Protein–RNA interactions for Protein: Q03954

SPC19, DASH complex subunit SPC19, yeastyeast

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC19Q03954 NSR1YGR159C 1245 nt18.36■□□□□ 0.53
SPC19Q03954 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.29■□□□□ 0.52
SPC19Q03954 NOP1YDL014W 984 nt17.71■□□□□ 0.43
SPC19Q03954 MDJ1YFL016C 1536 nt16.55■□□□□ 0.24
SPC19Q03954 YKL036CYKL036C 393 nt16.04■□□□□ 0.16
SPC19Q03954 SRX1YKL086W 384 nt15.4■□□□□ 0.06
SPC19Q03954 YJL027CYJL027C 417 nt15.32■□□□□ 0.04
SPC19Q03954 Q0297Q0297 156 nt15.31■□□□□ 0.04
SPC19Q03954 YCR051WYCR051W 669 nt14.64□□□□□ -0.07
SPC19Q03954 DBP2YNL112W 1641 nt14.43□□□□□ -0.1
SPC19Q03954 SCS3YGL126W 1143 nt14.4□□□□□ -0.1
SPC19Q03954 YBR190WYBR190W 312 nt14.2□□□□□ -0.14
SPC19Q03954 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.06□□□□□ -0.16
SPC19Q03954 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.06□□□□□ -0.16
SPC19Q03954 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.06□□□□□ -0.16
SPC19Q03954 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.06□□□□□ -0.16
SPC19Q03954 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.06□□□□□ -0.16
SPC19Q03954 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.06□□□□□ -0.16
SPC19Q03954 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.06□□□□□ -0.16
SPC19Q03954 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.06□□□□□ -0.16
SPC19Q03954 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.06□□□□□ -0.16
SPC19Q03954 CCC1YLR220W 969 nt13.97□□□□□ -0.17
SPC19Q03954 RTC3YHR087W 336 nt13.95□□□□□ -0.18
SPC19Q03954 Q0182Q0182 405 nt13.88□□□□□ -0.19
SPC19Q03954 YOL085CYOL085C 342 nt13.83□□□□□ -0.2
SPC19Q03954 RPP1BYDL130W 321 nt13.76□□□□□ -0.21
SPC19Q03954 RVS167YDR388W 1449 nt13.73□□□□□ -0.21
SPC19Q03954 PKP1YIL042C 1185 nt13.68□□□□□ -0.22
SPC19Q03954 SCJ1YMR214W 1134 nt13.43□□□□□ -0.26
SPC19Q03954 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.22□□□□□ -0.29
SPC19Q03954 PET122YER153C 765 nt13.16□□□□□ -0.3
SPC19Q03954 SHR5YOL110W 714 nt13.1□□□□□ -0.31
SPC19Q03954 SCR1SCR1 522 nt13.06□□□□□ -0.32
SPC19Q03954 SSA3YBL075C 1950 nt13.02□□□□□ -0.32
SPC19Q03954 PUT4YOR348C 1884 nt13.02□□□□□ -0.33
SPC19Q03954 MOT3YMR070W 1473 nt12.92□□□□□ -0.34
SPC19Q03954 URN1YPR152C 1398 nt12.9□□□□□ -0.34
SPC19Q03954 DEP1YAL013W 1218 nt12.81□□□□□ -0.36
SPC19Q03954 YDJ1YNL064C 1230 nt12.8□□□□□ -0.36
SPC19Q03954 ATS1YAL020C 1002 nt12.79□□□□□ -0.36
SPC19Q03954 RPN10YHR200W 807 nt12.75□□□□□ -0.37
SPC19Q03954 RRN5YLR141W 1092 nt12.75□□□□□ -0.37
SPC19Q03954 OPI9YLR338W 858 nt12.75□□□□□ -0.37
SPC19Q03954 SAH1YER043C 1350 nt12.71□□□□□ -0.37
SPC19Q03954 ARE1YCR048W 1833 nt12.7□□□□□ -0.38
SPC19Q03954 POA1YBR022W 534 nt12.64□□□□□ -0.39
SPC19Q03954 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.63□□□□□ -0.39
SPC19Q03954 YNL208WYNL208W 600 nt12.61□□□□□ -0.39
SPC19Q03954 GAR1YHR089C 618 nt12.57□□□□□ -0.4
SPC19Q03954 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.48□□□□□ -0.41
SPC19Q03954 RSB1YOR049C 1065 nt12.47□□□□□ -0.41
SPC19Q03954 PUN1YLR414C 792 nt12.43□□□□□ -0.42
SPC19Q03954 BSC6YOL137W 1494 nt12.42□□□□□ -0.42
SPC19Q03954 SSA1YAL005C 1929 nt12.42□□□□□ -0.42
SPC19Q03954 BUD23YCR047C 828 nt12.36□□□□□ -0.43
SPC19Q03954 YJR018WYJR018W 363 nt12.3□□□□□ -0.44
SPC19Q03954 PTC2YER089C 1395 nt12.28□□□□□ -0.44
SPC19Q03954 NAB2YGL122C 1578 nt12.18□□□□□ -0.46
SPC19Q03954 TIR1YER011W 765 nt12.16□□□□□ -0.46
SPC19Q03954 RPP2BYDR382W 333 nt12.06□□□□□ -0.48
SPC19Q03954 FPR4YLR449W 1179 nt11.98□□□□□ -0.49
SPC19Q03954 DAL1YIR027C 1383 nt11.96□□□□□ -0.49
SPC19Q03954 FIS1YIL065C 468 nt11.92□□□□□ -0.5
SPC19Q03954 INM2YDR287W 879 nt11.91□□□□□ -0.5
SPC19Q03954 YJR120WYJR120W 351 nt11.91□□□□□ -0.5
SPC19Q03954 PST2YDR032C 597 nt11.85□□□□□ -0.51
SPC19Q03954 PHO4YFR034C 939 nt11.84□□□□□ -0.51
SPC19Q03954 SPT5YML010W 3192 nt11.82□□□□□ -0.52
SPC19Q03954 YBL100CYBL100C 315 nt11.76□□□□□ -0.53
SPC19Q03954 BDH2YAL061W 1254 nt11.68□□□□□ -0.54
SPC19Q03954 FPS1YLL043W 2010 nt11.68□□□□□ -0.54
SPC19Q03954 MEP2YNL142W 1500 nt11.67□□□□□ -0.54
SPC19Q03954 SSA4YER103W 1929 nt11.66□□□□□ -0.54
SPC19Q03954 YPS1YLR120C 1710 nt11.66□□□□□ -0.54
SPC19Q03954 SRB2YHR041C 633 nt11.65□□□□□ -0.54
SPC19Q03954 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.65□□□□□ -0.54
SPC19Q03954 YDR095CYDR095C 411 nt11.57□□□□□ -0.56
SPC19Q03954 FUN26YAL022C 1554 nt11.57□□□□□ -0.56
SPC19Q03954 ALF1YNL148C 765 nt11.56□□□□□ -0.56
SPC19Q03954 WWM1YFL010C 636 nt11.55□□□□□ -0.56
SPC19Q03954 TRM9YML014W 840 nt11.55□□□□□ -0.56
SPC19Q03954 YGR021WYGR021W 873 nt11.49□□□□□ -0.57
SPC19Q03954 LSM3YLR438C-A 270 nt11.48□□□□□ -0.57
SPC19Q03954 SHU1YHL006C 453 nt11.45□□□□□ -0.58
SPC19Q03954 DCW1YKL046C 1350 nt11.44□□□□□ -0.58
SPC19Q03954 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.42□□□□□ -0.58
SPC19Q03954 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.41□□□□□ -0.58
SPC19Q03954 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.41□□□□□ -0.58
SPC19Q03954 YMR090WYMR090W 684 nt11.41□□□□□ -0.58
SPC19Q03954 RPM1RPM1 483 nt11.4□□□□□ -0.58
SPC19Q03954 CCT6YDR188W 1641 nt11.38□□□□□ -0.59
SPC19Q03954 RPP2AYOL039W 321 nt11.38□□□□□ -0.59
SPC19Q03954 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.37□□□□□ -0.59
SPC19Q03954 EMI2YDR516C 1503 nt11.35□□□□□ -0.59
SPC19Q03954 HOM6YJR139C 1080 nt11.34□□□□□ -0.59
SPC19Q03954 YKL097CYKL097C 411 nt11.34□□□□□ -0.59
SPC19Q03954 SIS1YNL007C 1059 nt11.26□□□□□ -0.61
SPC19Q03954 BDF1YLR399C 2061 nt11.25□□□□□ -0.61
SPC19Q03954 MNP1YGL068W 585 nt11.25□□□□□ -0.61
SPC19Q03954 YDL221WYDL221W 552 nt11.24□□□□□ -0.61
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