RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361496.3

RCSD1-201, Transcript of RCSD domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene RCSD1, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1-201ENST00000361496 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.61■■■■■ 5.37
RCSD1-201ENST00000361496 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.28■■■■■ 4.52
RCSD1-201ENST00000361496 ABCC9O60706 1549 aa42.8■■■■■ 4.44
RCSD1-201ENST00000361496 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.96■■■■■ 4.15
RCSD1-201ENST00000361496 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.96■■■■■ 4.15
RCSD1-201ENST00000361496 NACADO15069 1562 aa40.83■■■■■ 4.13
RCSD1-201ENST00000361496 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.44■■■■■ 4.06
RCSD1-201ENST00000361496 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
RCSD1-201ENST00000361496 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.15■■■■■ 4.02
RCSD1-201ENST00000361496 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.01■■■■■ 4
RCSD1-201ENST00000361496 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40■■■■□ 3.99
RCSD1-201ENST00000361496 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.72■■■■□ 3.95
RCSD1-201ENST00000361496 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.65■■■■□ 3.94
RCSD1-201ENST00000361496 SCRIBQ14160 1630 aa39.54■■■■□ 3.92
RCSD1-201ENST00000361496 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.21■■■■□ 3.87
RCSD1-201ENST00000361496 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
RCSD1-201ENST00000361496 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.65■■■■□ 3.78
RCSD1-201ENST00000361496 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.47■■■■□ 3.75
RCSD1-201ENST00000361496 SMARCA4P51532 1647 aa37.76■■■■□ 3.64
RCSD1-201ENST00000361496 NCAPD3P42695 1498 aa37.71■■■■□ 3.63
RCSD1-201ENST00000361496 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
RCSD1-201ENST00000361496 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.68■■■■□ 3.62
RCSD1-201ENST00000361496 SMARCA2P51531 1590 aa37.59■■■■□ 3.61
RCSD1-201ENST00000361496 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.46■■■■□ 3.59
RCSD1-201ENST00000361496 HMGXB3Q12766 1538 aa37.43■■■■□ 3.58
RCSD1-201ENST00000361496 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.37■■■■□ 3.57
RCSD1-201ENST00000361496 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
RCSD1-201ENST00000361496 WIZO95785 1651 aa37.05■■■■□ 3.52
RCSD1-201ENST00000361496 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
RCSD1-201ENST00000361496 NESP48681 1621 aa36.92■■■■□ 3.5
RCSD1-201ENST00000361496 ERCC6Q03468 1493 aa36.91■■■■□ 3.5
RCSD1-201ENST00000361496 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.74■■■■□ 3.47
RCSD1-201ENST00000361496 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.63■■■■□ 3.45
RCSD1-201ENST00000361496 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
RCSD1-201ENST00000361496 CUX2O14529 1486 aa36.58■■■■□ 3.45
RCSD1-201ENST00000361496 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.56■■■■□ 3.44
RCSD1-201ENST00000361496 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.42■■■■□ 3.42
RCSD1-201ENST00000361496 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
RCSD1-201ENST00000361496 CFTRP13569 1480 aa36.3■■■■□ 3.4
RCSD1-201ENST00000361496 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.24■■■■□ 3.39
RCSD1-201ENST00000361496 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.18■■■■□ 3.38
RCSD1-201ENST00000361496 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.16■■■■□ 3.38
RCSD1-201ENST00000361496 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.15■■■■□ 3.38
RCSD1-201ENST00000361496 WDR62O43379 1518 aa36.02■■■■□ 3.36
RCSD1-201ENST00000361496 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.96■■■■□ 3.35
RCSD1-201ENST00000361496 PRDM2Q13029 1718 aa35.92■■■■□ 3.34
RCSD1-201ENST00000361496 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
RCSD1-201ENST00000361496 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
RCSD1-201ENST00000361496 TOPBP1Q92547 1522 aa35.56■■■■□ 3.28
RCSD1-201ENST00000361496 ABCC8Q09428 1581 aa35.55■■■■□ 3.28
RCSD1-201ENST00000361496 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.46■■■■□ 3.27
RCSD1-201ENST00000361496 IFT140Q96RY7 1462 aa35.41■■■■□ 3.26
RCSD1-201ENST00000361496 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
RCSD1-201ENST00000361496 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
RCSD1-201ENST00000361496 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
RCSD1-201ENST00000361496 CUX1P39880 1505 aa35.16■■■■□ 3.22
RCSD1-201ENST00000361496 SOGA1O94964 1423 aa35.15■■■■□ 3.22
RCSD1-201ENST00000361496 OSCARQ8IYS5 282 aa35.14■■■■□ 3.22
RCSD1-201ENST00000361496 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.12■■■■□ 3.21
RCSD1-201ENST00000361496 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.1■■■■□ 3.21
RCSD1-201ENST00000361496 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.09■■■■□ 3.214e-6■■■■■ 31
RCSD1-201ENST00000361496 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
RCSD1-201ENST00000361496 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
RCSD1-201ENST00000361496 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.84■■■■□ 3.17
RCSD1-201ENST00000361496 FBLN2P98095 1184 aa34.83■■■■□ 3.17
RCSD1-201ENST00000361496 WDR97A6NE52 1622 aa34.82■■■■□ 3.16
RCSD1-201ENST00000361496 TOP2BQ02880 1626 aa34.74■■■■□ 3.15
RCSD1-201ENST00000361496 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.73■■■■□ 3.15
RCSD1-201ENST00000361496 SYNJ1O43426 1573 aa34.73■■■■□ 3.15
RCSD1-201ENST00000361496 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.73■■■■□ 3.15
RCSD1-201ENST00000361496 CHD1O14646 1710 aa34.72■■■■□ 3.15
RCSD1-201ENST00000361496 GRIN2BQ13224 1484 aa34.72■■■■□ 3.15
RCSD1-201ENST00000361496 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.71■■■■□ 3.15
RCSD1-201ENST00000361496 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.7■■■■□ 3.15
RCSD1-201ENST00000361496 TRIM41Q8WV44 630 aa34.68■■■■□ 3.14
RCSD1-201ENST00000361496 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
RCSD1-201ENST00000361496 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
RCSD1-201ENST00000361496 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.58■■■■□ 3.13
RCSD1-201ENST00000361496 PBRM1Q86U86 1689 aa34.57■■■■□ 3.13
RCSD1-201ENST00000361496 SYNJ2O15056 1496 aa34.52■■■■□ 3.12
RCSD1-201ENST00000361496 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.5■■■■□ 3.11
RCSD1-201ENST00000361496 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.5■■■■□ 3.11
RCSD1-201ENST00000361496 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.5■■■■□ 3.11
RCSD1-201ENST00000361496 ARHGEF11O15085 1522 aa34.46■■■■□ 3.11
RCSD1-201ENST00000361496 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.32■■■■□ 3.08
RCSD1-201ENST00000361496 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.3■■■■□ 3.08
RCSD1-201ENST00000361496 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.3■■■■□ 3.08
RCSD1-201ENST00000361496 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.28■■■■□ 3.08
RCSD1-201ENST00000361496 ADAMTS12P58397 1594 aa34.28■■■■□ 3.08
RCSD1-201ENST00000361496 GRIN2AQ12879 1464 aa34.26■■■■□ 3.07
RCSD1-201ENST00000361496 ARAP1Q96P48 1450 aa34.16■■■■□ 3.06
RCSD1-201ENST00000361496 KIF27Q86VH2 1401 aa34.15■■■■□ 3.06
RCSD1-201ENST00000361496 NUP160Q12769 1436 aa34.11■■■■□ 3.05
RCSD1-201ENST00000361496 CEP170Q5SW79 1584 aa34.08■■■■□ 3.05
RCSD1-201ENST00000361496 IGF1RP08069 1367 aa34.08■■■■□ 3.05
RCSD1-201ENST00000361496 CUL7Q14999 1698 aa33.9■■■■□ 3.02
RCSD1-201ENST00000361496 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.88■■■■□ 3.01
RCSD1-201ENST00000361496 JPH4Q96JJ6 628 aa33.88■■■■□ 3.01
RCSD1-201ENST00000361496 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.87■■■■□ 3.01
RCSD1-201ENST00000361496 SHROOM2Q13796 1616 aa33.86■■■■□ 3.01
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