Protein–RNA interactions for Protein: P13393

SPT15, TATA-box-binding protein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT15P13393 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.26■□□□□ 0.83
SPT15P13393 NSR1YGR159C 1245 nt20.03■□□□□ 0.8
SPT15P13393 NOP1YDL014W 984 nt19.91■□□□□ 0.78
SPT15P13393 YKL036CYKL036C 393 nt18.58■□□□□ 0.56
SPT15P13393 Q0297Q0297 156 nt17.5■□□□□ 0.39
SPT15P13393 MDJ1YFL016C 1536 nt17.38■□□□□ 0.37
SPT15P13393 SRX1YKL086W 384 nt17.38■□□□□ 0.37
SPT15P13393 YJL027CYJL027C 417 nt17.35■□□□□ 0.37
SPT15P13393 SCS3YGL126W 1143 nt16.97■□□□□ 0.31
SPT15P13393 YCR051WYCR051W 669 nt16.44■□□□□ 0.22
SPT15P13393 YOL085CYOL085C 342 nt16.06■□□□□ 0.16
SPT15P13393 PKP1YIL042C 1185 nt15.7■□□□□ 0.1
SPT15P13393 RPP1BYDL130W 321 nt15.69■□□□□ 0.1
SPT15P13393 DBP2YNL112W 1641 nt15.54■□□□□ 0.08
SPT15P13393 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.53■□□□□ 0.08
SPT15P13393 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.53■□□□□ 0.08
SPT15P13393 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.53■□□□□ 0.08
SPT15P13393 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.53■□□□□ 0.08
SPT15P13393 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.53■□□□□ 0.08
SPT15P13393 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.53■□□□□ 0.08
SPT15P13393 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.53■□□□□ 0.08
SPT15P13393 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.53■□□□□ 0.08
SPT15P13393 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.53■□□□□ 0.08
SPT15P13393 SCJ1YMR214W 1134 nt15.5■□□□□ 0.07
SPT15P13393 CCC1YLR220W 969 nt15.31■□□□□ 0.04
SPT15P13393 ATS1YAL020C 1002 nt15.3■□□□□ 0.04
SPT15P13393 PET122YER153C 765 nt14.89□□□□□ -0.03
SPT15P13393 SCR1SCR1 522 nt14.89□□□□□ -0.03
SPT15P13393 YBR190WYBR190W 312 nt14.88□□□□□ -0.03
SPT15P13393 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.78□□□□□ -0.04
SPT15P13393 RVS167YDR388W 1449 nt14.74□□□□□ -0.05
SPT15P13393 RRN5YLR141W 1092 nt14.52□□□□□ -0.09
SPT15P13393 RTC3YHR087W 336 nt14.49□□□□□ -0.09
SPT15P13393 YDJ1YNL064C 1230 nt14.35□□□□□ -0.11
SPT15P13393 RSB1YOR049C 1065 nt14.28□□□□□ -0.12
SPT15P13393 SHR5YOL110W 714 nt14.27□□□□□ -0.13
SPT15P13393 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.24□□□□□ -0.13
SPT15P13393 PST2YDR032C 597 nt14.14□□□□□ -0.15
SPT15P13393 GAR1YHR089C 618 nt13.89□□□□□ -0.19
SPT15P13393 YKL097CYKL097C 411 nt13.69□□□□□ -0.22
SPT15P13393 DEP1YAL013W 1218 nt13.67□□□□□ -0.22
SPT15P13393 URN1YPR152C 1398 nt13.67□□□□□ -0.22
SPT15P13393 RPN10YHR200W 807 nt13.6□□□□□ -0.23
SPT15P13393 YNL208WYNL208W 600 nt13.6□□□□□ -0.23
SPT15P13393 OPI9YLR338W 858 nt13.46□□□□□ -0.25
SPT15P13393 TIR1YER011W 765 nt13.45□□□□□ -0.26
SPT15P13393 SHU1YHL006C 453 nt13.44□□□□□ -0.26
SPT15P13393 PUT4YOR348C 1884 nt13.25□□□□□ -0.29
SPT15P13393 SAH1YER043C 1350 nt13.24□□□□□ -0.29
SPT15P13393 SSA1YAL005C 1929 nt13.2□□□□□ -0.3
SPT15P13393 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.11□□□□□ -0.31
SPT15P13393 PUN1YLR414C 792 nt13.1□□□□□ -0.31
SPT15P13393 ARE1YCR048W 1833 nt13.09□□□□□ -0.31
SPT15P13393 YJR018WYJR018W 363 nt13.08□□□□□ -0.32
SPT15P13393 YOR139CYOR139C 393 nt13.06□□□□□ -0.32
SPT15P13393 YGR021WYGR021W 873 nt12.96□□□□□ -0.33
SPT15P13393 SRB2YHR041C 633 nt12.95□□□□□ -0.34
SPT15P13393 NPL3YDR432W 1245 nt12.93□□□□□ -0.34
SPT15P13393 RPP2BYDR382W 333 nt12.92□□□□□ -0.34
SPT15P13393 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.89□□□□□ -0.35
SPT15P13393 HOM6YJR139C 1080 nt12.88□□□□□ -0.35
SPT15P13393 YJR120WYJR120W 351 nt12.87□□□□□ -0.35
SPT15P13393 WWM1YFL010C 636 nt12.86□□□□□ -0.35
SPT15P13393 POA1YBR022W 534 nt12.84□□□□□ -0.35
SPT15P13393 PTC2YER089C 1395 nt12.82□□□□□ -0.36
SPT15P13393 YOL037CYOL037C 354 nt12.78□□□□□ -0.36
SPT15P13393 MNP1YGL068W 585 nt12.76□□□□□ -0.37
SPT15P13393 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.73□□□□□ -0.37
SPT15P13393 BDH2YAL061W 1254 nt12.7□□□□□ -0.38
SPT15P13393 RKM5YLR137W 1104 nt12.68□□□□□ -0.38
SPT15P13393 NAB2YGL122C 1578 nt12.67□□□□□ -0.38
SPT15P13393 INM2YDR287W 879 nt12.65□□□□□ -0.38
SPT15P13393 SSA3YBL075C 1950 nt12.64□□□□□ -0.39
SPT15P13393 LSM3YLR438C-A 270 nt12.64□□□□□ -0.39
SPT15P13393 BUD23YCR047C 828 nt12.61□□□□□ -0.39
SPT15P13393 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.57□□□□□ -0.4
SPT15P13393 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.57□□□□□ -0.4
SPT15P13393 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.57□□□□□ -0.4
SPT15P13393 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.57□□□□□ -0.4
SPT15P13393 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.57□□□□□ -0.4
SPT15P13393 DAL1YIR027C 1383 nt12.55□□□□□ -0.4
SPT15P13393 BSC6YOL137W 1494 nt12.51□□□□□ -0.41
SPT15P13393 YBL100CYBL100C 315 nt12.49□□□□□ -0.41
SPT15P13393 FIS1YIL065C 468 nt12.45□□□□□ -0.42
SPT15P13393 YLR281CYLR281C 468 nt12.45□□□□□ -0.42
SPT15P13393 FPR4YLR449W 1179 nt12.44□□□□□ -0.42
SPT15P13393 TRM9YML014W 840 nt12.42□□□□□ -0.42
SPT15P13393 PHO4YFR034C 939 nt12.38□□□□□ -0.43
SPT15P13393 PUS2YGL063W 1113 nt12.38□□□□□ -0.43
SPT15P13393 FUN26YAL022C 1554 nt12.35□□□□□ -0.43
SPT15P13393 WHI5YOR083W 888 nt12.34□□□□□ -0.43
SPT15P13393 CCT6YDR188W 1641 nt12.28□□□□□ -0.44
SPT15P13393 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.19□□□□□ -0.46
SPT15P13393 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.19□□□□□ -0.46
SPT15P13393 IMP2'YIL154C 1041 nt12.18□□□□□ -0.46
SPT15P13393 MOT3YMR070W 1473 nt12.16□□□□□ -0.46
SPT15P13393 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.15□□□□□ -0.46
SPT15P13393 ALF1YNL148C 765 nt12.14□□□□□ -0.47
SPT15P13393 DSK2YMR276W 1122 nt12.12□□□□□ -0.47
SPT15P13393 YPS1YLR120C 1710 nt12.08□□□□□ -0.48
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