Protein–RNA interactions for Protein: P36111

YKR015C, Uncharacterized protein YKR015C, yeastyeast

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR015CP36111 NSR1YGR159C 1245 nt18.47■□□□□ 0.55
YKR015CP36111 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.92■□□□□ 0.46
YKR015CP36111 NOP1YDL014W 984 nt17.23■□□□□ 0.35
YKR015CP36111 MDJ1YFL016C 1536 nt17.18■□□□□ 0.34
YKR015CP36111 YJL027CYJL027C 417 nt15.78■□□□□ 0.12
YKR015CP36111 YKL036CYKL036C 393 nt15.65■□□□□ 0.1
YKR015CP36111 SSA3YBL075C 1950 nt15.14■□□□□ 0.01
YKR015CP36111 SRX1YKL086W 384 nt15.02■□□□□ -0
YKR015CP36111 Q0297Q0297 156 nt14.96□□□□□ -0.01
YKR015CP36111 YBR190WYBR190W 312 nt14.85□□□□□ -0.03
YKR015CP36111 DBP2YNL112W 1641 nt14.84□□□□□ -0.03
YKR015CP36111 RTC3YHR087W 336 nt14.51□□□□□ -0.09
YKR015CP36111 YCR051WYCR051W 669 nt14.24□□□□□ -0.13
YKR015CP36111 SCS3YGL126W 1143 nt14.19□□□□□ -0.14
YKR015CP36111 PUT4YOR348C 1884 nt14.08□□□□□ -0.16
YKR015CP36111 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.95□□□□□ -0.18
YKR015CP36111 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.95□□□□□ -0.18
YKR015CP36111 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.95□□□□□ -0.18
YKR015CP36111 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.95□□□□□ -0.18
YKR015CP36111 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.95□□□□□ -0.18
YKR015CP36111 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.95□□□□□ -0.18
YKR015CP36111 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.95□□□□□ -0.18
YKR015CP36111 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.95□□□□□ -0.18
YKR015CP36111 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.95□□□□□ -0.18
YKR015CP36111 CCC1YLR220W 969 nt13.83□□□□□ -0.2
YKR015CP36111 RVS167YDR388W 1449 nt13.82□□□□□ -0.2
YKR015CP36111 POA1YBR022W 534 nt13.6□□□□□ -0.23
YKR015CP36111 ARE1YCR048W 1833 nt13.58□□□□□ -0.24
YKR015CP36111 SCJ1YMR214W 1134 nt13.56□□□□□ -0.24
YKR015CP36111 YOL085CYOL085C 342 nt13.56□□□□□ -0.24
YKR015CP36111 BSC6YOL137W 1494 nt13.46□□□□□ -0.25
YKR015CP36111 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.45□□□□□ -0.26
YKR015CP36111 RPP1BYDL130W 321 nt13.41□□□□□ -0.26
YKR015CP36111 SPT5YML010W 3192 nt13.37□□□□□ -0.27
YKR015CP36111 SAH1YER043C 1350 nt13.36□□□□□ -0.27
YKR015CP36111 SSA4YER103W 1929 nt13.35□□□□□ -0.27
YKR015CP36111 PKP1YIL042C 1185 nt13.3□□□□□ -0.28
YKR015CP36111 URN1YPR152C 1398 nt13.27□□□□□ -0.29
YKR015CP36111 OPI9YLR338W 858 nt13.23□□□□□ -0.29
YKR015CP36111 SHR5YOL110W 714 nt13.13□□□□□ -0.31
YKR015CP36111 BUD23YCR047C 828 nt13.08□□□□□ -0.32
YKR015CP36111 DEP1YAL013W 1218 nt13.04□□□□□ -0.32
YKR015CP36111 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.93□□□□□ -0.34
YKR015CP36111 RPN10YHR200W 807 nt12.9□□□□□ -0.34
YKR015CP36111 BDF1YLR399C 2061 nt12.89□□□□□ -0.35
YKR015CP36111 PUN1YLR414C 792 nt12.85□□□□□ -0.35
YKR015CP36111 PTC2YER089C 1395 nt12.83□□□□□ -0.36
YKR015CP36111 PET122YER153C 765 nt12.83□□□□□ -0.36
YKR015CP36111 NAB2YGL122C 1578 nt12.77□□□□□ -0.37
YKR015CP36111 YNL208WYNL208W 600 nt12.74□□□□□ -0.37
YKR015CP36111 TAT1YBR069C 1860 nt12.72□□□□□ -0.37
YKR015CP36111 MEP2YNL142W 1500 nt12.71□□□□□ -0.38
YKR015CP36111 ATS1YAL020C 1002 nt12.67□□□□□ -0.38
YKR015CP36111 SCR1SCR1 522 nt12.66□□□□□ -0.38
YKR015CP36111 YJR018WYJR018W 363 nt12.6□□□□□ -0.39
YKR015CP36111 PAC11YDR488C 1602 nt12.59□□□□□ -0.39
YKR015CP36111 YDJ1YNL064C 1230 nt12.52□□□□□ -0.41
YKR015CP36111 FIS1YIL065C 468 nt12.51□□□□□ -0.41
YKR015CP36111 DCW1YKL046C 1350 nt12.49□□□□□ -0.41
YKR015CP36111 DAL1YIR027C 1383 nt12.45□□□□□ -0.42
YKR015CP36111 RRN5YLR141W 1092 nt12.43□□□□□ -0.42
YKR015CP36111 FPR4YLR449W 1179 nt12.43□□□□□ -0.42
YKR015CP36111 GAR1YHR089C 618 nt12.38□□□□□ -0.43
YKR015CP36111 YPS1YLR120C 1710 nt12.37□□□□□ -0.43
YKR015CP36111 PHO4YFR034C 939 nt12.34□□□□□ -0.43
YKR015CP36111 YBR220CYBR220C 1683 nt12.34□□□□□ -0.43
YKR015CP36111 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.32□□□□□ -0.44
YKR015CP36111 YMR090WYMR090W 684 nt12.32□□□□□ -0.44
YKR015CP36111 EMI2YDR516C 1503 nt12.31□□□□□ -0.44
YKR015CP36111 INM2YDR287W 879 nt12.25□□□□□ -0.45
YKR015CP36111 YJR120WYJR120W 351 nt12.21□□□□□ -0.45
YKR015CP36111 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.18□□□□□ -0.46
YKR015CP36111 NVJ2YPR091C 2313 nt12.17□□□□□ -0.46
YKR015CP36111 YDR095CYDR095C 411 nt12.17□□□□□ -0.46
YKR015CP36111 SDH1YKL148C 1923 nt12.15□□□□□ -0.46
YKR015CP36111 YDL221WYDL221W 552 nt12.15□□□□□ -0.46
YKR015CP36111 RPP2BYDR382W 333 nt12.15□□□□□ -0.46
YKR015CP36111 RSB1YOR049C 1065 nt12.1□□□□□ -0.47
YKR015CP36111 PCH2YBR186W 1695 nt12.1□□□□□ -0.47
YKR015CP36111 GUT2YIL155C 1950 nt12.05□□□□□ -0.48
YKR015CP36111 SEC11YIR022W 504 nt12.04□□□□□ -0.48
YKR015CP36111 YBL100CYBL100C 315 nt12.02□□□□□ -0.49
YKR015CP36111 CAC2YML102W 1407 nt12.02□□□□□ -0.49
YKR015CP36111 SSA1YAL005C 1929 nt12□□□□□ -0.49
YKR015CP36111 TIR1YER011W 765 nt12□□□□□ -0.49
YKR015CP36111 SCC4YER147C 1875 nt11.96□□□□□ -0.49
YKR015CP36111 PTP1YDL230W 1008 nt11.95□□□□□ -0.5
YKR015CP36111 RPP2AYOL039W 321 nt11.95□□□□□ -0.5
YKR015CP36111 ALF1YNL148C 765 nt11.87□□□□□ -0.51
YKR015CP36111 IRC15YPL017C 1500 nt11.84□□□□□ -0.51
YKR015CP36111 FUN26YAL022C 1554 nt11.84□□□□□ -0.51
YKR015CP36111 PIB2YGL023C 1908 nt11.8□□□□□ -0.52
YKR015CP36111 PST2YDR032C 597 nt11.79□□□□□ -0.52
YKR015CP36111 GIS3YLR094C 1509 nt11.79□□□□□ -0.52
YKR015CP36111 YSC84YHR016C 1407 nt11.78□□□□□ -0.52
YKR015CP36111 BDH2YAL061W 1254 nt11.75□□□□□ -0.53
YKR015CP36111 RTF1YGL244W 1677 nt11.73□□□□□ -0.53
YKR015CP36111 TRM9YML014W 840 nt11.67□□□□□ -0.54
YKR015CP36111 YHL050CYHL050C 2094 nt11.67□□□□□ -0.54
YKR015CP36111 SIS1YNL007C 1059 nt11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.5 ms