RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425992.2

VDAC1-204, Transcript of voltage dependent anion channel 1, humanhuman

TSL 3

Gene VDAC1, Length 703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1-204ENST00000425992 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.54■■■■■ 6.96
VDAC1-204ENST00000425992 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.28■■■■■ 5.96
VDAC1-204ENST00000425992 ABCC9O60706 1549 aa51.52■■■■■ 5.84
VDAC1-204ENST00000425992 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.36■■■■■ 5.49
VDAC1-204ENST00000425992 NACADO15069 1562 aa49.19■■■■■ 5.47
VDAC1-204ENST00000425992 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.03■■■■■ 5.44
VDAC1-204ENST00000425992 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.73■■■■■ 5.39
VDAC1-204ENST00000425992 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.68■■■■■ 5.38
VDAC1-204ENST00000425992 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.41■■■■■ 5.34
VDAC1-204ENST00000425992 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.39■■■■■ 5.34
VDAC1-204ENST00000425992 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.04■■■■■ 5.28
VDAC1-204ENST00000425992 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.95■■■■■ 5.27
VDAC1-204ENST00000425992 SCRIBQ14160 1630 aa47.68■■■■■ 5.22
VDAC1-204ENST00000425992 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.66■■■■■ 5.22
VDAC1-204ENST00000425992 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.28■■■■■ 5.16
VDAC1-204ENST00000425992 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.68■■■■■ 5.06
VDAC1-204ENST00000425992 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.61■■■■■ 5.05
VDAC1-204ENST00000425992 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.31■■■■■ 5
VDAC1-204ENST00000425992 SMARCA4P51532 1647 aa45.55■■■■■ 4.88
VDAC1-204ENST00000425992 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
VDAC1-204ENST00000425992 NCAPD3P42695 1498 aa45.37■■■■■ 4.85
VDAC1-204ENST00000425992 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.36■■■■■ 4.85
VDAC1-204ENST00000425992 SMARCA2P51531 1590 aa45.28■■■■■ 4.84
VDAC1-204ENST00000425992 HMGXB3Q12766 1538 aa45.15■■■■■ 4.82
VDAC1-204ENST00000425992 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.14■■■■■ 4.82
VDAC1-204ENST00000425992 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.08■■■■■ 4.81
VDAC1-204ENST00000425992 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.97■■■■■ 4.79
VDAC1-204ENST00000425992 WIZO95785 1651 aa44.68■■■■■ 4.74
VDAC1-204ENST00000425992 NESP48681 1621 aa44.49■■■■■ 4.71
VDAC1-204ENST00000425992 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.42■■■■■ 4.7
VDAC1-204ENST00000425992 ERCC6Q03468 1493 aa44.4■■■■■ 4.7
VDAC1-204ENST00000425992 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.28■■■■■ 4.68
VDAC1-204ENST00000425992 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
VDAC1-204ENST00000425992 CUX2O14529 1486 aa44.08■■■■■ 4.65
VDAC1-204ENST00000425992 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.02■■■■■ 4.64
VDAC1-204ENST00000425992 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.02■■■■■ 4.64
VDAC1-204ENST00000425992 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.94■■■■■ 4.62
VDAC1-204ENST00000425992 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
VDAC1-204ENST00000425992 CFTRP13569 1480 aa43.69■■■■■ 4.58
VDAC1-204ENST00000425992 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.59■■■■■ 4.57
VDAC1-204ENST00000425992 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.56■■■■■ 4.56
VDAC1-204ENST00000425992 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.55■■■■■ 4.56
VDAC1-204ENST00000425992 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.54■■■■■ 4.56
VDAC1-204ENST00000425992 PRDM2Q13029 1718 aa43.48■■■■■ 4.55
VDAC1-204ENST00000425992 WDR62O43379 1518 aa43.45■■■■■ 4.55
VDAC1-204ENST00000425992 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.19■■■■■ 4.5
VDAC1-204ENST00000425992 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
VDAC1-204ENST00000425992 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
VDAC1-204ENST00000425992 TOPBP1Q92547 1522 aa42.82■■■■■ 4.45
VDAC1-204ENST00000425992 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.75■■■■■ 4.43
VDAC1-204ENST00000425992 ABCC8Q09428 1581 aa42.73■■■■■ 4.43
VDAC1-204ENST00000425992 IFT140Q96RY7 1462 aa42.62■■■■■ 4.41
VDAC1-204ENST00000425992 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
VDAC1-204ENST00000425992 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
VDAC1-204ENST00000425992 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
VDAC1-204ENST00000425992 CUX1P39880 1505 aa42.37■■■■■ 4.37
VDAC1-204ENST00000425992 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
VDAC1-204ENST00000425992 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.27■■■■■ 4.36
VDAC1-204ENST00000425992 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.26■■■■■ 4.36
VDAC1-204ENST00000425992 SOGA1O94964 1423 aa42.21■■■■■ 4.35
VDAC1-204ENST00000425992 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.2■■■■■ 4.354e-6■■□□□ 13.2
VDAC1-204ENST00000425992 OSCARQ8IYS5 282 aa42.13■■■■■ 4.33
VDAC1-204ENST00000425992 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
VDAC1-204ENST00000425992 WDR97A6NE52 1622 aa42.02■■■■■ 4.32
VDAC1-204ENST00000425992 CHD1O14646 1710 aa41.96■■■■■ 4.31
VDAC1-204ENST00000425992 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.93■■■■■ 4.3
VDAC1-204ENST00000425992 TOP2BQ02880 1626 aa41.9■■■■■ 4.3
VDAC1-204ENST00000425992 SYNJ1O43426 1573 aa41.89■■■■■ 4.3
VDAC1-204ENST00000425992 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.88■■■■■ 4.3
VDAC1-204ENST00000425992 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.83■■■■■ 4.29
VDAC1-204ENST00000425992 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.81■■■■■ 4.28
VDAC1-204ENST00000425992 PBRM1Q86U86 1689 aa41.79■■■■■ 4.28
VDAC1-204ENST00000425992 GRIN2BQ13224 1484 aa41.78■■■■■ 4.28
VDAC1-204ENST00000425992 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.75■■■■■ 4.27
VDAC1-204ENST00000425992 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.73■■■■■ 4.27
VDAC1-204ENST00000425992 FBLN2P98095 1184 aa41.73■■■■■ 4.27
VDAC1-204ENST00000425992 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
VDAC1-204ENST00000425992 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.64■■■■■ 4.26
VDAC1-204ENST00000425992 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.64■■■■■ 4.26
VDAC1-204ENST00000425992 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.64■■■■■ 4.26
VDAC1-204ENST00000425992 TRIM41Q8WV44 630 aa41.62■■■■■ 4.25
VDAC1-204ENST00000425992 SYNJ2O15056 1496 aa41.56■■■■■ 4.24
VDAC1-204ENST00000425992 ARHGEF11O15085 1522 aa41.54■■■■■ 4.24
VDAC1-204ENST00000425992 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
VDAC1-204ENST00000425992 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.43■■■■■ 4.22
VDAC1-204ENST00000425992 ADAMTS12P58397 1594 aa41.37■■■■■ 4.21
VDAC1-204ENST00000425992 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.32■■■■■ 4.2
VDAC1-204ENST00000425992 GRIN2AQ12879 1464 aa41.26■■■■■ 4.2
VDAC1-204ENST00000425992 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.21■■■■■ 4.19
VDAC1-204ENST00000425992 ARAP1Q96P48 1450 aa41.18■■■■■ 4.18
VDAC1-204ENST00000425992 CEP170Q5SW79 1584 aa41.12■■■■■ 4.17
VDAC1-204ENST00000425992 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.12■■■■■ 4.17
VDAC1-204ENST00000425992 NUP160Q12769 1436 aa41.08■■■■■ 4.17
VDAC1-204ENST00000425992 KIF27Q86VH2 1401 aa41.02■■■■■ 4.16
VDAC1-204ENST00000425992 IGF1RP08069 1367 aa40.92■■■■■ 4.14
VDAC1-204ENST00000425992 CUL7Q14999 1698 aa40.9■■■■■ 4.14
VDAC1-204ENST00000425992 SHROOM2Q13796 1616 aa40.89■■■■■ 4.14
VDAC1-204ENST00000425992 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.86■■■■■ 4.13
VDAC1-204ENST00000425992 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.78■■■■■ 4.12
VDAC1-204ENST00000425992 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.67■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms