Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A8MVJ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A8MVJ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A8MVJ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A8MVJ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A8MVJ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A8MVJ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A8MVJ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A8MVJ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A8MVJ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A8MVJ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A8MVJ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A8MVJ9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A8MVJ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A8MVJ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A8MVJ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A8MVJ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A8MVJ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A8MVJ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
A8MVJ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A8MVJ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A8MVJ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A8MVJ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A8MVJ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A8MVJ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A8MVJ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A8MVJ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A8MVJ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
A8MVJ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A8MVJ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A8MVJ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A8MVJ9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A8MVJ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A8MVJ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A8MVJ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A8MVJ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A8MVJ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A8MVJ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A8MVJ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A8MVJ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A8MVJ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
A8MVJ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
A8MVJ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A8MVJ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A8MVJ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A8MVJ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A8MVJ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A8MVJ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A8MVJ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A8MVJ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A8MVJ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A8MVJ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A8MVJ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
A8MVJ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A8MVJ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A8MVJ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A8MVJ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A8MVJ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A8MVJ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A8MVJ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
A8MVJ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A8MVJ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A8MVJ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A8MVJ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A8MVJ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A8MVJ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A8MVJ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A8MVJ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
A8MVJ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A8MVJ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A8MVJ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A8MVJ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A8MVJ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A8MVJ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A8MVJ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A8MVJ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A8MVJ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A8MVJ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A8MVJ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A8MVJ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A8MVJ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A8MVJ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A8MVJ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A8MVJ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A8MVJ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A8MVJ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A8MVJ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A8MVJ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A8MVJ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A8MVJ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A8MVJ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A8MVJ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A8MVJ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A8MVJ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A8MVJ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A8MVJ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A8MVJ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A8MVJ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A8MVJ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A8MVJ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms