Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.2■■□□□ 1.46
RIM20Q12033 NSR1YGR159C 1245 nt24.07■■□□□ 1.44
RIM20Q12033 NOP1YDL014W 984 nt23.41■■□□□ 1.34
RIM20Q12033 YKL036CYKL036C 393 nt21.57■■□□□ 1.04
RIM20Q12033 MDJ1YFL016C 1536 nt21.54■■□□□ 1.04
RIM20Q12033 Q0297Q0297 156 nt20.51■□□□□ 0.87
RIM20Q12033 SRX1YKL086W 384 nt20.49■□□□□ 0.87
RIM20Q12033 YJL027CYJL027C 417 nt20.13■□□□□ 0.81
RIM20Q12033 SCS3YGL126W 1143 nt19.63■□□□□ 0.73
RIM20Q12033 YCR051WYCR051W 669 nt19.47■□□□□ 0.71
RIM20Q12033 DBP2YNL112W 1641 nt19.03■□□□□ 0.64
RIM20Q12033 YOL085CYOL085C 342 nt18.72■□□□□ 0.59
RIM20Q12033 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.61■□□□□ 0.57
RIM20Q12033 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.61■□□□□ 0.57
RIM20Q12033 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.61■□□□□ 0.57
RIM20Q12033 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.61■□□□□ 0.57
RIM20Q12033 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.61■□□□□ 0.57
RIM20Q12033 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.61■□□□□ 0.57
RIM20Q12033 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.61■□□□□ 0.57
RIM20Q12033 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.61■□□□□ 0.57
RIM20Q12033 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.61■□□□□ 0.57
RIM20Q12033 PKP1YIL042C 1185 nt18.5■□□□□ 0.55
RIM20Q12033 CCC1YLR220W 969 nt18.45■□□□□ 0.54
RIM20Q12033 RPP1BYDL130W 321 nt18.41■□□□□ 0.54
RIM20Q12033 YBR190WYBR190W 312 nt18.31■□□□□ 0.52
RIM20Q12033 RTC3YHR087W 336 nt17.92■□□□□ 0.46
RIM20Q12033 SCJ1YMR214W 1134 nt17.78■□□□□ 0.44
RIM20Q12033 RVS167YDR388W 1449 nt17.76■□□□□ 0.43
RIM20Q12033 PET122YER153C 765 nt17.65■□□□□ 0.42
RIM20Q12033 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.58■□□□□ 0.4
RIM20Q12033 ATS1YAL020C 1002 nt17.52■□□□□ 0.4
RIM20Q12033 SCR1SCR1 522 nt17.35■□□□□ 0.37
RIM20Q12033 SHR5YOL110W 714 nt17.16■□□□□ 0.34
RIM20Q12033 RRN5YLR141W 1092 nt17.12■□□□□ 0.33
RIM20Q12033 YDJ1YNL064C 1230 nt16.96■□□□□ 0.31
RIM20Q12033 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.79■□□□□ 0.28
RIM20Q12033 DEP1YAL013W 1218 nt16.78■□□□□ 0.28
RIM20Q12033 URN1YPR152C 1398 nt16.77■□□□□ 0.27
RIM20Q12033 PUT4YOR348C 1884 nt16.74■□□□□ 0.27
RIM20Q12033 RSB1YOR049C 1065 nt16.73■□□□□ 0.27
RIM20Q12033 GAR1YHR089C 618 nt16.66■□□□□ 0.26
RIM20Q12033 OPI9YLR338W 858 nt16.51■□□□□ 0.23
RIM20Q12033 SAH1YER043C 1350 nt16.48■□□□□ 0.23
RIM20Q12033 YNL208WYNL208W 600 nt16.43■□□□□ 0.22
RIM20Q12033 ARE1YCR048W 1833 nt16.42■□□□□ 0.22
RIM20Q12033 RPN10YHR200W 807 nt16.41■□□□□ 0.22
RIM20Q12033 PST2YDR032C 597 nt16.25■□□□□ 0.19
RIM20Q12033 POA1YBR022W 534 nt16.23■□□□□ 0.19
RIM20Q12033 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.2■□□□□ 0.18
RIM20Q12033 TIR1YER011W 765 nt16.08■□□□□ 0.16
RIM20Q12033 PUN1YLR414C 792 nt16■□□□□ 0.15
RIM20Q12033 YJR018WYJR018W 363 nt15.97■□□□□ 0.15
RIM20Q12033 SSA1YAL005C 1929 nt15.94■□□□□ 0.14
RIM20Q12033 BSC6YOL137W 1494 nt15.88■□□□□ 0.13
RIM20Q12033 PTC2YER089C 1395 nt15.87■□□□□ 0.13
RIM20Q12033 BUD23YCR047C 828 nt15.82■□□□□ 0.12
RIM20Q12033 YJR120WYJR120W 351 nt15.78■□□□□ 0.12
RIM20Q12033 SSA3YBL075C 1950 nt15.75■□□□□ 0.11
RIM20Q12033 SRB2YHR041C 633 nt15.74■□□□□ 0.11
RIM20Q12033 NAB2YGL122C 1578 nt15.65■□□□□ 0.1
RIM20Q12033 SHU1YHL006C 453 nt15.63■□□□□ 0.09
RIM20Q12033 RPP2BYDR382W 333 nt15.58■□□□□ 0.08
RIM20Q12033 YKL097CYKL097C 411 nt15.53■□□□□ 0.08
RIM20Q12033 FIS1YIL065C 468 nt15.47■□□□□ 0.07
RIM20Q12033 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.46■□□□□ 0.07
RIM20Q12033 FPR4YLR449W 1179 nt15.43■□□□□ 0.06
RIM20Q12033 DAL1YIR027C 1383 nt15.43■□□□□ 0.06
RIM20Q12033 WWM1YFL010C 636 nt15.4■□□□□ 0.06
RIM20Q12033 INM2YDR287W 879 nt15.37■□□□□ 0.05
RIM20Q12033 PHO4YFR034C 939 nt15.31■□□□□ 0.04
RIM20Q12033 BDH2YAL061W 1254 nt15.29■□□□□ 0.04
RIM20Q12033 YBL100CYBL100C 315 nt15.26■□□□□ 0.03
RIM20Q12033 YGR021WYGR021W 873 nt15.2■□□□□ 0.02
RIM20Q12033 HOM6YJR139C 1080 nt15.2■□□□□ 0.02
RIM20Q12033 SPT5YML010W 3192 nt15.2■□□□□ 0.02
RIM20Q12033 MNP1YGL068W 585 nt15.16■□□□□ 0.02
RIM20Q12033 FUN26YAL022C 1554 nt15.08■□□□□ 0
RIM20Q12033 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.08■□□□□ 0
RIM20Q12033 LSM3YLR438C-A 270 nt15.05■□□□□ -0
RIM20Q12033 YPS1YLR120C 1710 nt15.03■□□□□ -0
RIM20Q12033 TRM9YML014W 840 nt15□□□□□ -0.01
RIM20Q12033 YOR139CYOR139C 393 nt14.99□□□□□ -0.01
RIM20Q12033 RKM5YLR137W 1104 nt14.97□□□□□ -0.01
RIM20Q12033 YDR095CYDR095C 411 nt14.92□□□□□ -0.02
RIM20Q12033 MEP2YNL142W 1500 nt14.89□□□□□ -0.03
RIM20Q12033 CCT6YDR188W 1641 nt14.87□□□□□ -0.03
RIM20Q12033 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.86□□□□□ -0.03
RIM20Q12033 ALF1YNL148C 765 nt14.84□□□□□ -0.03
RIM20Q12033 NPL3YDR432W 1245 nt14.82□□□□□ -0.04
RIM20Q12033 YOL037CYOL037C 354 nt14.78□□□□□ -0.04
RIM20Q12033 DCW1YKL046C 1350 nt14.72□□□□□ -0.05
RIM20Q12033 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.7□□□□□ -0.06
RIM20Q12033 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.7□□□□□ -0.06
RIM20Q12033 SIS1YNL007C 1059 nt14.65□□□□□ -0.06
RIM20Q12033 SSA4YER103W 1929 nt14.64□□□□□ -0.07
RIM20Q12033 PTP1YDL230W 1008 nt14.64□□□□□ -0.07
RIM20Q12033 RPP2AYOL039W 321 nt14.64□□□□□ -0.07
RIM20Q12033 CAC2YML102W 1407 nt14.55□□□□□ -0.08
RIM20Q12033 YLR281CYLR281C 468 nt14.5□□□□□ -0.09
RIM20Q12033 EMI2YDR516C 1503 nt14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms