Protein–RNA interactions for Protein: Q04511

UFO1, Ubiquitin ligase complex F-box protein UFO1, yeastyeast

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFO1Q04511 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.3■■□□□ 1
UFO1Q04511 NSR1YGR159C 1245 nt21.28■■□□□ 1
UFO1Q04511 NOP1YDL014W 984 nt20.58■□□□□ 0.89
UFO1Q04511 MDJ1YFL016C 1536 nt19.14■□□□□ 0.65
UFO1Q04511 YKL036CYKL036C 393 nt18.86■□□□□ 0.61
UFO1Q04511 SRX1YKL086W 384 nt18.01■□□□□ 0.47
UFO1Q04511 Q0297Q0297 156 nt17.99■□□□□ 0.47
UFO1Q04511 YJL027CYJL027C 417 nt17.6■□□□□ 0.41
UFO1Q04511 SCS3YGL126W 1143 nt17.11■□□□□ 0.33
UFO1Q04511 YCR051WYCR051W 669 nt17.08■□□□□ 0.32
UFO1Q04511 DBP2YNL112W 1641 nt16.87■□□□□ 0.29
UFO1Q04511 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.43■□□□□ 0.22
UFO1Q04511 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.43■□□□□ 0.22
UFO1Q04511 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.43■□□□□ 0.22
UFO1Q04511 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.43■□□□□ 0.22
UFO1Q04511 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.43■□□□□ 0.22
UFO1Q04511 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.43■□□□□ 0.22
UFO1Q04511 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.43■□□□□ 0.22
UFO1Q04511 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.43■□□□□ 0.22
UFO1Q04511 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.43■□□□□ 0.22
UFO1Q04511 YOL085CYOL085C 342 nt16.36■□□□□ 0.21
UFO1Q04511 YBR190WYBR190W 312 nt16.31■□□□□ 0.2
UFO1Q04511 CCC1YLR220W 969 nt16.23■□□□□ 0.19
UFO1Q04511 RPP1BYDL130W 321 nt16.15■□□□□ 0.18
UFO1Q04511 PKP1YIL042C 1185 nt16.15■□□□□ 0.18
UFO1Q04511 RTC3YHR087W 336 nt15.93■□□□□ 0.14
UFO1Q04511 RVS167YDR388W 1449 nt15.74■□□□□ 0.11
UFO1Q04511 SCJ1YMR214W 1134 nt15.73■□□□□ 0.11
UFO1Q04511 PET122YER153C 765 nt15.49■□□□□ 0.07
UFO1Q04511 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.46■□□□□ 0.07
UFO1Q04511 ATS1YAL020C 1002 nt15.22■□□□□ 0.03
UFO1Q04511 SCR1SCR1 522 nt15.2■□□□□ 0.02
UFO1Q04511 SHR5YOL110W 714 nt15.19■□□□□ 0.02
UFO1Q04511 RRN5YLR141W 1092 nt14.99□□□□□ -0.01
UFO1Q04511 PUT4YOR348C 1884 nt14.99□□□□□ -0.01
UFO1Q04511 YDJ1YNL064C 1230 nt14.95□□□□□ -0.02
UFO1Q04511 URN1YPR152C 1398 nt14.87□□□□□ -0.03
UFO1Q04511 DEP1YAL013W 1218 nt14.84□□□□□ -0.03
UFO1Q04511 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.71□□□□□ -0.05
UFO1Q04511 OPI9YLR338W 858 nt14.69□□□□□ -0.06
UFO1Q04511 ARE1YCR048W 1833 nt14.66□□□□□ -0.06
UFO1Q04511 SAH1YER043C 1350 nt14.66□□□□□ -0.06
UFO1Q04511 GAR1YHR089C 618 nt14.66□□□□□ -0.06
UFO1Q04511 RSB1YOR049C 1065 nt14.63□□□□□ -0.07
UFO1Q04511 RPN10YHR200W 807 nt14.58□□□□□ -0.08
UFO1Q04511 YNL208WYNL208W 600 nt14.55□□□□□ -0.08
UFO1Q04511 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.48□□□□□ -0.09
UFO1Q04511 POA1YBR022W 534 nt14.48□□□□□ -0.09
UFO1Q04511 SSA3YBL075C 1950 nt14.36□□□□□ -0.11
UFO1Q04511 PUN1YLR414C 792 nt14.24□□□□□ -0.13
UFO1Q04511 BSC6YOL137W 1494 nt14.23□□□□□ -0.13
UFO1Q04511 TIR1YER011W 765 nt14.17□□□□□ -0.14
UFO1Q04511 YJR018WYJR018W 363 nt14.16□□□□□ -0.14
UFO1Q04511 PST2YDR032C 597 nt14.13□□□□□ -0.15
UFO1Q04511 PTC2YER089C 1395 nt14.12□□□□□ -0.15
UFO1Q04511 BUD23YCR047C 828 nt14.1□□□□□ -0.15
UFO1Q04511 SSA1YAL005C 1929 nt14.06□□□□□ -0.16
UFO1Q04511 YJR120WYJR120W 351 nt13.99□□□□□ -0.17
UFO1Q04511 NAB2YGL122C 1578 nt13.93□□□□□ -0.18
UFO1Q04511 SRB2YHR041C 633 nt13.85□□□□□ -0.19
UFO1Q04511 RPP2BYDR382W 333 nt13.81□□□□□ -0.2
UFO1Q04511 FIS1YIL065C 468 nt13.8□□□□□ -0.2
UFO1Q04511 DAL1YIR027C 1383 nt13.74□□□□□ -0.21
UFO1Q04511 FPR4YLR449W 1179 nt13.7□□□□□ -0.22
UFO1Q04511 SPT5YML010W 3192 nt13.69□□□□□ -0.22
UFO1Q04511 INM2YDR287W 879 nt13.65□□□□□ -0.22
UFO1Q04511 PHO4YFR034C 939 nt13.64□□□□□ -0.23
UFO1Q04511 SHU1YHL006C 453 nt13.63□□□□□ -0.23
UFO1Q04511 WWM1YFL010C 636 nt13.54□□□□□ -0.24
UFO1Q04511 YBL100CYBL100C 315 nt13.54□□□□□ -0.24
UFO1Q04511 BDH2YAL061W 1254 nt13.53□□□□□ -0.24
UFO1Q04511 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.47□□□□□ -0.25
UFO1Q04511 YKL097CYKL097C 411 nt13.47□□□□□ -0.25
UFO1Q04511 YPS1YLR120C 1710 nt13.42□□□□□ -0.26
UFO1Q04511 FUN26YAL022C 1554 nt13.37□□□□□ -0.27
UFO1Q04511 YGR021WYGR021W 873 nt13.37□□□□□ -0.27
UFO1Q04511 MEP2YNL142W 1500 nt13.36□□□□□ -0.27
UFO1Q04511 HOM6YJR139C 1080 nt13.35□□□□□ -0.27
UFO1Q04511 YDR095CYDR095C 411 nt13.32□□□□□ -0.28
UFO1Q04511 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.3□□□□□ -0.28
UFO1Q04511 MNP1YGL068W 585 nt13.3□□□□□ -0.28
UFO1Q04511 LSM3YLR438C-A 270 nt13.29□□□□□ -0.28
UFO1Q04511 TRM9YML014W 840 nt13.27□□□□□ -0.29
UFO1Q04511 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.26□□□□□ -0.29
UFO1Q04511 SSA4YER103W 1929 nt13.25□□□□□ -0.29
UFO1Q04511 ALF1YNL148C 765 nt13.19□□□□□ -0.3
UFO1Q04511 CCT6YDR188W 1641 nt13.18□□□□□ -0.3
UFO1Q04511 DCW1YKL046C 1350 nt13.18□□□□□ -0.3
UFO1Q04511 RKM5YLR137W 1104 nt13.15□□□□□ -0.3
UFO1Q04511 PTP1YDL230W 1008 nt13.06□□□□□ -0.32
UFO1Q04511 RPP2AYOL039W 321 nt13.05□□□□□ -0.32
UFO1Q04511 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.04□□□□□ -0.32
UFO1Q04511 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.04□□□□□ -0.32
UFO1Q04511 SIS1YNL007C 1059 nt13.01□□□□□ -0.33
UFO1Q04511 YOR139CYOR139C 393 nt13.01□□□□□ -0.33
UFO1Q04511 EMI2YDR516C 1503 nt12.98□□□□□ -0.33
UFO1Q04511 CAC2YML102W 1407 nt12.97□□□□□ -0.33
UFO1Q04511 YOL037CYOL037C 354 nt12.95□□□□□ -0.34
UFO1Q04511 NPL3YDR432W 1245 nt12.89□□□□□ -0.35
UFO1Q04511 YDL221WYDL221W 552 nt12.88□□□□□ -0.35
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