RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472446.1

PEMT-208, Transcript of phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, human

TSL 3

Gene PEMT, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PEMT-208	ENST00000472446	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		58.25	■■■■■ 6.92
PEMT-208	ENST00000472446	ABCC9	O60706	1549 aa		52.58	■■■■■ 6.01
PEMT-208	ENST00000472446	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.36	■■■■■ 5.97
PEMT-208	ENST00000472446	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		50	■■■■■ 5.59
PEMT-208	ENST00000472446	NACAD	O15069	1562 aa		49.58	■■■■■ 5.53
PEMT-208	ENST00000472446	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.46	■■■■■ 5.51
PEMT-208	ENST00000472446	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		49.4	■■■■■ 5.5
PEMT-208	ENST00000472446	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	48.95	■■■■■ 5.43
PEMT-208	ENST00000472446	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		48.79	■■■■■ 5.4
PEMT-208	ENST00000472446	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		48.72	■■■■■ 5.39
PEMT-208	ENST00000472446	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		48.39	■■■■■ 5.34
PEMT-208	ENST00000472446	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.21	■■■■■ 5.31
PEMT-208	ENST00000472446	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.1	■■■■■ 5.29
PEMT-208	ENST00000472446	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		47.85	■■■■■ 5.25
PEMT-208	ENST00000472446	SCRIB	Q14160	1630 aa		47.7	■■■■■ 5.23
PEMT-208	ENST00000472446	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		47.46	■■■■■ 5.19
PEMT-208	ENST00000472446	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		47.4	■■■■■ 5.18
PEMT-208	ENST00000472446	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	47.31	■■■■■ 5.16
PEMT-208	ENST00000472446	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.75	■■■■■ 4.91
PEMT-208	ENST00000472446	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		45.62	■■■■■ 4.89
PEMT-208	ENST00000472446	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.58	■■■■■ 4.89
PEMT-208	ENST00000472446	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.51	■■■■■ 4.88
PEMT-208	ENST00000472446	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.5	■■■■■ 4.87
PEMT-208	ENST00000472446	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.47	■■■■■ 4.87
PEMT-208	ENST00000472446	CUX2	O14529	1486 aa		45.42	■■■■■ 4.86
PEMT-208	ENST00000472446	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.39	■■■■■ 4.86
PEMT-208	ENST00000472446	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.28	■■■■■ 4.84
PEMT-208	ENST00000472446	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.18	■■■■■ 4.82
PEMT-208	ENST00000472446	NES	P48681	1621 aa		45.05	■■■■■ 4.8
PEMT-208	ENST00000472446	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.01	■■■■■ 4.8
PEMT-208	ENST00000472446	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		44.84	■■■■■ 4.77
PEMT-208	ENST00000472446	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		44.77	■■■■■ 4.76
PEMT-208	ENST00000472446	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	44.62	■■■■■ 4.73
PEMT-208	ENST00000472446	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		44.59	■■■■■ 4.73
PEMT-208	ENST00000472446	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		44.48	■■■■■ 4.71
PEMT-208	ENST00000472446	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.4	■■■■■ 4.7
PEMT-208	ENST00000472446	WIZ	O95785	1651 aa		44.31	■■■■■ 4.68
PEMT-208	ENST00000472446	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		44.16	■■■■■ 4.66
PEMT-208	ENST00000472446	WDR62	O43379	1518 aa		44.01	■■■■■ 4.64
PEMT-208	ENST00000472446	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		43.97	■■■■■ 4.63
PEMT-208	ENST00000472446	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.88	■■■■■ 4.61
PEMT-208	ENST00000472446	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	43.87	■■■■■ 4.61
PEMT-208	ENST00000472446	CFTR	P13569	1480 aa		43.8	■■■■■ 4.6
PEMT-208	ENST00000472446	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	43.78	■■■■■ 4.6
PEMT-208	ENST00000472446	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.63	■■■■■ 4.57
PEMT-208	ENST00000472446	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.46	■■■■■ 4.55
PEMT-208	ENST00000472446	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.4	■■■■■ 4.54
PEMT-208	ENST00000472446	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.34	■■■■■ 4.53
PEMT-208	ENST00000472446	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.27	■■■■■ 4.52
PEMT-208	ENST00000472446	IFT140	Q96RY7	1462 aa		43.1	■■■■■ 4.49
PEMT-208	ENST00000472446	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43.01	■■■■■ 4.48
PEMT-208	ENST00000472446	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.99	■■■■■ 4.47
PEMT-208	ENST00000472446	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.97	■■■■■ 4.47
PEMT-208	ENST00000472446	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PEMT-208	ENST00000472446	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42.73	■■■■■ 4.43
PEMT-208	ENST00000472446	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		42.73	■■■■■ 4.43
PEMT-208	ENST00000472446	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		42.73	■■■■■ 4.43
PEMT-208	ENST00000472446	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		42.73	■■■■■ 4.43
PEMT-208	ENST00000472446	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.61	■■■■■ 4.41
PEMT-208	ENST00000472446	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42.59	■■■■■ 4.41
PEMT-208	ENST00000472446	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.58	■■■■■ 4.41
PEMT-208	ENST00000472446	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.55	■■■■■ 4.4
PEMT-208	ENST00000472446	FBLN2	P98095	1184 aa		42.51	■■■■■ 4.4
PEMT-208	ENST00000472446	CHD1	O14646	1710 aa		42.46	■■■■■ 4.39
PEMT-208	ENST00000472446	SOGA1	O94964	1423 aa		42.42	■■■■■ 4.38
PEMT-208	ENST00000472446	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.4	■■■■■ 4.38
PEMT-208	ENST00000472446	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		42.39	■■■■■ 4.38
PEMT-208	ENST00000472446	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.33	■■■■■ 4.37
PEMT-208	ENST00000472446	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.27	■■■■■ 4.36
PEMT-208	ENST00000472446	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.22	■■■■■ 4.35
PEMT-208	ENST00000472446	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.17	■■■■■ 4.34
PEMT-208	ENST00000472446	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	42.15	■■■■■ 4.34
PEMT-208	ENST00000472446	CUX1	P39880	1505 aa		42.14	■■■■■ 4.34
PEMT-208	ENST00000472446	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.13	■■■■■ 4.34
PEMT-208	ENST00000472446	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.07	■■■■■ 4.33
PEMT-208	ENST00000472446	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.06	■■■■■ 4.32
PEMT-208	ENST00000472446	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.06	■■■■■ 4.32
PEMT-208	ENST00000472446	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.01	■■■■■ 4.32
PEMT-208	ENST00000472446	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.94	■■■■■ 4.3
PEMT-208	ENST00000472446	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.94	■■■■■ 4.3
PEMT-208	ENST00000472446	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.93	■■■■■ 4.3
PEMT-208	ENST00000472446	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		41.88	■■■■■ 4.29
PEMT-208	ENST00000472446	PBRM1	Q86U86	1689 aa		41.83	■■■■■ 4.29
PEMT-208	ENST00000472446	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		41.78	■■■■■ 4.28
PEMT-208	ENST00000472446	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		41.69	■■■■■ 4.26
PEMT-208	ENST00000472446	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.63	■■■■■ 4.26
PEMT-208	ENST00000472446	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.48	■■■■■ 4.23
PEMT-208	ENST00000472446	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.45	■■■■■ 4.23
PEMT-208	ENST00000472446	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.44	■■■■■ 4.22
PEMT-208	ENST00000472446	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.41	■■■■■ 4.22
PEMT-208	ENST00000472446	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.35	■■■■■ 4.21
PEMT-208	ENST00000472446	NUP160	Q12769	1436 aa		41.33	■■■■■ 4.21
PEMT-208	ENST00000472446	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.3	■■■■■ 4.2
PEMT-208	ENST00000472446	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.27	■■■■■ 4.2
PEMT-208	ENST00000472446	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		41.25	■■■■■ 4.19
PEMT-208	ENST00000472446	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.14	■■■■■ 4.18
PEMT-208	ENST00000472446	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.04	■■■■■ 4.16
PEMT-208	ENST00000472446	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	41.01	■■■■■ 4.16
PEMT-208	ENST00000472446	JPH4	Q96JJ6	628 aa		41	■■■■■ 4.15
PEMT-208	ENST00000472446	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		40.82	■■■■■ 4.12

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms