Protein–RNA interactions for Protein: P38920

MLH1, DNA mismatch repair protein MLH1, yeastyeast

Predictions only

Length 769 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MLH1P38920 NSR1YGR159C 1245 nt18.23■□□□□ 0.51
MLH1P38920 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.22■□□□□ 0.51
MLH1P38920 NOP1YDL014W 984 nt17.67■□□□□ 0.42
MLH1P38920 MDJ1YFL016C 1536 nt16.35■□□□□ 0.21
MLH1P38920 YKL036CYKL036C 393 nt16.09■□□□□ 0.17
MLH1P38920 SRX1YKL086W 384 nt15.38■□□□□ 0.05
MLH1P38920 Q0297Q0297 156 nt15.33■□□□□ 0.04
MLH1P38920 YJL027CYJL027C 417 nt15.14■□□□□ 0.01
MLH1P38920 YCR051WYCR051W 669 nt14.63□□□□□ -0.07
MLH1P38920 SCS3YGL126W 1143 nt14.5□□□□□ -0.09
MLH1P38920 DBP2YNL112W 1641 nt14.31□□□□□ -0.12
MLH1P38920 SSA3YBL075C 1950 nt14.09□□□□□ -0.15
MLH1P38920 YBR190WYBR190W 312 nt14.01□□□□□ -0.17
MLH1P38920 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.99□□□□□ -0.17
MLH1P38920 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.99□□□□□ -0.17
MLH1P38920 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.99□□□□□ -0.17
MLH1P38920 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.99□□□□□ -0.17
MLH1P38920 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.99□□□□□ -0.17
MLH1P38920 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.99□□□□□ -0.17
MLH1P38920 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.99□□□□□ -0.17
MLH1P38920 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.99□□□□□ -0.17
MLH1P38920 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.99□□□□□ -0.17
MLH1P38920 CCC1YLR220W 969 nt13.9□□□□□ -0.18
MLH1P38920 YOL085CYOL085C 342 nt13.9□□□□□ -0.18
MLH1P38920 RPP1BYDL130W 321 nt13.78□□□□□ -0.2
MLH1P38920 RTC3YHR087W 336 nt13.74□□□□□ -0.21
MLH1P38920 PKP1YIL042C 1185 nt13.72□□□□□ -0.21
MLH1P38920 RVS167YDR388W 1449 nt13.58□□□□□ -0.24
MLH1P38920 SCJ1YMR214W 1134 nt13.35□□□□□ -0.27
MLH1P38920 PUT4YOR348C 1884 nt13.21□□□□□ -0.3
MLH1P38920 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.19□□□□□ -0.3
MLH1P38920 PET122YER153C 765 nt13.17□□□□□ -0.3
MLH1P38920 SCR1SCR1 522 nt13.06□□□□□ -0.32
MLH1P38920 SHR5YOL110W 714 nt13.01□□□□□ -0.33
MLH1P38920 ATS1YAL020C 1002 nt12.92□□□□□ -0.34
MLH1P38920 RRN5YLR141W 1092 nt12.77□□□□□ -0.37
MLH1P38920 YDJ1YNL064C 1230 nt12.77□□□□□ -0.37
MLH1P38920 URN1YPR152C 1398 nt12.76□□□□□ -0.37
MLH1P38920 ARE1YCR048W 1833 nt12.74□□□□□ -0.37
MLH1P38920 POA1YBR022W 534 nt12.7□□□□□ -0.38
MLH1P38920 DEP1YAL013W 1218 nt12.69□□□□□ -0.38
MLH1P38920 RPN10YHR200W 807 nt12.6□□□□□ -0.39
MLH1P38920 OPI9YLR338W 858 nt12.6□□□□□ -0.39
MLH1P38920 BSC6YOL137W 1494 nt12.58□□□□□ -0.4
MLH1P38920 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.57□□□□□ -0.4
MLH1P38920 SPT5YML010W 3192 nt12.57□□□□□ -0.4
MLH1P38920 SAH1YER043C 1350 nt12.55□□□□□ -0.4
MLH1P38920 GAR1YHR089C 618 nt12.53□□□□□ -0.4
MLH1P38920 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.51□□□□□ -0.41
MLH1P38920 RSB1YOR049C 1065 nt12.51□□□□□ -0.41
MLH1P38920 YNL208WYNL208W 600 nt12.49□□□□□ -0.41
MLH1P38920 SSA4YER103W 1929 nt12.45□□□□□ -0.42
MLH1P38920 PUN1YLR414C 792 nt12.27□□□□□ -0.45
MLH1P38920 BUD23YCR047C 828 nt12.21□□□□□ -0.45
MLH1P38920 YJR018WYJR018W 363 nt12.16□□□□□ -0.46
MLH1P38920 PTC2YER089C 1395 nt12.11□□□□□ -0.47
MLH1P38920 TIR1YER011W 765 nt12.11□□□□□ -0.47
MLH1P38920 BDF1YLR399C 2061 nt12.07□□□□□ -0.48
MLH1P38920 NAB2YGL122C 1578 nt11.99□□□□□ -0.49
MLH1P38920 PST2YDR032C 597 nt11.97□□□□□ -0.49
MLH1P38920 SSA1YAL005C 1929 nt11.95□□□□□ -0.5
MLH1P38920 RPP2BYDR382W 333 nt11.94□□□□□ -0.5
MLH1P38920 Q0182Q0182 405 nt11.94□□□□□ -0.5
MLH1P38920 MEP2YNL142W 1500 nt11.9□□□□□ -0.5
MLH1P38920 TAT1YBR069C 1860 nt11.89□□□□□ -0.51
MLH1P38920 YJR120WYJR120W 351 nt11.83□□□□□ -0.52
MLH1P38920 FPR4YLR449W 1179 nt11.82□□□□□ -0.52
MLH1P38920 DAL1YIR027C 1383 nt11.8□□□□□ -0.52
MLH1P38920 INM2YDR287W 879 nt11.77□□□□□ -0.53
MLH1P38920 FIS1YIL065C 468 nt11.75□□□□□ -0.53
MLH1P38920 PHO4YFR034C 939 nt11.68□□□□□ -0.54
MLH1P38920 PAC11YDR488C 1602 nt11.68□□□□□ -0.54
MLH1P38920 DCW1YKL046C 1350 nt11.67□□□□□ -0.54
MLH1P38920 SRB2YHR041C 633 nt11.64□□□□□ -0.55
MLH1P38920 YBL100CYBL100C 315 nt11.62□□□□□ -0.55
MLH1P38920 YPS1YLR120C 1710 nt11.6□□□□□ -0.55
MLH1P38920 BDH2YAL061W 1254 nt11.6□□□□□ -0.55
MLH1P38920 YBR220CYBR220C 1683 nt11.55□□□□□ -0.56
MLH1P38920 SHU1YHL006C 453 nt11.53□□□□□ -0.56
MLH1P38920 WWM1YFL010C 636 nt11.52□□□□□ -0.57
MLH1P38920 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.51□□□□□ -0.57
MLH1P38920 YMR090WYMR090W 684 nt11.51□□□□□ -0.57
MLH1P38920 EMI2YDR516C 1503 nt11.5□□□□□ -0.57
MLH1P38920 YGR021WYGR021W 873 nt11.47□□□□□ -0.57
MLH1P38920 YKL097CYKL097C 411 nt11.47□□□□□ -0.57
MLH1P38920 FUN26YAL022C 1554 nt11.45□□□□□ -0.58
MLH1P38920 TRM9YML014W 840 nt11.44□□□□□ -0.58
MLH1P38920 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.43□□□□□ -0.58
MLH1P38920 YDR095CYDR095C 411 nt11.42□□□□□ -0.58
MLH1P38920 LSM3YLR438C-A 270 nt11.41□□□□□ -0.58
MLH1P38920 ALF1YNL148C 765 nt11.41□□□□□ -0.58
MLH1P38920 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.38□□□□□ -0.59
MLH1P38920 SDH1YKL148C 1923 nt11.37□□□□□ -0.59
MLH1P38920 YDL221WYDL221W 552 nt11.37□□□□□ -0.59
MLH1P38920 HOM6YJR139C 1080 nt11.34□□□□□ -0.59
MLH1P38920 NVJ2YPR091C 2313 nt11.34□□□□□ -0.59
MLH1P38920 PCH2YBR186W 1695 nt11.3□□□□□ -0.6
MLH1P38920 MOT3YMR070W 1473 nt11.3□□□□□ -0.6
MLH1P38920 CCT6YDR188W 1641 nt11.28□□□□□ -0.6
MLH1P38920 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.28□□□□□ -0.6
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