Protein–RNA interactions for Protein: P36130

CAF4, CCR4-associated factor 4, yeastyeast

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CAF4P36130 NSR1YGR159C 1245 nt19.73■□□□□ 0.75
CAF4P36130 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.69■□□□□ 0.74
CAF4P36130 NOP1YDL014W 984 nt19■□□□□ 0.63
CAF4P36130 MDJ1YFL016C 1536 nt17.8■□□□□ 0.44
CAF4P36130 YKL036CYKL036C 393 nt17.31■□□□□ 0.36
CAF4P36130 SRX1YKL086W 384 nt16.6■□□□□ 0.25
CAF4P36130 Q0297Q0297 156 nt16.54■□□□□ 0.24
CAF4P36130 YJL027CYJL027C 417 nt16.4■□□□□ 0.22
CAF4P36130 YCR051WYCR051W 669 nt15.76■□□□□ 0.11
CAF4P36130 SCS3YGL126W 1143 nt15.63■□□□□ 0.09
CAF4P36130 DBP2YNL112W 1641 nt15.61■□□□□ 0.09
CAF4P36130 YBR190WYBR190W 312 nt15.21■□□□□ 0.03
CAF4P36130 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.16■□□□□ 0.02
CAF4P36130 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.16■□□□□ 0.02
CAF4P36130 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.16■□□□□ 0.02
CAF4P36130 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.16■□□□□ 0.02
CAF4P36130 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.16■□□□□ 0.02
CAF4P36130 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.16■□□□□ 0.02
CAF4P36130 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.16■□□□□ 0.02
CAF4P36130 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.16■□□□□ 0.02
CAF4P36130 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.16■□□□□ 0.02
CAF4P36130 CCC1YLR220W 969 nt15.04■□□□□ -0
CAF4P36130 YOL085CYOL085C 342 nt14.99□□□□□ -0.01
CAF4P36130 RTC3YHR087W 336 nt14.9□□□□□ -0.02
CAF4P36130 RPP1BYDL130W 321 nt14.85□□□□□ -0.03
CAF4P36130 PKP1YIL042C 1185 nt14.84□□□□□ -0.03
CAF4P36130 RVS167YDR388W 1449 nt14.64□□□□□ -0.07
CAF4P36130 SCJ1YMR214W 1134 nt14.52□□□□□ -0.09
CAF4P36130 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.27□□□□□ -0.13
CAF4P36130 PET122YER153C 765 nt14.24□□□□□ -0.13
CAF4P36130 SHR5YOL110W 714 nt14.07□□□□□ -0.16
CAF4P36130 SCR1SCR1 522 nt14.01□□□□□ -0.17
CAF4P36130 PUT4YOR348C 1884 nt13.99□□□□□ -0.17
CAF4P36130 ATS1YAL020C 1002 nt13.89□□□□□ -0.19
CAF4P36130 URN1YPR152C 1398 nt13.84□□□□□ -0.19
CAF4P36130 RRN5YLR141W 1092 nt13.8□□□□□ -0.2
CAF4P36130 DEP1YAL013W 1218 nt13.79□□□□□ -0.2
CAF4P36130 YDJ1YNL064C 1230 nt13.79□□□□□ -0.2
CAF4P36130 ARE1YCR048W 1833 nt13.67□□□□□ -0.22
CAF4P36130 OPI9YLR338W 858 nt13.67□□□□□ -0.22
CAF4P36130 SAH1YER043C 1350 nt13.67□□□□□ -0.22
CAF4P36130 SSA3YBL075C 1950 nt13.65□□□□□ -0.22
CAF4P36130 RPN10YHR200W 807 nt13.57□□□□□ -0.24
CAF4P36130 POA1YBR022W 534 nt13.57□□□□□ -0.24
CAF4P36130 GAR1YHR089C 618 nt13.55□□□□□ -0.24
CAF4P36130 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.53□□□□□ -0.24
CAF4P36130 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.51□□□□□ -0.25
CAF4P36130 YNL208WYNL208W 600 nt13.51□□□□□ -0.25
CAF4P36130 RSB1YOR049C 1065 nt13.46□□□□□ -0.25
CAF4P36130 BSC6YOL137W 1494 nt13.31□□□□□ -0.28
CAF4P36130 PUN1YLR414C 792 nt13.28□□□□□ -0.28
CAF4P36130 BUD23YCR047C 828 nt13.21□□□□□ -0.29
CAF4P36130 YJR018WYJR018W 363 nt13.19□□□□□ -0.3
CAF4P36130 PTC2YER089C 1395 nt13.17□□□□□ -0.3
CAF4P36130 TIR1YER011W 765 nt13.09□□□□□ -0.31
CAF4P36130 NAB2YGL122C 1578 nt13.02□□□□□ -0.33
CAF4P36130 SSA1YAL005C 1929 nt12.99□□□□□ -0.33
CAF4P36130 YJR120WYJR120W 351 nt12.92□□□□□ -0.34
CAF4P36130 PST2YDR032C 597 nt12.9□□□□□ -0.34
CAF4P36130 RPP2BYDR382W 333 nt12.86□□□□□ -0.35
CAF4P36130 FIS1YIL065C 468 nt12.82□□□□□ -0.36
CAF4P36130 FPR4YLR449W 1179 nt12.81□□□□□ -0.36
CAF4P36130 DAL1YIR027C 1383 nt12.8□□□□□ -0.36
CAF4P36130 SPT5YML010W 3192 nt12.79□□□□□ -0.36
CAF4P36130 INM2YDR287W 879 nt12.73□□□□□ -0.37
CAF4P36130 SRB2YHR041C 633 nt12.73□□□□□ -0.37
CAF4P36130 PHO4YFR034C 939 nt12.69□□□□□ -0.38
CAF4P36130 YBL100CYBL100C 315 nt12.6□□□□□ -0.39
CAF4P36130 BDH2YAL061W 1254 nt12.55□□□□□ -0.4
CAF4P36130 YPS1YLR120C 1710 nt12.52□□□□□ -0.41
CAF4P36130 MEP2YNL142W 1500 nt12.5□□□□□ -0.41
CAF4P36130 SSA4YER103W 1929 nt12.49□□□□□ -0.41
CAF4P36130 WWM1YFL010C 636 nt12.49□□□□□ -0.41
CAF4P36130 SHU1YHL006C 453 nt12.45□□□□□ -0.42
CAF4P36130 FUN26YAL022C 1554 nt12.43□□□□□ -0.42
CAF4P36130 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.42□□□□□ -0.42
CAF4P36130 YDR095CYDR095C 411 nt12.4□□□□□ -0.42
CAF4P36130 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.36□□□□□ -0.43
CAF4P36130 TRM9YML014W 840 nt12.35□□□□□ -0.43
CAF4P36130 DCW1YKL046C 1350 nt12.32□□□□□ -0.44
CAF4P36130 YGR021WYGR021W 873 nt12.32□□□□□ -0.44
CAF4P36130 LSM3YLR438C-A 270 nt12.32□□□□□ -0.44
CAF4P36130 ALF1YNL148C 765 nt12.31□□□□□ -0.44
CAF4P36130 YKL097CYKL097C 411 nt12.28□□□□□ -0.44
CAF4P36130 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.27□□□□□ -0.45
CAF4P36130 HOM6YJR139C 1080 nt12.27□□□□□ -0.45
CAF4P36130 CCT6YDR188W 1641 nt12.22□□□□□ -0.45
CAF4P36130 MNP1YGL068W 585 nt12.2□□□□□ -0.46
CAF4P36130 RPP2AYOL039W 321 nt12.18□□□□□ -0.46
CAF4P36130 EMI2YDR516C 1503 nt12.16□□□□□ -0.46
CAF4P36130 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.15□□□□□ -0.46
CAF4P36130 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.15□□□□□ -0.46
CAF4P36130 PTP1YDL230W 1008 nt12.14□□□□□ -0.47
CAF4P36130 SIS1YNL007C 1059 nt12.1□□□□□ -0.47
CAF4P36130 CAC2YML102W 1407 nt12.1□□□□□ -0.47
CAF4P36130 RKM5YLR137W 1104 nt12.09□□□□□ -0.47
CAF4P36130 YMR090WYMR090W 684 nt12.09□□□□□ -0.47
CAF4P36130 YDL221WYDL221W 552 nt12.04□□□□□ -0.48
CAF4P36130 YBR220CYBR220C 1683 nt11.99□□□□□ -0.49
CAF4P36130 BDF1YLR399C 2061 nt11.99□□□□□ -0.49
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