Protein–RNA interactions for Protein: P52891

NUP84, Nucleoporin NUP84, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP84P52891 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.66■□□□□ 0.9
NUP84P52891 NOP1YDL014W 984 nt20.27■□□□□ 0.84
NUP84P52891 NSR1YGR159C 1245 nt20.18■□□□□ 0.82
NUP84P52891 YKL036CYKL036C 393 nt18.96■□□□□ 0.63
NUP84P52891 MDJ1YFL016C 1536 nt18.03■□□□□ 0.48
NUP84P52891 YJL027CYJL027C 417 nt17.79■□□□□ 0.44
NUP84P52891 Q0297Q0297 156 nt17.73■□□□□ 0.43
NUP84P52891 SRX1YKL086W 384 nt17.61■□□□□ 0.41
NUP84P52891 SCS3YGL126W 1143 nt17.36■□□□□ 0.37
NUP84P52891 YCR051WYCR051W 669 nt16.81■□□□□ 0.28
NUP84P52891 YOL085CYOL085C 342 nt16.34■□□□□ 0.21
NUP84P52891 PKP1YIL042C 1185 nt16.07■□□□□ 0.16
NUP84P52891 RPP1BYDL130W 321 nt15.94■□□□□ 0.14
NUP84P52891 SCJ1YMR214W 1134 nt15.84■□□□□ 0.13
NUP84P52891 DBP2YNL112W 1641 nt15.73■□□□□ 0.11
NUP84P52891 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.7■□□□□ 0.1
NUP84P52891 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.7■□□□□ 0.1
NUP84P52891 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.7■□□□□ 0.1
NUP84P52891 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.7■□□□□ 0.1
NUP84P52891 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.7■□□□□ 0.1
NUP84P52891 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.7■□□□□ 0.1
NUP84P52891 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.7■□□□□ 0.1
NUP84P52891 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.7■□□□□ 0.1
NUP84P52891 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.7■□□□□ 0.1
NUP84P52891 ATS1YAL020C 1002 nt15.62■□□□□ 0.09
NUP84P52891 CCC1YLR220W 969 nt15.62■□□□□ 0.09
NUP84P52891 YBR190WYBR190W 312 nt15.47■□□□□ 0.07
NUP84P52891 SCR1SCR1 522 nt15.23■□□□□ 0.03
NUP84P52891 PET122YER153C 765 nt15.16■□□□□ 0.02
NUP84P52891 RTC3YHR087W 336 nt15.13■□□□□ 0.01
NUP84P52891 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.98□□□□□ -0.01
NUP84P52891 RVS167YDR388W 1449 nt14.98□□□□□ -0.01
NUP84P52891 RRN5YLR141W 1092 nt14.76□□□□□ -0.05
NUP84P52891 RSB1YOR049C 1065 nt14.64□□□□□ -0.07
NUP84P52891 SSA3YBL075C 1950 nt14.57□□□□□ -0.08
NUP84P52891 YDJ1YNL064C 1230 nt14.5□□□□□ -0.09
NUP84P52891 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.46□□□□□ -0.09
NUP84P52891 SHR5YOL110W 714 nt14.44□□□□□ -0.1
NUP84P52891 PUT4YOR348C 1884 nt14.4□□□□□ -0.1
NUP84P52891 PST2YDR032C 597 nt14.36□□□□□ -0.11
NUP84P52891 GAR1YHR089C 618 nt14.15□□□□□ -0.14
NUP84P52891 YKL097CYKL097C 411 nt14.09□□□□□ -0.15
NUP84P52891 ARE1YCR048W 1833 nt14.01□□□□□ -0.17
NUP84P52891 URN1YPR152C 1398 nt13.98□□□□□ -0.17
NUP84P52891 POA1YBR022W 534 nt13.92□□□□□ -0.18
NUP84P52891 SAH1YER043C 1350 nt13.91□□□□□ -0.18
NUP84P52891 DEP1YAL013W 1218 nt13.9□□□□□ -0.18
NUP84P52891 OPI9YLR338W 858 nt13.87□□□□□ -0.19
NUP84P52891 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.86□□□□□ -0.19
NUP84P52891 RPN10YHR200W 807 nt13.81□□□□□ -0.2
NUP84P52891 YNL208WYNL208W 600 nt13.76□□□□□ -0.21
NUP84P52891 BSC6YOL137W 1494 nt13.72□□□□□ -0.21
NUP84P52891 SHU1YHL006C 453 nt13.71□□□□□ -0.21
NUP84P52891 TIR1YER011W 765 nt13.64□□□□□ -0.23
NUP84P52891 BUD23YCR047C 828 nt13.5□□□□□ -0.25
NUP84P52891 PUN1YLR414C 792 nt13.47□□□□□ -0.25
NUP84P52891 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.4□□□□□ -0.26
NUP84P52891 PTC2YER089C 1395 nt13.39□□□□□ -0.27
NUP84P52891 SPT5YML010W 3192 nt13.38□□□□□ -0.27
NUP84P52891 SSA1YAL005C 1929 nt13.33□□□□□ -0.28
NUP84P52891 NPL3YDR432W 1245 nt13.32□□□□□ -0.28
NUP84P52891 YOR139CYOR139C 393 nt13.32□□□□□ -0.28
NUP84P52891 YJR018WYJR018W 363 nt13.31□□□□□ -0.28
NUP84P52891 NAB2YGL122C 1578 nt13.27□□□□□ -0.29
NUP84P52891 YGR021WYGR021W 873 nt13.2□□□□□ -0.3
NUP84P52891 SSA4YER103W 1929 nt13.15□□□□□ -0.3
NUP84P52891 RPP2BYDR382W 333 nt13.14□□□□□ -0.31
NUP84P52891 WWM1YFL010C 636 nt13.06□□□□□ -0.32
NUP84P52891 SRB2YHR041C 633 nt13.06□□□□□ -0.32
NUP84P52891 FIS1YIL065C 468 nt13.06□□□□□ -0.32
NUP84P52891 HOM6YJR139C 1080 nt13.06□□□□□ -0.32
NUP84P52891 YOL037CYOL037C 354 nt13.06□□□□□ -0.32
NUP84P52891 MNP1YGL068W 585 nt13.05□□□□□ -0.32
NUP84P52891 DAL1YIR027C 1383 nt13.01□□□□□ -0.33
NUP84P52891 YJR120WYJR120W 351 nt13□□□□□ -0.33
NUP84P52891 FPR4YLR449W 1179 nt12.99□□□□□ -0.33
NUP84P52891 MEP2YNL142W 1500 nt12.92□□□□□ -0.34
NUP84P52891 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.9□□□□□ -0.34
NUP84P52891 PHO4YFR034C 939 nt12.9□□□□□ -0.34
NUP84P52891 RKM5YLR137W 1104 nt12.9□□□□□ -0.34
NUP84P52891 INM2YDR287W 879 nt12.87□□□□□ -0.35
NUP84P52891 BDH2YAL061W 1254 nt12.83□□□□□ -0.36
NUP84P52891 YPS1YLR120C 1710 nt12.8□□□□□ -0.36
NUP84P52891 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.8□□□□□ -0.36
NUP84P52891 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.8□□□□□ -0.36
NUP84P52891 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.8□□□□□ -0.36
NUP84P52891 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.8□□□□□ -0.36
NUP84P52891 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.8□□□□□ -0.36
NUP84P52891 LSM3YLR438C-A 270 nt12.74□□□□□ -0.37
NUP84P52891 DCW1YKL046C 1350 nt12.71□□□□□ -0.37
NUP84P52891 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.71□□□□□ -0.37
NUP84P52891 YBL100CYBL100C 315 nt12.71□□□□□ -0.37
NUP84P52891 BDF1YLR399C 2061 nt12.68□□□□□ -0.38
NUP84P52891 PUS2YGL063W 1113 nt12.67□□□□□ -0.38
NUP84P52891 YDR095CYDR095C 411 nt12.65□□□□□ -0.38
NUP84P52891 YLR281CYLR281C 468 nt12.64□□□□□ -0.39
NUP84P52891 TRM9YML014W 840 nt12.58□□□□□ -0.4
NUP84P52891 WHI5YOR083W 888 nt12.57□□□□□ -0.4
NUP84P52891 EMI2YDR516C 1503 nt12.53□□□□□ -0.4
NUP84P52891 FUN26YAL022C 1554 nt12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.7 ms