Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ELL3Q9HB65 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELL3Q9HB65 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELL3Q9HB65 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms