Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TARDBPQ13148 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.123e-7■■■□□ 18.8
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TARDBPQ13148 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.513e-7■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 ZNF195-224ENST00000529789 570 ntTSL 34.3□□□□□ -1.723e-7■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.19e-7■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.339e-7■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 HP1BP3-209ENST00000437575 473 ntTSL 325.31■■□□□ 1.645e-8■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 HP1BP3-211ENST00000443615 557 ntTSL 320.42■□□□□ 0.865e-8■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.785e-8■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 HP1BP3-206ENST00000419490 538 ntTSL 418.83■□□□□ 0.65e-8■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 HP1BP3-204ENST00000414993 727 ntTSL 416.24■□□□□ 0.195e-8■■■□□ 18.6
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TARDBPQ13148 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.34e-10■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.324e-10■■■□□ 18.6
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TARDBPQ13148 ESRRB-203ENST00000507951 736 ntTSL 314.84□□□□□ -0.031e-6■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 RPS6KC1-204ENST00000490299 5154 ntTSL 1 (best)3.62□□□□□ -1.832e-6■■■□□ 18.6
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TARDBPQ13148 SEMA4D-213ENST00000455551 3594 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 SEMA4D-221ENST00000537934 2710 ntTSL 211.27□□□□□ -0.612e-6■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 SEMA4D-211ENST00000438547 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.662e-6■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 SEMA4D-209ENST00000429836 2895 ntTSL 210.8□□□□□ -0.682e-6■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 SEMA4D-201ENST00000339861 4258 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.72e-6■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 SEMA4D-208ENST00000422704 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.752e-6■■■□□ 18.6
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