Protein–RNA interactions for Protein: P20095

PRP2, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase-like protein PRP2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP2P20095 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.57■□□□□ 0.72
PRP2P20095 NSR1YGR159C 1245 nt19.18■□□□□ 0.66
PRP2P20095 NOP1YDL014W 984 nt19.01■□□□□ 0.63
PRP2P20095 YKL036CYKL036C 393 nt17.7■□□□□ 0.42
PRP2P20095 MDJ1YFL016C 1536 nt16.99■□□□□ 0.31
PRP2P20095 Q0297Q0297 156 nt16.64■□□□□ 0.25
PRP2P20095 YJL027CYJL027C 417 nt16.6■□□□□ 0.25
PRP2P20095 SRX1YKL086W 384 nt16.59■□□□□ 0.25
PRP2P20095 SCS3YGL126W 1143 nt16.19■□□□□ 0.18
PRP2P20095 YCR051WYCR051W 669 nt15.86■□□□□ 0.13
PRP2P20095 YOL085CYOL085C 342 nt15.32■□□□□ 0.04
PRP2P20095 PKP1YIL042C 1185 nt15.17■□□□□ 0.02
PRP2P20095 DBP2YNL112W 1641 nt15□□□□□ -0.01
PRP2P20095 RPP1BYDL130W 321 nt14.97□□□□□ -0.01
PRP2P20095 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.9□□□□□ -0.02
PRP2P20095 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.9□□□□□ -0.02
PRP2P20095 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.9□□□□□ -0.02
PRP2P20095 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.9□□□□□ -0.02
PRP2P20095 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.9□□□□□ -0.02
PRP2P20095 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.9□□□□□ -0.02
PRP2P20095 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.9□□□□□ -0.02
PRP2P20095 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.9□□□□□ -0.02
PRP2P20095 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.9□□□□□ -0.02
PRP2P20095 CCC1YLR220W 969 nt14.89□□□□□ -0.03
PRP2P20095 ATS1YAL020C 1002 nt14.51□□□□□ -0.09
PRP2P20095 SCJ1YMR214W 1134 nt14.43□□□□□ -0.1
PRP2P20095 YBR190WYBR190W 312 nt14.36□□□□□ -0.11
PRP2P20095 PET122YER153C 765 nt14.33□□□□□ -0.12
PRP2P20095 SCR1SCR1 522 nt14.22□□□□□ -0.13
PRP2P20095 RVS167YDR388W 1449 nt14.21□□□□□ -0.13
PRP2P20095 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.18□□□□□ -0.14
PRP2P20095 RTC3YHR087W 336 nt14.18□□□□□ -0.14
PRP2P20095 RRN5YLR141W 1092 nt13.93□□□□□ -0.18
PRP2P20095 RSB1YOR049C 1065 nt13.73□□□□□ -0.21
PRP2P20095 SHR5YOL110W 714 nt13.72□□□□□ -0.21
PRP2P20095 YDJ1YNL064C 1230 nt13.66□□□□□ -0.22
PRP2P20095 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.64□□□□□ -0.23
PRP2P20095 SSA3YBL075C 1950 nt13.57□□□□□ -0.24
PRP2P20095 GAR1YHR089C 618 nt13.45□□□□□ -0.26
PRP2P20095 DEP1YAL013W 1218 nt13.39□□□□□ -0.27
PRP2P20095 PST2YDR032C 597 nt13.38□□□□□ -0.27
PRP2P20095 URN1YPR152C 1398 nt13.28□□□□□ -0.28
PRP2P20095 YNL208WYNL208W 600 nt13.11□□□□□ -0.31
PRP2P20095 RPN10YHR200W 807 nt13.1□□□□□ -0.31
PRP2P20095 YKL097CYKL097C 411 nt13□□□□□ -0.33
PRP2P20095 OPI9YLR338W 858 nt12.99□□□□□ -0.33
PRP2P20095 PUT4YOR348C 1884 nt12.96□□□□□ -0.33
PRP2P20095 TIR1YER011W 765 nt12.94□□□□□ -0.34
PRP2P20095 SAH1YER043C 1350 nt12.94□□□□□ -0.34
PRP2P20095 SHU1YHL006C 453 nt12.85□□□□□ -0.35
PRP2P20095 SSA1YAL005C 1929 nt12.75□□□□□ -0.37
PRP2P20095 ARE1YCR048W 1833 nt12.74□□□□□ -0.37
PRP2P20095 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.68□□□□□ -0.38
PRP2P20095 YJR018WYJR018W 363 nt12.66□□□□□ -0.38
PRP2P20095 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.64□□□□□ -0.39
PRP2P20095 PUN1YLR414C 792 nt12.63□□□□□ -0.39
PRP2P20095 POA1YBR022W 534 nt12.6□□□□□ -0.39
PRP2P20095 SRB2YHR041C 633 nt12.57□□□□□ -0.4
PRP2P20095 PTC2YER089C 1395 nt12.5□□□□□ -0.41
PRP2P20095 RPP2BYDR382W 333 nt12.47□□□□□ -0.41
PRP2P20095 YJR120WYJR120W 351 nt12.45□□□□□ -0.42
PRP2P20095 WWM1YFL010C 636 nt12.43□□□□□ -0.42
PRP2P20095 BUD23YCR047C 828 nt12.42□□□□□ -0.42
PRP2P20095 YOR139CYOR139C 393 nt12.42□□□□□ -0.42
PRP2P20095 SPT5YML010W 3192 nt12.37□□□□□ -0.43
PRP2P20095 MNP1YGL068W 585 nt12.35□□□□□ -0.43
PRP2P20095 YGR021WYGR021W 873 nt12.35□□□□□ -0.43
PRP2P20095 NPL3YDR432W 1245 nt12.33□□□□□ -0.44
PRP2P20095 HOM6YJR139C 1080 nt12.31□□□□□ -0.44
PRP2P20095 BSC6YOL137W 1494 nt12.28□□□□□ -0.44
PRP2P20095 NAB2YGL122C 1578 nt12.26□□□□□ -0.45
PRP2P20095 FPR4YLR449W 1179 nt12.25□□□□□ -0.45
PRP2P20095 BDH2YAL061W 1254 nt12.2□□□□□ -0.46
PRP2P20095 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.17□□□□□ -0.46
PRP2P20095 INM2YDR287W 879 nt12.15□□□□□ -0.46
PRP2P20095 DAL1YIR027C 1383 nt12.15□□□□□ -0.46
PRP2P20095 RKM5YLR137W 1104 nt12.14□□□□□ -0.47
PRP2P20095 YOL037CYOL037C 354 nt12.13□□□□□ -0.47
PRP2P20095 YBL100CYBL100C 315 nt12.12□□□□□ -0.47
PRP2P20095 FIS1YIL065C 468 nt12.1□□□□□ -0.47
PRP2P20095 SSA4YER103W 1929 nt12.07□□□□□ -0.48
PRP2P20095 PHO4YFR034C 939 nt12.04□□□□□ -0.48
PRP2P20095 LSM3YLR438C-A 270 nt12.04□□□□□ -0.48
PRP2P20095 TRM9YML014W 840 nt11.99□□□□□ -0.49
PRP2P20095 FUN26YAL022C 1554 nt11.96□□□□□ -0.49
PRP2P20095 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.91□□□□□ -0.5
PRP2P20095 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.91□□□□□ -0.5
PRP2P20095 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.91□□□□□ -0.5
PRP2P20095 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.91□□□□□ -0.5
PRP2P20095 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.91□□□□□ -0.5
PRP2P20095 PUS2YGL063W 1113 nt11.85□□□□□ -0.51
PRP2P20095 Q0182Q0182 405 nt11.84□□□□□ -0.51
PRP2P20095 YLR281CYLR281C 468 nt11.83□□□□□ -0.52
PRP2P20095 WHI5YOR083W 888 nt11.82□□□□□ -0.52
PRP2P20095 ALF1YNL148C 765 nt11.81□□□□□ -0.52
PRP2P20095 CCT6YDR188W 1641 nt11.78□□□□□ -0.52
PRP2P20095 BDF1YLR399C 2061 nt11.75□□□□□ -0.53
PRP2P20095 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.71□□□□□ -0.53
PRP2P20095 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.71□□□□□ -0.53
PRP2P20095 YPS1YLR120C 1710 nt11.7□□□□□ -0.54
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