Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLMPQ9H6B4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLMPQ9H6B4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms