Protein–RNA interactions for Protein: P38698

PPX1, Exopolyphosphatase, yeastyeast

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PPX1P38698 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.53■□□□□ 0.88
PPX1P38698 NOP1YDL014W 984 nt20.23■□□□□ 0.83
PPX1P38698 NSR1YGR159C 1245 nt20.17■□□□□ 0.82
PPX1P38698 YKL036CYKL036C 393 nt18.99■□□□□ 0.63
PPX1P38698 Q0297Q0297 156 nt17.84■□□□□ 0.45
PPX1P38698 YJL027CYJL027C 417 nt17.76■□□□□ 0.43
PPX1P38698 SRX1YKL086W 384 nt17.66■□□□□ 0.42
PPX1P38698 MDJ1YFL016C 1536 nt17.66■□□□□ 0.42
PPX1P38698 SCS3YGL126W 1143 nt17.44■□□□□ 0.38
PPX1P38698 YCR051WYCR051W 669 nt16.7■□□□□ 0.26
PPX1P38698 YOL085CYOL085C 342 nt16.4■□□□□ 0.22
PPX1P38698 SCJ1YMR214W 1134 nt16.09■□□□□ 0.17
PPX1P38698 PKP1YIL042C 1185 nt16.01■□□□□ 0.15
PPX1P38698 RPP1BYDL130W 321 nt15.98■□□□□ 0.15
PPX1P38698 Q0182Q0182 405 nt15.79■□□□□ 0.12
PPX1P38698 ATS1YAL020C 1002 nt15.73■□□□□ 0.11
PPX1P38698 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.72■□□□□ 0.11
PPX1P38698 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.72■□□□□ 0.11
PPX1P38698 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.72■□□□□ 0.11
PPX1P38698 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.72■□□□□ 0.11
PPX1P38698 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.72■□□□□ 0.11
PPX1P38698 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.72■□□□□ 0.11
PPX1P38698 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.72■□□□□ 0.11
PPX1P38698 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.72■□□□□ 0.11
PPX1P38698 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.72■□□□□ 0.11
PPX1P38698 DBP2YNL112W 1641 nt15.6■□□□□ 0.09
PPX1P38698 SSA3YBL075C 1950 nt15.47■□□□□ 0.07
PPX1P38698 CCC1YLR220W 969 nt15.45■□□□□ 0.06
PPX1P38698 MOT3YMR070W 1473 nt15.39■□□□□ 0.05
PPX1P38698 YBR190WYBR190W 312 nt15.21■□□□□ 0.03
PPX1P38698 SCR1SCR1 522 nt15.19■□□□□ 0.02
PPX1P38698 PET122YER153C 765 nt15.15■□□□□ 0.02
PPX1P38698 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PPX1P38698 RTC3YHR087W 336 nt14.96□□□□□ -0.01
PPX1P38698 RVS167YDR388W 1449 nt14.85□□□□□ -0.03
PPX1P38698 RRN5YLR141W 1092 nt14.76□□□□□ -0.05
PPX1P38698 RSB1YOR049C 1065 nt14.57□□□□□ -0.08
PPX1P38698 YDJ1YNL064C 1230 nt14.55□□□□□ -0.08
PPX1P38698 PST2YDR032C 597 nt14.51□□□□□ -0.09
PPX1P38698 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.49□□□□□ -0.09
PPX1P38698 PUT4YOR348C 1884 nt14.4□□□□□ -0.1
PPX1P38698 SHR5YOL110W 714 nt14.4□□□□□ -0.1
PPX1P38698 YKL097CYKL097C 411 nt14.14□□□□□ -0.15
PPX1P38698 GAR1YHR089C 618 nt14.05□□□□□ -0.16
PPX1P38698 POA1YBR022W 534 nt13.97□□□□□ -0.17
PPX1P38698 ARE1YCR048W 1833 nt13.91□□□□□ -0.18
PPX1P38698 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.81□□□□□ -0.2
PPX1P38698 BSC6YOL137W 1494 nt13.8□□□□□ -0.2
PPX1P38698 SHU1YHL006C 453 nt13.77□□□□□ -0.21
PPX1P38698 SAH1YER043C 1350 nt13.72□□□□□ -0.21
PPX1P38698 DEP1YAL013W 1218 nt13.72□□□□□ -0.21
PPX1P38698 URN1YPR152C 1398 nt13.7□□□□□ -0.22
PPX1P38698 RPN10YHR200W 807 nt13.69□□□□□ -0.22
PPX1P38698 YNL208WYNL208W 600 nt13.69□□□□□ -0.22
PPX1P38698 SSA4YER103W 1929 nt13.65□□□□□ -0.22
PPX1P38698 TIR1YER011W 765 nt13.61□□□□□ -0.23
PPX1P38698 SPT5YML010W 3192 nt13.59□□□□□ -0.23
PPX1P38698 OPI9YLR338W 858 nt13.55□□□□□ -0.24
PPX1P38698 BUD23YCR047C 828 nt13.49□□□□□ -0.25
PPX1P38698 YOR139CYOR139C 393 nt13.46□□□□□ -0.25
PPX1P38698 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.35□□□□□ -0.27
PPX1P38698 SSA1YAL005C 1929 nt13.33□□□□□ -0.28
PPX1P38698 NPL3YDR432W 1245 nt13.31□□□□□ -0.28
PPX1P38698 YGR021WYGR021W 873 nt13.2□□□□□ -0.3
PPX1P38698 PTC2YER089C 1395 nt13.19□□□□□ -0.3
PPX1P38698 PUN1YLR414C 792 nt13.17□□□□□ -0.3
PPX1P38698 BDF1YLR399C 2061 nt13.14□□□□□ -0.31
PPX1P38698 YJR018WYJR018W 363 nt13.11□□□□□ -0.31
PPX1P38698 HOM6YJR139C 1080 nt13.11□□□□□ -0.31
PPX1P38698 YOL037CYOL037C 354 nt13.11□□□□□ -0.31
PPX1P38698 NAB2YGL122C 1578 nt13.1□□□□□ -0.31
PPX1P38698 SRB2YHR041C 633 nt13.09□□□□□ -0.31
PPX1P38698 WWM1YFL010C 636 nt13.02□□□□□ -0.33
PPX1P38698 MNP1YGL068W 585 nt13.02□□□□□ -0.33
PPX1P38698 RPP2BYDR382W 333 nt13.01□□□□□ -0.33
PPX1P38698 MEP2YNL142W 1500 nt13.01□□□□□ -0.33
PPX1P38698 YJR120WYJR120W 351 nt12.95□□□□□ -0.34
PPX1P38698 TAT1YBR069C 1860 nt12.95□□□□□ -0.34
PPX1P38698 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.92□□□□□ -0.34
PPX1P38698 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.92□□□□□ -0.34
PPX1P38698 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.92□□□□□ -0.34
PPX1P38698 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.92□□□□□ -0.34
PPX1P38698 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.92□□□□□ -0.34
PPX1P38698 RKM5YLR137W 1104 nt12.92□□□□□ -0.34
PPX1P38698 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.91□□□□□ -0.34
PPX1P38698 PAC11YDR488C 1602 nt12.91□□□□□ -0.34
PPX1P38698 FPR4YLR449W 1179 nt12.84□□□□□ -0.35
PPX1P38698 DCW1YKL046C 1350 nt12.81□□□□□ -0.36
PPX1P38698 BDH2YAL061W 1254 nt12.8□□□□□ -0.36
PPX1P38698 NME1NME1 340 nt12.8□□□□□ -0.36
PPX1P38698 FIS1YIL065C 468 nt12.79□□□□□ -0.36
PPX1P38698 DAL1YIR027C 1383 nt12.78□□□□□ -0.36
PPX1P38698 LSM3YLR438C-A 270 nt12.75□□□□□ -0.37
PPX1P38698 YLR281CYLR281C 468 nt12.72□□□□□ -0.37
PPX1P38698 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.68□□□□□ -0.38
PPX1P38698 YPS1YLR120C 1710 nt12.67□□□□□ -0.38
PPX1P38698 PUS2YGL063W 1113 nt12.66□□□□□ -0.38
PPX1P38698 YMR090WYMR090W 684 nt12.66□□□□□ -0.38
PPX1P38698 INM2YDR287W 879 nt12.65□□□□□ -0.38
PPX1P38698 PHO4YFR034C 939 nt12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.6 ms