Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP8B3O60423 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8B3O60423 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8B3O60423 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms