RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	MED4	Q12343	284 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SSH4	P32343	579 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SEC66	P33754	206 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	GPT2	P36148	743 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PSY4	P38193	441 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	IES2	P40154	320 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	NUP82	P40368	713 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	NUP85	P46673	744 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YDR476C	Q03362	224 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YLR297W	Q05899	129 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PDE2	P06776	526 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SLY1	P22213	666 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YIR014W	P40570	242 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	NUP84	P52891	726 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	TAF11	Q04226	346 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	GAL2	P13181	574 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	VPH2	P32341	215 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YKR015C	P36111	568 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	MLH1	P38920	769 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PSF2	P40359	213 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	LYS14	P40971	790 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	CSN12	P47130	423 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	KEL2	P50090	882 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YGR042W	P53227	271 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YGR168C	P53293	376 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	GOR1	P53839	350 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	IRC4	Q03036	179 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YML108W	Q03759	105 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	UFO1	Q04511	668 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	GMC2	Q06201	188 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	MDS3	P53094	1487 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	GPA2	P10823	449 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	KIN1	P13185	1064 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SEA4	P38164	1038 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SER3	P40054	469 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	JAC1	P53193	184 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YAP1802	P53309	568 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YNL058C	P53947	316 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	AAD4	Q07747	329 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	RIM20	Q12033	661 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YHR122W	P38829	231 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	MEF2	P39677	819 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	UAF30	Q08747	228 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	NUP120	P35729	1037 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PPX1	P38698	397 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	STP2	P38704	541 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	ATG1	P53104	897 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	RGR1	P19263	1082 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	OPI1	P21957	404 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YAP3	P38749	330 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	FTR1	P40088	404 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	IML2	P47031	731 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	MDM1	Q01846	1127 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	MAK10	Q02197	733 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SPP1	Q03012	353 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	URH1	Q04179	340 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	AFT2	Q08957	416 aa		2.84	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	MAS1	P10507	462 aa		2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MDJ1	P35191	511 aa		2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	CAF4	P36130	643 aa		2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MON1	P53129	644 aa		2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SRT1	Q03175	343 aa		2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	URC2	Q04411	772 aa		2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	VPS36	Q06696	566 aa		2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	HXT13	P39924	564 aa		2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	GCV1	P48015	400 aa		2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	COG2	P53271	262 aa		2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SSL2	Q00578	843 aa		2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SPC19	Q03954	165 aa		2.84	□□□□□ -1.96

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