Protein–RNA interactions for Protein: P53293

YGR168C, Uncharacterized protein YGR168C, yeastyeast

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGR168CP53293 NSR1YGR159C 1245 nt18.82■□□□□ 0.6
YGR168CP53293 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.63■□□□□ 0.57
YGR168CP53293 NOP1YDL014W 984 nt18.07■□□□□ 0.48
YGR168CP53293 MDJ1YFL016C 1536 nt16.91■□□□□ 0.3
YGR168CP53293 YKL036CYKL036C 393 nt16.34■□□□□ 0.21
YGR168CP53293 SRX1YKL086W 384 nt15.74■□□□□ 0.11
YGR168CP53293 Q0297Q0297 156 nt15.67■□□□□ 0.1
YGR168CP53293 YJL027CYJL027C 417 nt15.65■□□□□ 0.1
YGR168CP53293 YCR051WYCR051W 669 nt14.89□□□□□ -0.03
YGR168CP53293 DBP2YNL112W 1641 nt14.83□□□□□ -0.04
YGR168CP53293 SCS3YGL126W 1143 nt14.66□□□□□ -0.06
YGR168CP53293 YBR190WYBR190W 312 nt14.57□□□□□ -0.08
YGR168CP53293 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.39□□□□□ -0.11
YGR168CP53293 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.39□□□□□ -0.11
YGR168CP53293 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.39□□□□□ -0.11
YGR168CP53293 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.39□□□□□ -0.11
YGR168CP53293 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.39□□□□□ -0.11
YGR168CP53293 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.39□□□□□ -0.11
YGR168CP53293 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.39□□□□□ -0.11
YGR168CP53293 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.39□□□□□ -0.11
YGR168CP53293 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.39□□□□□ -0.11
YGR168CP53293 CCC1YLR220W 969 nt14.22□□□□□ -0.13
YGR168CP53293 RTC3YHR087W 336 nt14.21□□□□□ -0.13
YGR168CP53293 YOL085CYOL085C 342 nt14.13□□□□□ -0.15
YGR168CP53293 RPP1BYDL130W 321 nt14.06□□□□□ -0.16
YGR168CP53293 RVS167YDR388W 1449 nt13.99□□□□□ -0.17
YGR168CP53293 SSA3YBL075C 1950 nt13.92□□□□□ -0.18
YGR168CP53293 PKP1YIL042C 1185 nt13.91□□□□□ -0.18
YGR168CP53293 SCJ1YMR214W 1134 nt13.74□□□□□ -0.21
YGR168CP53293 PUT4YOR348C 1884 nt13.51□□□□□ -0.25
YGR168CP53293 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.51□□□□□ -0.25
YGR168CP53293 PET122YER153C 765 nt13.43□□□□□ -0.26
YGR168CP53293 SHR5YOL110W 714 nt13.4□□□□□ -0.26
YGR168CP53293 SCR1SCR1 522 nt13.28□□□□□ -0.28
YGR168CP53293 URN1YPR152C 1398 nt13.19□□□□□ -0.3
YGR168CP53293 ARE1YCR048W 1833 nt13.11□□□□□ -0.31
YGR168CP53293 YDJ1YNL064C 1230 nt13.11□□□□□ -0.31
YGR168CP53293 OPI9YLR338W 858 nt13.06□□□□□ -0.32
YGR168CP53293 POA1YBR022W 534 nt13.06□□□□□ -0.32
YGR168CP53293 DEP1YAL013W 1218 nt13.05□□□□□ -0.32
YGR168CP53293 ATS1YAL020C 1002 nt13.05□□□□□ -0.32
YGR168CP53293 SAH1YER043C 1350 nt13.02□□□□□ -0.33
YGR168CP53293 RRN5YLR141W 1092 nt13.01□□□□□ -0.33
YGR168CP53293 RPN10YHR200W 807 nt13□□□□□ -0.33
YGR168CP53293 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.96□□□□□ -0.33
YGR168CP53293 YNL208WYNL208W 600 nt12.89□□□□□ -0.35
YGR168CP53293 BSC6YOL137W 1494 nt12.89□□□□□ -0.35
YGR168CP53293 GAR1YHR089C 618 nt12.82□□□□□ -0.36
YGR168CP53293 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.76□□□□□ -0.37
YGR168CP53293 PUN1YLR414C 792 nt12.72□□□□□ -0.37
YGR168CP53293 RSB1YOR049C 1065 nt12.67□□□□□ -0.38
YGR168CP53293 SPT5YML010W 3192 nt12.65□□□□□ -0.39
YGR168CP53293 BUD23YCR047C 828 nt12.63□□□□□ -0.39
YGR168CP53293 YJR018WYJR018W 363 nt12.57□□□□□ -0.4
YGR168CP53293 PTC2YER089C 1395 nt12.56□□□□□ -0.4
YGR168CP53293 NAB2YGL122C 1578 nt12.47□□□□□ -0.41
YGR168CP53293 SSA4YER103W 1929 nt12.47□□□□□ -0.41
YGR168CP53293 TIR1YER011W 765 nt12.42□□□□□ -0.42
YGR168CP53293 RPP2BYDR382W 333 nt12.29□□□□□ -0.44
YGR168CP53293 SSA1YAL005C 1929 nt12.29□□□□□ -0.44
YGR168CP53293 DAL1YIR027C 1383 nt12.25□□□□□ -0.45
YGR168CP53293 YJR120WYJR120W 351 nt12.23□□□□□ -0.45
YGR168CP53293 FIS1YIL065C 468 nt12.22□□□□□ -0.45
YGR168CP53293 INM2YDR287W 879 nt12.2□□□□□ -0.46
YGR168CP53293 FPR4YLR449W 1179 nt12.19□□□□□ -0.46
YGR168CP53293 MEP2YNL142W 1500 nt12.13□□□□□ -0.47
YGR168CP53293 PST2YDR032C 597 nt12.13□□□□□ -0.47
YGR168CP53293 PHO4YFR034C 939 nt12.11□□□□□ -0.47
YGR168CP53293 BDF1YLR399C 2061 nt12.03□□□□□ -0.48
YGR168CP53293 YBL100CYBL100C 315 nt12□□□□□ -0.49
YGR168CP53293 YPS1YLR120C 1710 nt11.97□□□□□ -0.49
YGR168CP53293 DCW1YKL046C 1350 nt11.96□□□□□ -0.49
YGR168CP53293 SRB2YHR041C 633 nt11.95□□□□□ -0.5
YGR168CP53293 BDH2YAL061W 1254 nt11.95□□□□□ -0.5
YGR168CP53293 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.89□□□□□ -0.51
YGR168CP53293 TAT1YBR069C 1860 nt11.87□□□□□ -0.51
YGR168CP53293 YDR095CYDR095C 411 nt11.86□□□□□ -0.51
YGR168CP53293 FUN26YAL022C 1554 nt11.84□□□□□ -0.51
YGR168CP53293 TRM9YML014W 840 nt11.79□□□□□ -0.52
YGR168CP53293 WWM1YFL010C 636 nt11.78□□□□□ -0.52
YGR168CP53293 EMI2YDR516C 1503 nt11.77□□□□□ -0.52
YGR168CP53293 LSM3YLR438C-A 270 nt11.77□□□□□ -0.53
YGR168CP53293 ALF1YNL148C 765 nt11.77□□□□□ -0.53
YGR168CP53293 YBR220CYBR220C 1683 nt11.73□□□□□ -0.53
YGR168CP53293 YGR021WYGR021W 873 nt11.72□□□□□ -0.53
YGR168CP53293 YMR090WYMR090W 684 nt11.71□□□□□ -0.53
YGR168CP53293 CCT6YDR188W 1641 nt11.68□□□□□ -0.54
YGR168CP53293 SHU1YHL006C 453 nt11.68□□□□□ -0.54
YGR168CP53293 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.66□□□□□ -0.54
YGR168CP53293 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.65□□□□□ -0.54
YGR168CP53293 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.65□□□□□ -0.54
YGR168CP53293 RPP2AYOL039W 321 nt11.65□□□□□ -0.54
YGR168CP53293 YDL221WYDL221W 552 nt11.64□□□□□ -0.55
YGR168CP53293 CAC2YML102W 1407 nt11.61□□□□□ -0.55
YGR168CP53293 PTP1YDL230W 1008 nt11.6□□□□□ -0.55
YGR168CP53293 HOM6YJR139C 1080 nt11.6□□□□□ -0.55
YGR168CP53293 SDH1YKL148C 1923 nt11.59□□□□□ -0.55
YGR168CP53293 SIS1YNL007C 1059 nt11.57□□□□□ -0.56
YGR168CP53293 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.56□□□□□ -0.56
YGR168CP53293 YKL097CYKL097C 411 nt11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.8 ms