPBP1Q92547 1522 aa41.76■■■■■ 4.28
PEMT-212ENST00000580147 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
PEMT-212ENST00000580147 ABCC8Q09428 1581 aa41.69■■■■■ 4.26
PEMT-212ENST00000580147 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.55■■■■■ 4.24
PEMT-212ENST00000580147 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.4■■■■■ 4.22
PEMT-212ENST00000580147 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.22
PEMT-212ENST00000580147 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
PEMT-212ENST00000580147 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
PEMT-212ENST00000580147 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.29■■■■■ 4.2
PEMT-212ENST00000580147 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.29■■■■■ 4.2
PEMT-212ENST00000580147 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.29■■■■■ 4.2
PEMT-212ENST00000580147 SOGA1O94964 1423 aa41.23■■■■■ 4.19
PEMT-212ENST00000580147 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.22■■■■■ 4.19
PEMT-212ENST00000580147 FBLN2P98095 1184 aa41.21■■■■■ 4.19
PEMT-212ENST00000580147 ARHGEF11O15085 1522 aa41.21■■■■■ 4.19
PEMT-212ENST00000580147 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
PEMT-212ENST00000580147 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.07■■■■■ 4.17
PEMT-212ENST00000580147 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.07■■■■■ 4.16
PEMT-212ENST00000580147 CUX1P39880 1505 aa41.02■■■■■ 4.16
PEMT-212ENST00000580147 CHD1O14646 1710 aa41.01■■■■■ 4.16
PEMT-212ENST00000580147 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
PEMT-212ENST00000580147 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.91■■■■■ 4.14
PEMT-212ENST00000580147 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
PEMT-212ENST00000580147 WDR97A6NE52 1622 aa40.89■■■■■ 4.14
PEMT-212ENST00000580147 GRIN2BQ13224 1484 aa40.83■■■■■ 4.13
PEMT-212ENST00000580147 ARAP1Q96P48 1450 aa40.83■■■■■ 4.13
PEMT-212ENST00000580147 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
PEMT-212ENST00000580147 SYNJ2O15056 1496 aa40.69■■■■■ 4.1
PEMT-212ENST00000580147 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.68■■■■■ 4.1
PEMT-212ENST00000580147 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.66■■■■■ 4.1
PEMT-212ENST00000580147 SYNJ1O43426 1573 aa40.64■■■■■ 4.1
PEMT-212ENST00000580147 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
PEMT-212ENST00000580147 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.61■■■■■ 4.09
PEMT-212ENST00000580147 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.5■■■■■ 4.07
PEMT-212ENST00000580147 PBRM1Q86U86 1689 aa40.46■■■■■ 4.07
PEMT-212ENST00000580147 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.45■■■■■ 4.07
PEMT-212ENST00000580147 TOP2BQ02880 1626 aa40.3■■■■■ 4.04
PEMT-212ENST00000580147 GRIN2AQ12879 1464 aa40.27■■■■■ 4.04
PEMT-212ENST00000580147 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.24■■■■■ 4.03
PEMT-212ENST00000580147 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.18■■■■■ 4.02
PEMT-212ENST00000580147 NUP160Q12769 1436 aa40.16■■■■■ 4.02
PEMT-212ENST00000580147 ADAMTS12P58397 1594 aa40.16■■■■■ 4.02
PEMT-212ENST00000580147 CEP170Q5SW79 1584 aa40.08■■■■■ 4.01
PEMT-212ENST00000580147 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.07■■■■■ 4.01
PEMT-212ENST00000580147 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.05■■■■■ 4
PEMT-212ENST00000580147 JPH4Q96JJ6 628 aa39.88■■■■□ 3.97
PEMT-212ENST00000580147 SHROOM2Q13796 1616 aa39.87■■■■□ 3.97
PEMT-212ENST00000580147 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
PEMT-212ENST00000580147 IGF1RP08069 1367 aa39.69■■■■□ 3.94
PEMT-212ENST00000580147 KIF27Q86VH2 1401 aa39.63■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms