RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484210.1

HIVEP1-205, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HIVEP1, Length 1,602 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-205ENST00000484210 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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HIVEP1-205ENST00000484210 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.93■■□□□ 1.1
HIVEP1-205ENST00000484210 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HIVEP1-205ENST00000484210 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
HIVEP1-205ENST00000484210 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.59■□□□□ 0.73
HIVEP1-205ENST00000484210 ABCC9O60706 1549 aa19.15■□□□□ 0.66
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HIVEP1-205ENST00000484210 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.41■□□□□ 0.54
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HIVEP1-205ENST00000484210 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.35■□□□□ 0.53
HIVEP1-205ENST00000484210 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.32■□□□□ 0.52
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HIVEP1-205ENST00000484210 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.91■□□□□ 0.46
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HIVEP1-205ENST00000484210 MSH5O43196 834 aa17.75■□□□□ 0.43
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HIVEP1-205ENST00000484210 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
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HIVEP1-205ENST00000484210 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.31■□□□□ 0.36
HIVEP1-205ENST00000484210 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.3■□□□□ 0.36
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HIVEP1-205ENST00000484210 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.15■□□□□ 0.34
HIVEP1-205ENST00000484210 SMARCA4P51532 1647 aa17.15■□□□□ 0.34
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HIVEP1-205ENST00000484210 SMARCA2P51531 1590 aa17■□□□□ 0.31
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HIVEP1-205ENST00000484210 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
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HIVEP1-205ENST00000484210 TRIM41Q8WV44 630 aa16.83■□□□□ 0.28
HIVEP1-205ENST00000484210 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.69■□□□□ 0.26
HIVEP1-205ENST00000484210 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.67■□□□□ 0.26
HIVEP1-205ENST00000484210 NESP48681 1621 aa16.62■□□□□ 0.25
HIVEP1-205ENST00000484210 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.55■□□□□ 0.24
HIVEP1-205ENST00000484210 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.53■□□□□ 0.24
HIVEP1-205ENST00000484210 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
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HIVEP1-205ENST00000484210 ERCC6Q03468 1493 aa16.45■□□□□ 0.22
HIVEP1-205ENST00000484210 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.43■□□□□ 0.22
HIVEP1-205ENST00000484210 ABCC8Q09428 1581 aa16.41■□□□□ 0.22
HIVEP1-205ENST00000484210 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.36■□□□□ 0.21
HIVEP1-205ENST00000484210 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.35■□□□□ 0.21
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HIVEP1-205ENST00000484210 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.29■□□□□ 0.2
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HIVEP1-205ENST00000484210 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.26■□□□□ 0.19
HIVEP1-205ENST00000484210 CUX2O14529 1486 aa16.25■□□□□ 0.19
HIVEP1-205ENST00000484210 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.24■□□□□ 0.19
HIVEP1-205ENST00000484210 SOGA1O94964 1423 aa16.24■□□□□ 0.19
HIVEP1-205ENST00000484210 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.22■□□□□ 0.19
HIVEP1-205ENST00000484210 WDR62O43379 1518 aa16.2■□□□□ 0.18
HIVEP1-205ENST00000484210 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
HIVEP1-205ENST00000484210 SYNJ1O43426 1573 aa16.18■□□□□ 0.18
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HIVEP1-205ENST00000484210 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.14■□□□□ 0.18
HIVEP1-205ENST00000484210 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1-205ENST00000484210 TOP2BQ02880 1626 aa16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1-205ENST00000484210 TOPBP1Q92547 1522 aa16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1-205ENST00000484210 GOLGA3Q08378 1498 aa16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1-205ENST00000484210 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.06■□□□□ 0.16
HIVEP1-205ENST00000484210 CEP162Q5TB80 1403 aa16.06■□□□□ 0.16
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HIVEP1-205ENST00000484210 IFT140Q96RY7 1462 aa15.96■□□□□ 0.15
HIVEP1-205ENST00000484210 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.94■□□□□ 0.14
HIVEP1-205ENST00000484210 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.92■□□□□ 0.14
HIVEP1-205ENST00000484210 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HIVEP1-205ENST00000484210 KIF27Q86VH2 1401 aa15.91■□□□□ 0.14
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HIVEP1-205ENST00000484210 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.88■□□□□ 0.13
HIVEP1-205ENST00000484210 PRXQ9BXM0 1461 aa15.87■□□□□ 0.13
HIVEP1-205ENST00000484210 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.86■□□□□ 0.13
HIVEP1-205ENST00000484210 CLIP1P30622 1438 aa15.86■□□□□ 0.13
HIVEP1-205ENST00000484210 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HIVEP1-205ENST00000484210 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.85■□□□□ 0.13
HIVEP1-205ENST00000484210 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
HIVEP1-205ENST00000484210 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HIVEP1-205ENST00000484210 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
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HIVEP1-205ENST00000484210 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.79■□□□□ 0.12
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