Protein–RNA interactions for Protein: P36148

GPT2, Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase 2, yeastyeast

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GPT2P36148 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.79■■□□□ 1.24
GPT2P36148 NOP1YDL014W 984 nt22.4■■□□□ 1.18
GPT2P36148 NSR1YGR159C 1245 nt22.27■■□□□ 1.16
GPT2P36148 YKL036CYKL036C 393 nt21.05■□□□□ 0.96
GPT2P36148 YJL027CYJL027C 417 nt19.73■□□□□ 0.75
GPT2P36148 Q0297Q0297 156 nt19.7■□□□□ 0.74
GPT2P36148 SRX1YKL086W 384 nt19.52■□□□□ 0.72
GPT2P36148 SCS3YGL126W 1143 nt19.33■□□□□ 0.68
GPT2P36148 MDJ1YFL016C 1536 nt19.29■□□□□ 0.68
GPT2P36148 YCR051WYCR051W 669 nt18.56■□□□□ 0.56
GPT2P36148 YOL085CYOL085C 342 nt18.17■□□□□ 0.5
GPT2P36148 PKP1YIL042C 1185 nt17.81■□□□□ 0.44
GPT2P36148 SCJ1YMR214W 1134 nt17.76■□□□□ 0.43
GPT2P36148 RPP1BYDL130W 321 nt17.68■□□□□ 0.42
GPT2P36148 ATS1YAL020C 1002 nt17.42■□□□□ 0.38
GPT2P36148 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.37■□□□□ 0.37
GPT2P36148 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.37■□□□□ 0.37
GPT2P36148 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.37■□□□□ 0.37
GPT2P36148 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.37■□□□□ 0.37
GPT2P36148 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.37■□□□□ 0.37
GPT2P36148 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.37■□□□□ 0.37
GPT2P36148 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.37■□□□□ 0.37
GPT2P36148 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.37■□□□□ 0.37
GPT2P36148 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.37■□□□□ 0.37
GPT2P36148 DBP2YNL112W 1641 nt17.21■□□□□ 0.35
GPT2P36148 CCC1YLR220W 969 nt17.19■□□□□ 0.34
GPT2P36148 SCR1SCR1 522 nt16.84■□□□□ 0.29
GPT2P36148 PET122YER153C 765 nt16.8■□□□□ 0.28
GPT2P36148 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.58■□□□□ 0.24
GPT2P36148 RVS167YDR388W 1449 nt16.45■□□□□ 0.22
GPT2P36148 YBR190WYBR190W 312 nt16.39■□□□□ 0.21
GPT2P36148 RRN5YLR141W 1092 nt16.36■□□□□ 0.21
GPT2P36148 RSB1YOR049C 1065 nt16.2■□□□□ 0.18
GPT2P36148 RTC3YHR087W 336 nt16.11■□□□□ 0.17
GPT2P36148 YDJ1YNL064C 1230 nt16.07■□□□□ 0.16
GPT2P36148 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.05■□□□□ 0.16
GPT2P36148 PST2YDR032C 597 nt16.04■□□□□ 0.16
GPT2P36148 SHR5YOL110W 714 nt15.93■□□□□ 0.14
GPT2P36148 YKL097CYKL097C 411 nt15.7■□□□□ 0.1
GPT2P36148 GAR1YHR089C 618 nt15.6■□□□□ 0.09
GPT2P36148 SHU1YHL006C 453 nt15.27■□□□□ 0.04
GPT2P36148 DEP1YAL013W 1218 nt15.26■□□□□ 0.03
GPT2P36148 URN1YPR152C 1398 nt15.18■□□□□ 0.02
GPT2P36148 RPN10YHR200W 807 nt15.15■□□□□ 0.02
GPT2P36148 YNL208WYNL208W 600 nt15.14■□□□□ 0.01
GPT2P36148 TIR1YER011W 765 nt15.07■□□□□ 0
GPT2P36148 YOR139CYOR139C 393 nt14.91□□□□□ -0.02
GPT2P36148 OPI9YLR338W 858 nt14.87□□□□□ -0.03
GPT2P36148 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.86□□□□□ -0.03
GPT2P36148 NPL3YDR432W 1245 nt14.78□□□□□ -0.04
GPT2P36148 SSA1YAL005C 1929 nt14.74□□□□□ -0.05
GPT2P36148 SAH1YER043C 1350 nt14.61□□□□□ -0.07
GPT2P36148 YGR021WYGR021W 873 nt14.61□□□□□ -0.07
GPT2P36148 YJR018WYJR018W 363 nt14.51□□□□□ -0.09
GPT2P36148 YOL037CYOL037C 354 nt14.51□□□□□ -0.09
GPT2P36148 SRB2YHR041C 633 nt14.5□□□□□ -0.09
GPT2P36148 HOM6YJR139C 1080 nt14.5□□□□□ -0.09
GPT2P36148 PUN1YLR414C 792 nt14.48□□□□□ -0.09
GPT2P36148 MNP1YGL068W 585 nt14.47□□□□□ -0.09
GPT2P36148 PUT4YOR348C 1884 nt14.46□□□□□ -0.1
GPT2P36148 WWM1YFL010C 636 nt14.44□□□□□ -0.1
GPT2P36148 RPP2BYDR382W 333 nt14.41□□□□□ -0.1
GPT2P36148 ARE1YCR048W 1833 nt14.33□□□□□ -0.12
GPT2P36148 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.3□□□□□ -0.12
GPT2P36148 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.3□□□□□ -0.12
GPT2P36148 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.3□□□□□ -0.12
GPT2P36148 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.3□□□□□ -0.12
GPT2P36148 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.3□□□□□ -0.12
GPT2P36148 YJR120WYJR120W 351 nt14.3□□□□□ -0.12
GPT2P36148 RKM5YLR137W 1104 nt14.3□□□□□ -0.12
GPT2P36148 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.28□□□□□ -0.12
GPT2P36148 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.2□□□□□ -0.14
GPT2P36148 PTC2YER089C 1395 nt14.17□□□□□ -0.14
GPT2P36148 BDH2YAL061W 1254 nt14.15□□□□□ -0.14
GPT2P36148 PUS2YGL063W 1113 nt14.08□□□□□ -0.16
GPT2P36148 LSM3YLR438C-A 270 nt14.07□□□□□ -0.16
GPT2P36148 YLR281CYLR281C 468 nt14.06□□□□□ -0.16
GPT2P36148 POA1YBR022W 534 nt14.06□□□□□ -0.16
GPT2P36148 SSA3YBL075C 1950 nt14.03□□□□□ -0.16
GPT2P36148 INM2YDR287W 879 nt13.97□□□□□ -0.17
GPT2P36148 MOT3YMR070W 1473 nt13.96□□□□□ -0.17
GPT2P36148 WHI5YOR083W 888 nt13.96□□□□□ -0.17
GPT2P36148 NAB2YGL122C 1578 nt13.95□□□□□ -0.18
GPT2P36148 BUD23YCR047C 828 nt13.92□□□□□ -0.18
GPT2P36148 YBL100CYBL100C 315 nt13.89□□□□□ -0.19
GPT2P36148 DAL1YIR027C 1383 nt13.86□□□□□ -0.19
GPT2P36148 FPR4YLR449W 1179 nt13.83□□□□□ -0.2
GPT2P36148 TRM9YML014W 840 nt13.82□□□□□ -0.2
GPT2P36148 BSC6YOL137W 1494 nt13.8□□□□□ -0.2
GPT2P36148 FIS1YIL065C 468 nt13.77□□□□□ -0.21
GPT2P36148 IMP2'YIL154C 1041 nt13.74□□□□□ -0.21
GPT2P36148 DSK2YMR276W 1122 nt13.74□□□□□ -0.21
GPT2P36148 FMP45YDL222C 930 nt13.73□□□□□ -0.21
GPT2P36148 FUN26YAL022C 1554 nt13.72□□□□□ -0.21
GPT2P36148 PHO4YFR034C 939 nt13.71□□□□□ -0.21
GPT2P36148 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.64□□□□□ -0.23
GPT2P36148 CCT6YDR188W 1641 nt13.64□□□□□ -0.23
GPT2P36148 YCH1YGR203W 447 nt13.63□□□□□ -0.23
GPT2P36148 MRPL8YJL063C 717 nt13.63□□□□□ -0.23
GPT2P36148 YLR236CYLR236C 324 nt13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.4 ms